اعتماد|انتخاب وزیر برای تصدی وزارت علوم در همان ابتدای گمانه زنی ها درباره وزرای احتمالی دولت روحانی، با سرمقاله حسین شریعتمداری در روزنامه کیهان حاشیه و حساسیت بیشتری نسبت به وزارتخانه های دیگر پیدا کرد. جعفر توفیقی، محتمل ترین گزینه تصدی وزارت علوم با فضایی که از روزنامه کیهان شروع شد و به خطبه های نماز جمعه رسید، کنار گذاشته شد تا نهایتا جعفر میلی منفرد در آخرین روزها به عنوان گزینه پیشنهادی روحانی معرفی شود. پررنگ ترین سابقه حضور میلی منفرد در وزارت علوم، حضور او به عنوان سرپرست این وزارتخانه در زمان حساسی است که مصطفی معین