نایب رئیس مجلس با اشاره به حواشی به وجود آمده در مورد رد فوریت طرح شفافیت آرای نمایندگان گفت که رد فوریت یک طرح به معنی مخالفت مجلس با آن طرح نیست اما در عین حال با اشاره به مخالفت خود با این امر گفت که ممکن است این امر موجب تضییع حق نماینده به موجب نظارت استصوابی شود. علی مطهری در یادداشتی با عنوان «درباره شفافیت آرای نمایندگان» که توسط ایسنا منتشر شد، نوشت: «رد یک فوریت طرح شفاف سازی آرای نمایندگان مجلس این سوال را در میان برخی افرادی که جلسات مجلس را دنبال می کنند، پدید آورده است که چگونه طرحی که بیش از 200 نفر از نمایندگان در رسانه ها از آن حمایت کردند، فوریت آن رای نیاورد؟ پاسخ این است که اولا رای نیاوردن فوریت یک طرح به معنی مخالفت مجلس با آن طرح نیست و ممکن است بعد از آنکه به صورت عادی در کمیسیون مربوط بررسی و گزارش آن به صحن آمد، تصویب شود. ثانیا بهتر بود نمایندگان مخالف این طرح مخالفت خود را در رسانه ها اعلام می کردند تا این توقع در جامعه ایجاد نشود.»

وی افزود: «اما این روزها از اینجانب نیز نظرم را درباره این طرح سوال می کنند. در پاسخ می گویم من با شفافیت حضور و غیاب ها و سفرهای نمایندگان و مانند اینها موافقم اما با شفافیت آرای آنها موافق نیستم زیرا جامعه امروز ما هنوز رشد لازم را در این زمینه پیدا نکرده است. اگر آرای نمایندگان به طرح ها و لوایح اعلام عمومی شود، نماینده در حوزه انتخابیه خود مورد آزار و اذیت گروه های فشار قرار می گیرد یا به موجب نظارت استصوابی حق او در انتخابات بعدی ضایع می شود».