اگرچه تلخ و ناگوار است ولی متاسفانه واقعیت دارد که موسسه تنظیم و نشر آثار امام خمینی(ره) نه فقط به تدریج از راه و خط مبارک حضرت امام(ره) فاصله گرفته، بلکه در موارد فراوانی نیز به کانون مقابله با مواضع و نظرات آن بزرگوار تبدیل شده است. با یک بررسی گذرا به آسانی می توان دید زاویه انحراف این موسسه از بستر تعریف شده خط امام(ره) و شتاب استحاله آن نگران کننده است و چنانچه جناب حجت الاسلام والمسلمین سیدحسن خمینی که مدیریت عالی موسسه را برعهده دارد هر چه زودتر به یک پالایش جدی و خانه تکانی اساسی در این مرکز دست نزنند، آینده پیش روی موسسه یاد شده به یقین فاجعه آمیز و پشیمان کننده خواهد بود.