به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « Genetic trend » در نشریات گروه « علوم دام »

تکرار جستجوی کلیدواژه « Genetic trend » در نشریات گروه « کشاورزی »
  • Nibo Beneberu*

    The data collected from 1986 to 2019 at Adea-Berga Jersey herd improvement farm was used to estimate genetic parameters for reproductive traits (age at first service (AFS), age at first calving (AFC), calving interval (CI), days open (DO) and the number of services per conception (NSPC)). The traits were estimated by using WOMBAT software. Univariate analysis was undertaken for each trait for the estimation of parameters (heritability, repeatability, and breeding values) and genetic and phenotypic correlations were estimated with bivariate analysis. The direct heritability estimates for AFS, AFC, CI, DO and NSPC were 0.05±0.08, 0.05±0.05, 0.03±0.02, 0.04±0.02 and 0.001±0.02, respectively. Low direct heritability estimates for the reproductive trait in this study indicate that improvements of the traits are possible through management rather than through genetic selection. The repeatability of CI, DO and NSPC were 0.09±0.02, 0.08±0.02, and 0.05±0.02, respectively. The genetic correlations between reproductive traits varied from -0.10±00 to 1.00±0.11 while the values of phenotypic correlation were found ranging from 0.03±0.04 to 0.98±0.00. The positive direct genetic correlations among traits in the present study indicated that the selection of one trait might improve the other trait. The average breeding values for AFS, AFC, CI, DO and NSPC were -0.00948 months, 0.02269 months, -1.13339 days, -3.00389 days, and -0.00021, respectively. The negative breeding values for reproductive traits tend to be associated with below-average performance. In conclusion, improvement of management (feeding, disease climate control, etc.) should be implemented to improve the reproductive traits of the pure Jersey cattle population. Selection and breeding using worldwide sire semen in the farm also creates genetic variability within the herd and improves heritability, genetic correlations among reproductive traits, and breeding values.

    Keywords: Breeding value, genetic parameters, genetic trend, pure Jersey cows, reproductive traits}
  • محمدباقر زندی باغچه مریم*، هادی احمدی، محمد طاهر هرکی نژاد، مسعود خلیلی، معین تاند

    هدف از این پژوهش، آنالیز ژنتیکی و فنوتیپی برخی صفات عملکردی در اسب های کورسی ایران بود. از اطلاعات صفات عملکردی اسب های کورسی نژاد تروبرد، ترکمن، دوخون (آمیخته بین تروبرد و ترکمن) و عرب که از سال 1385 الی 1394 در معاونت اسب دوانی فدراسیون سوارکاری کشور ثبت شده بودند، استفاده شد. برازش مدل با استفاده از نرم افزار SAS و R انجام شد و شجره توسط نرم افزار CFC تهیه و نظیم شد. پارامترهای ژنتیکی با روش حداکثر درست نمایی محدود شده (REML) و با استفاده از نرم افزار ASReml برآورد شد. وراثت پذیری صفت زمان برای اسب های دوخون در مسافت های 1000، 1500+ و 1600+ متر به ترتیب در محدوده 19/0 تا 28/ 0 و و برای تروبرد در محدوده 0/16 تا 0/35 براورد شد و برای نژاد اسب عرب درمسافت های 1000 و 1500+ متر به ترتیب وراثت پذیری 0/25 و 0/13، و برای نژاد اسب ترکمن در مسافت های 1000، 1550 و 1600 متر به ترتیب وراثت پذیری 0/35، 0/38 و 0/44 بود . وراثت پذیری صفت رتبه برای اسب های دوخون در محدوده 0/046 تا 0/17، برای تروبرد در محدوده 0/12 تا 0/16، برای عرب 0/024 تا 0/28 و برای ترکمن در محدوده 0/13 تا 0/22 بود. وراثت پذیری صفت مجموع جوایز، برای نژادهای دوخون، ترکمن، تروبرد و عرب به ترتیب 0/20، 0/033، 0/072 و 0/019 برآورد شد. با توجه به وراثت پذیری پایین اغلب صفات عملکردی اسب های کورسی و به منظور بهبود و پیشرفت ژنتیکی از طریق انتخاب بر روی صفات عملکردی، بهتر است اطلاعات عملکردی دقیق تر ثبت شوند.

    کلید واژگان: اسب های کورسی, پارامترهای ژنتیکی, مدل خطی, روند ژنتیکی و REML}
    MohamdBagher Zandi Nagche Maram *, Hadi Ahmadi, MohammadTaher Harkinejhad, Masoud Khalili, Moein Taned
    Introduction

    Horses were breed for war, hunting, Transporting, recreational, and sports purposes (Khalili 2008). The criterion of selection is mainly based on the horse's own and their parents' performances rather than breeding value. Despite of relatively developed organization of horse husbandry in the country and availability of individual racing results for almost all the progeny and pedigree information of horses, the scientific methods are not applied in selection of the animals for improving the racing performance(Bakhtiari & Kashan 2009). Normally the criteria to estimate the racing performance are time traits (Langlois 1980, Tolley et al. 1985, Ekiz et al. 2005), handicap weights (Langlois 1980, Tolley et al. 1985), rank at finish (Chico 1994, Sobczynska and Lukaszewicz, 2003, Ekiz and Kocak 2005) and earning (Langlois 1980, Ekiz and Kocak 2005). Breeders have traditionally combined information from time trials and races with pedigree evaluations to select potential racing stock, but this evaluation has primarily been based on a subjective synthesis of available information. Although the Standardbred horse is extensively performance tested before selection of breeding stock, studies of the genetic and environmental factors that influence racing performance must be completed before specific selection criteria can be recommended to the industry (Tolley et al. 1983). Racing ability is the main selection criterion in race horses. Breeding value estimation for aspects of racing ability has been carried out following performance tests in many European countries(Àrnason et al. 1994). Traits such as rank, time, prize, etc. are used to estimate the genetic and phenotypic parameters of race horses(Sobczynska & Lukaszewicz 2004). Genetic parameters estimation of racing performance traits is important in breeding programs, therefore, appropriate methods should be used. This study aimed to estimate the genetic parameters of racing performance using a linear model in different breeds of Iranian race horses and estimation of their genetic and phenotypic trends. The result of this study would be used for designing a breeding program for Iranian race horses.

    Material and methods

    In this study, the performance records of Iranian horse breeds, including Thoroughbred, Crossbreed, Turkmen, and Arabian horse breeds from the horse racing club of the Iranian Equestrian Federation between 2006 to 2014 were used. Performance traits in this study include 1.Racing Time, 2.rank at the Finish, 3.Cumulative Earning, 4.Number of Places, and 5.Number of races. Data were collected and adjusted using Excel software and R scripts. The quality controls included outliers deletion and preparing records for statistical analysis. CFC software (Sargolzaei et al. 2006) was used to survey the structure of the pedigree. For fitting the appropriate model the significant effects were investigated and was applied by SAS software. Variance components and genetic parameters were estimated by the restricted maximum likelihood method for a single trait animal model using ASReml software. A genetic trend is a compilation of average EBV per generation and indicates the direction of change across generations. It is often visualized in a graph and is useful to check whether there are unexpected deviations from linearity, e.g. due to a selection limit. The genetic trend in the racing performance was estimated by calculating the linear regression of average breeding values within birth years on the birth year.

    Results and discussion

    The heritability of finish time at races for Crossbreed and Thoroughbred horses in 1000, +1500, and +1600 distances were estimated in the range of (0.19-0.29) and (0.36-0.45), respectively, and it was 0.25 and 0.13 respectively for the Arabian horse breed in 1000 and +1500 distance, and it was 0.35, 0.38, and 0.44, respectively for the Turkmen horse breed in 1000, 1550 and 1600 distance. The heritability of the rank was in the range of (0.046-0.17), (0.12-0.16), (0.24-0.28) 0), and (0.13-0.22) based on the linear model (Animal model), respectively for Crossbreed, Thoroughbred, Arabian, and Turkmen horse breed. The heritability of the cumulative earning was 0.20, 0.072, 0.019, and 0.033 respectively for the Crossbreed, Thoroughbred, Arabian, and Turkmen horse breeds. The repeatability of finish time for Crossbreed and Thoroughbred in 1000, +1500, and +1600 distance were estimated in the range of (0.38-0.59) and (0.40-0.52), respectively. Also, it was 0.64 and 0.54 respectively for the Arabian horse breed in 1000 and +1500 distance and were 0.60, 0.67, and 0.59, respectively for Turkmen horse breed in 1000, 1550 and 1600 distance meters. The repeatability of the rank was in the range of, (0.14-0.19), (0.13-0.17), (0.2-0.40), and (0.13-0.30), respectively for Crossbreed, Thoroughbred, Arabian, and Turkmen horse breed. The genetic trend of this trait for Crossbreed and Thoroughbred in 1000, +1500, and +1600 distances were estimated in the range of (-0.0629 to -0.0173) and (-0.0384 to -0.0236), respectively. Also, the genetic trend were 0.0372 and -0.0335 respectively for Arabian horse breed in 1000 and +1500 distance and were 0.0104, 0.587, and -0.0462, respectively for Turkmen horse breed in 1000, 1550, and 1600 distance. These results showed an inconsistency between this study and other research (references) due to the number of data, environmental and managerial factors such as the experience of horses in the race, and the type of equipment and tools involved in the competition. Regarding the low estimated heritability of some performance traits in this study, genetic progress through indirect selection will be more usefulness than direct selection on these traits. As the application of modern genetic selection methodologies continues to gain popularity in the racing industry, contemporary heritability estimates from the current population of Thoroughbred, Crossbreed, Turkmen, and Arabian horse breeds will play a vital role in identifying which traits are better suited to selection and in the development of more accurate genomic evaluations for racing performance.

    Keywords: Race horses, Genetic parameters, Linear Model, Genetic trend, REML}
  • مصطفی مدد جیرهنده، جلیل شجاع، صادق علیجانی*، سید عباس رافت، جک دکرز

    در این تحقیق به منظور برآورد پارامترهای ژنتیکی و روند ژنتیکی صفات وزن بدن از اطلاعات 19171 راس گاو گوشتی نژاد سیمنتال آمریکا شامل 8758 راس گاو نر و 10413 راس گاو ماده مربوط به سال های 1378 تا 1394 استفاده شد. از تعداد 5199، 10926، 7362 و 5636 راس گاو ژنوتیپ شده بر اساس نشانگرهای SNP به ترتیب برای ارزیابی ژنتیکی صفات وزن تولد، وزن شیرگیری، وزن یک سالگی و افزایش وزن پس از شیر گیری تا یک سالگی استفاده شد. پارامترهای ژنتیکی با استفاده از مدل حیوانی تک صفتی و دو صفتی و به کمک نرم افزار BLUPf90  برآورد شد. در آنالیز تک صفتی وراثت پذیری وزن تولد، وزن شیرگیری، وزن یک سالگی و افزایش وزن پس از شیرگیری تا یک سالگی به ترتیب 0/02 ± 0/38 ، 0/01 ± 0/24، 0/01 ± 0/35 و 0/02 ± 0/22 برآورد شد. همبستگی ژنتیکی وزن تولد با افزایش وزن پس از شیرگیری تا یک سالگی 0/31 به دست آمد. بیشترین صحت پیش بینی ژنومی مریوط به وزن شیرگیری (0/68) و کمترین آن مربوط به افزایش وزن پس از شیرگیری تا یکسالگی (0/27) برآورد شد. روند ژنتیکی وزن تولد، وزن شیرگیری، وزن یک سالگی و افزایش وزن پس از شیرگیری تا یک سالگی به ترتیب 0/13، 0/28، 3/43 و 0/05 کیلوگرم در سال بدست آمد. علاوه براین، نوسانات اندکی در روند ژنتیکی تمامی صفات به ویژه وزن شیرگیری و وزن یکسالگی طی سال های مورد بررسی مشاهده شد که نشان از وجود اهداف و معیار انتخاب مشخص در هر یک از این صفات می باشد. همچنین، در مجموع سهQTL  با اثر عمده روی کروموزوم های شش در موقعیت 37 میلیون باز، کروموزوم هفت در موقعیت 90 میلیون باز و کروموزوم چهارده در موقعیت 22 میلیون باز شناسایی شد. با توجه به همبستگی مطلوب صفات وزن بدن، برنامه اصلاح نژادی بایستی بر اساس انتخاب همزمان برای صفات مذکور از طریق یک شاخص انتخاب صورت گیرد.

    کلید واژگان: انتخاب ژنومی, پارامترهای ژنتیکی, روش تک مرحله ای, روند ژنتیکی, صحت ژنومی}
    Mostafa Madad Jirhandeh, Jalil Shodga, Sadegh Alijani*, Seyed Abbas Rafat, Jack Dekkers

    In this study, body weight records of 19171 American Simmental beef cattle including 8758 bull and 10413 cows from 2000 to 2016 were used to estimate genetic parameters and trend. We conducted genetic evaluation of data from 5199, 10926, 7362 and 5636 genotyped beef cattle of gene-based single nucleotide polymorphisms (SNPs) for birth weight (BW), weaning weight direct (WWD), yearling weight (YW) and post-weaning weight gain (PWG), respectively. Genetic parameters estimated using univariate and bivariate animal models and BLUPf90 software. Heritabilities were estimated for BW, WW, YW and PWG 0.38 ± 0.02, 0.24 ± 0.01, 0.35 ± 0.01 and 0.22 ± 0.02 using univariate analysis, respectively. Genetic correlation between BW and PWG was 0.31. The highest and the lowest genomic accuracy were estimated for WWD (0.68) and PWG (0.27), respectively. Genetic trends were estimated for BW, WW, YW and PWG 0.13, 0.28, 3.43 and 0.05, respectively. In addition, slight changes were observed in the genetic trend of all traits, especially weaning weight direct and yearling weight across years of study which indicates the existence of specific selection goals and criteria in each of these traits. In general, three large-effect closely linked QTLs identified on BTA6 at 37 Mb, on BTA7 at 90 Mb and on BTA14 at 22 Mb. Because correlations were favorable between body weight traits, breeding program should be based on the simultaneous selection of these traits through the selection index.

    Keywords: Genomic selection, Genomic Accuracy, Genetic parameters, Genetic trend, Single step method}
  • مریم رضایی*، مرادپاشا اسکندری نسب
    هدف از انجام این مطالعه برآورد روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات رشد در گوسفندان مغانی بود. برای انجام این پژوهش از تعداد 21423 رکورد مربوط به صفات رشد بره های مغانی که طی سال های 1374 تا 1389 در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند مغانی جمع آوری شده بود، استفاده شد. جهت تعیین عوامل محیطی موثر بر این صفات از نرم افزار آماری 9.1 SAS استفاده شد. مولفه های واریانس و پارامترهای ژنتیکی با روش حداکثر درست نمایی محدود شده در قالب مدل حیوانی و به صورت تجزیه تک صفتی و با استفاده از نرم افزار wombat برآورد شدند. ارزش اصلاحی دام ها با استفاده از بهترین مدل دام تک صفتی برآورد شد. عوامل محیطی سال تولد، جنس بره، گله، تیپ تولد و سن مادر هنگام زایش بر این صفات معنی دار بودند. روندها به صورت تابعیت میانگین مقادیر فنوتیپی و ژنتیکی براساس سال تولد محاسبه شدند. روند ژنتیکی مستقیم برای وزن تولد، شیرگیری، شش ماهگی، نه ماهگی و یک سالگی به ترتیب 1 ±6، 1±8 ،6±8، 5±11، 5±86 گرم در سال و روند فنوتیپی برای صفات مذکور به ترتیب برابر  1±30، 1±116، 6±37، 5 ±342-، 5 ±43- گرم در سال برآورد شدند. نتایج حاصل نشان می دهد که قبل از هر اقدامی بایستی شرایط محیطی و بهینه برای بروز هر چه بیش تر پتانسیل ژنتیکی گله فراهم شود تا روند ژنتیکی و فنوتیپی گله هم جهت شود.
    کلید واژگان: گوسفند مغانی, ارزش اصلاحی, روند ژنتیکی, روند فنوتیپی و صفات رشد}
    Maryam Rezaei *, Moradpasha Eskandarinasab
    The objective of this study was estimate of the genetic and phenotypic trends of growth traits in Moghani sheep. In this study, a total of 21,423 records of growth traits belong to Moghani lambs that collected by raising and breeding of Moghani sheep station between 2003 and 2010, was used. The SAS 9.1 statistical software was used to evaluate the effect of environmental factors. Variance components and genetic parameters were estimated using restricted maximum procedure and univariate animal model and with wombat software. Animal breeding value of were estimated using the best univariate animal model. Environmental factors, like birth year, sex, herd, type of birth, and the age of mother are the significant factors as fixed effects. Estimation of direct genetic trend for birth weight, weaning weight, 6 month weight, 9 month weight and 12 month weight were as 6±1, 8±1.5, 8±6, 11±5 and 86±5 gr per year, respectively. The phenotypic trend for mentioned traits was estimated 30±1, 116±1, 37±6, -342±5 and -43±5 gr per year, respectively. The results showed that before designing any breeding program, optimum environmental condition must be prepared for appearance of maximum genetic potential, so phenotypic and genetic trends will be desirable in the herd.
    Keywords: Moghani Sheep, Phenotype trend, Genetic trend, Growth trait}
  • علیرضا شاطری، محمد رکوعی*، غلامرضا داشاب، احمد مقیمی اسفندآبادی، هادی فرجی آروق

    سابقه و هدف:

     صحت برآوردهای مولفه های واریانس و کواریانس برای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات تولیدمثلی پیش نیاز طراحی راهبردهای اصلاحی موثر می باشد. برای پیش بینی واقعی تر ارزش های اصلاحی رکوردهای فنوتیپی سال های مختلف، گروه بندی ژنتیکی پیشنهاد شد. با توجه به وجود اطلاعات نامعلوم در شجره گاوهای هلشتاین ایران، در نظر گرفتن گروه بندی ژنتیکی برای حیوانات با والدین نامعلوم ضروری به نظر می رسد. بنابراین، تحقیق حاضر به منظور برآورد پارامترهای ژنتیکی، روند ژنتیکی و صحت ارزش های اصلاحی برآورد شده برخی صفات تولید مثلی (فاصله بین زایش تا اولین تلقیح، فاصله اولین تلقیح تا تلقیح منجر به آبستنی و فاصله زایش) گاوهای هلشتاین ایران با در نظر گرفتن گروه بندی ژنتیکی برای حیوانات با والدین نامعلوم انجام شد.

    مواد و روش ها

    از اطلاعات مربوط به زایش و تلقیح سه شکم اول زایش 3361 گله هلشتاین ایران که توسط مرکز اصلاح نژاد دام کشور بین سال های 1360 تا 1392 جمع آوری شده بود، مورد استفاده قرار گرفت. حیوانات با والدین نامعلوم براساس سال تولد و جنس گروه بندی شده و صفات توسط دو مدل با (مدل 2) و بدون (مدل 1) گروه بندی ژنتیکی تجزیه و تحلیل شدند. با استفاده از معیار اطلاعات بیزی و معیار اطلاعات آکاییک، مدل بهتر از بین دو مدل حیوانی بالا برای همه صفات مشخص گردید. از همبستگی رتبه ای اسپیرمن برای بررسی تغییر رتبه بندی حیوانات با در نظر گرفتن گروه بندی ژنتیکی استفاده شد. صحت ارزش های اصلاحی و روند ژنتیکی با استفاد از دو مدل برآورد شده و مورد مقایسه قرار گرفت. آماده سازی داده ها و محاسبات آماری با نرم افزار R و واکاوی ژنتیکی با نرم افزار ASReml انجام شد.

    یافته ها

    مقدار ورایانس و معیار خطا ژنتیک افزایشی در مدل 2 پایین تر از مدل 1 و برای واریانس باقیمانده برعکس بود اما تفاوت معنی داری بین مقادیر دو مدل وجود نداشت. براساس معیارهای برازش نکویی مدل، مدل 2 بهترین مدل برای تمامی صفات انتخاب شد. مقدار وراثت پذیری صفات فاصله زایش و فاصله زایش تا اولین تلقیح با استفاده از مدل 2 پایین تر (غیرمعنی دار) از مدل 1 برآورد گردید. مقدار وراثت پذیری برای همه صفات تولیدمثلی توسط دو مدل پایین تر از 05/0 بدست آمد. رتبه بندی بهترین گاوهای نر و ماده در اثر گروه بندی ژنتیکی تغییر کرد. صحت برآوردهای ارزش های اصلاحی بدست آمده برای تمامی صفات در همه زایش ها در مدل 2 بالاتر از از مدل 1 بود و از لحاظ آماری تفاوت معنی داری را نشان داد (001/0 >P). روند ژنتیکی تمامی صفات (به استثنای صفت فاصله اولین تلقیح تا تلقیح منجر به آبستنی در گوساله زایی اول و سوم) حاصل از مدل 1 و 2 مثبت برآورد گردید و مقادیر برآورد شده بین دو مدل متفاوت از هم بود.

    نتیجه گیری

    نتایج نشان داد که در نظر گرفتن گروه بندی ژنتیکی برای تجزیه و تحلیل صفات تولیدمثلی گاوهای هلشتاین ایران و پیش بینی صحیح شایستگی حیوانات ضروری به نظر می رسد.

    کلید واژگان: صحت ارزش اصلاحی, فاصله زایش, وراثت پذیری, روند ژنتیکی}
    AliReza Shateri, GholamReza Dashab, Ahmad Moghimi Esfand Abadi, Hadi Faraji Arough
    Background and objectives

    The estimate variance components with a satisfying accuracy of important economic traits such as reproductive traits is a prerequisite for designing breeding strategies. Genetic grouping was suggested in order to predict breeding values of phenotypic records in different years with high accuracy. As there is unknown information in the pedigree of Holstein dairy cows in Iran, genetic group animal models with unknown parents seem necessary. Therefore, the present study was conducted to estimate the genetic parameters, genetic trend and accuracy of estimated breeding values of some reproductive traits (i.e. calving to first service (CTFS), first service to conception (FSTC) and calving interval (CI)) in dairy cows with considering genetic grouping for animals with unknown parents.

    Materials and methods

    Information on calving and insemination dates of the first three calving periods from 3361 herds of the Iranian Holstein, collected by the Animal Breeding Center of Iran during 1981 to 2013 was used. Animals with unknown parents were grouped based on the year of birth and sex and the traits were analyzed using two models, with (model 2) or without genetic grouping (model 1). The model with the lowest Bayesian information criterion (BIC) and the Akaic information criterion (AIC) is considered the best model. Spearman's rank correlation coefficient was used to change in animal rank by considering the genetic grouping. The accuracy of estimated breeding values and genetic trend of the traits was estimated using two models and was compared. Preparation of data for statistical and genetic analysis were carried out using R-software and ASReml software, respectively.

    Results

    The amount of variance and the standard error of additive variance in model 2 was lower than model 1 and for the residual variance was conversely, but there was no significant difference between the values of the two models. Model 2 was selected the best model for all studied traits based on the goodness of fit criteria. Heritability of CI and CTFS using model 2 was estimated lower (non-significant) than model 1. The heritability value for all reproductive traits was estimated less than 0.05 by two models. The rank of males and females changed duo to genetic grouping. The accuracy of estimated breeding values (EBVs) for all studied traits in model 2 was significantly higher than model 1 (P <0.001). The genetic trend of all traits (exception of the FSTC in the first and third calving period) was positive by model 1 and 2, and the estimated values between the two models were different.

    Conclusion

    The results of the current study showed that using genetic grouping for reproductive traits analysis of Iranian Holstein cows and accurate prediction of genetic merit of animals seems necessary.

    Keywords: Breeding value accuracy, Calving interval, Genetic trend, Heritability}
  • علی محمدی*، صادق علیجانی، سید عباس رافت، رستم عبدالهی، آرپناهی

    فرآیند تولیدمثل برای پایداری اقتصادی صنعت پرورش گاو شیری بسیار حایز اهمیت است. هدف از این مطالعه، ارزیابی ژنتیکی صفات تولیدمثلی گاوهای شیری و نرخ باروری گاوهای نر بود. از اطلاعات مربوط به صفات تولیدمثلی برای تلسیه ها و گاوهای شکم اول تا سوم (در دامنه ی سنی 21 تا 46 ماه، 30 تا 67 ماه و 42 تا 80 ماه، به ترتیب برای شکم اول، دوم و سوم) در بین سال های 1370 تا 1396 موجود در مرکز اصلاح نژاد و بهبود تولیدات دامی کشور استفاده شد. همچنین اطلاعات مربوط به نرخ باروری گاوهای نر از سایت Council of Dairy Cattle Breeding استخراج شد. تعداد حیوانات موجود در شجره 3452730 بود. صفات مورد بررسی شامل: نرخ باروری گاوهای نر، سن در زمان اولین تلقیح، سن در زمان اولین زایش، روزهای باز، فاصله گوساله زایی، طول دوره آبستنی، نرخ باروری ماده، فاصله بین اولین تا آخرین تلقیح منجر به آبستنی، روزهای بین زایش تا اولین تلقیح و تعداد تلقیح به ازای آبستنی بود. انتخاب معادلات مدل و اثرات ثابت با استفاده از رویه GLM در نرم افزار SAS وآنالیز های ژنتیکی با استفاده از مدل حیوانی انجام شد. کمترین مقدار وراثت پذیری برای صفت فاصله بین اولین تا آخرین تلقیح منجر به آبستنی- تلیسه (002/0) و بیشترین مقدار برای نرخ باروری گاوهای نر (30/0) برآورد گردید. همبستگی های ژنتیکی افزایشی، در محدوده 56/0- (بین صفات طول دوره آبستنی با سن در زمان اولین زایش) تا 83/0 (بین صفات فاصله بین اولین تا آخرین تلقیح منجر به آبستنی با تعداد تلقیح به ازای هر آبستنی) بدست آمد. روند ژنتیکی منفی برای صفات نرخ باروری گاو نر (49/3- %) سن در زمان اولین تلقیح (03/4- روز/سال)، سن در زمان اولین زایش (66/2- روز/سال)، طول دوره آبستنی (07/0- روز/سال) و نرخ باروری ماده (83/0- روز/سال) معنی دار بدست آمد. روند فنوتیپی برای صفات فاصله گوساله زایی، روزهای باز، فاصله بین اولین تا آخرین تلقیح منجر به آبستنی و روزهای بین زایش تا اولین تلقیح نامطلوب بدست آمد.

    کلید واژگان: صفات تولیدمثلی, نرخ باروری گاو نر, وراثت پذیری, روند ژنتیکی}
    Ali Mohammadi *, Sadegh Alijani, Seyed Abbas Rafat, Rostam Abdollahi-Arpanahi
    Introduction

    Fertility is considered an important economic trait in cattle, yet despite its importance, reproductive efficiency of dairy cattle has decreased dramatically in the past decades and is of increasing concern to farmers and the dairy industry (Ghiasi et al. 2011; Pryce et al. 2010). The decline in the reproductive efficiency of dairy cattle has become a challenging problem worldwide. Genetic response for fertility traits is expected to be small due to low heritabilities as shown in many studies. In the past decades, more attention has been placed on milk production in selection programs worldwide, which has caused a decline in female fertility due to the antagonistic genetic relationship between milk production and fertility (Pryce et al. 2010; Toghiani 2012). Therefore, it is necessary to include fertility traits in the breeding programs for improving fertility or stopping its downward genetic trend (Penagaricano et al. 2012). It is well documented that bull fertility is influenced by genetic factors. Semen production traits, such as volume and sperm concentration, were found to have moderate heritabilities (from 0.15 to 0.30), whereas some of the semen quality traits, such as motility and percentage of abnormal sperm, had moderate to high heritabilities (close to 0.60) (Rezende et al. 2018). The objective of this study was to assess genetic parameters for fertility traits in Holstein dairy cows and sire conception rate (SCR) a new phenotypic evaluation of bull fertility.

    Materials and method

    In this study information's related to heifers and cows 1 to 3 parity, 1992 to 2018, by the National Animal Breeding center and promotion of Animal Products of Iran and sire conception rate (SCR) 2008 to 2018, a phenotypic evaluation of bull fertility, has been provided to dairy producers the Council of Dairy Cattle Breeding (CDCB) were used. Traits included: sire conception rate (SCR), age at first service (AFS), age at first calving (AFC), days open (DO), calving interval (CI), gestation length (GL), Pregnancy rate (PR), Interval between first and last insemination (IFL), Days from calving to first service (DFS) and number of services per conception (NS). Edited data included the following: SCR between 7.6 % to -16 %, AFS between 320 and 900 days, AFC between 630 to 1350 days, CI between 300 and 700 days, IFL less than 290, GL between 260 and 290 days, DFS between 20 and 300 days, DO between 40 and 350 days, PR between -28 and 55 and NS between 1 and 10. Select the model equations and fixed effects were optimized using GLM procedure in SAS package. Subsequently, the multi-variate animal model analyses was carried out in order to estimate of direct additive genetic and phenotypic correlations between fertility traits. Estimation of genetic parameters using animal model in REML methodology was done by REMLF90 program.

    Results and Discussion

    Heritability estimates for all fertility traits were low, minimum heritability were estimated for IFL trait by heifers (0.002) and maximum amount for SCR trait (0.303). Heritability were estimated for other fertility traits 0.033, 0.005, 0.052, 0.048, 0.085, 0.108, 0.095, 0.059, 0.031, 0.025, 0.023, 0.017, 0.018, 0.013, 0.009, 0.013, 0.032, 0.028 and 0.018 for AFS, AFC, CI, OD, PR, GL_H, GL, DFS_1, DFS_2, DFS_3, IFL_1, IFL_2, IFL_3, IFL_123, NS_H, NS_1, NS_2 and NS_3, respectively. These estimates are in agreement with the results obtained by Ghiasi et al. (2011) and Rahbar et al. (2016) in Holstein cows. Heritability estimates obtained in this study were larger than the ones obtained by Toghiani Pozveh et al. (2009) for CI, DFS and DO in the previous study of Iranian Holsteins. The heritability estimates obtained for interval traits (DO, CI, and GL) were higher than those obtained for categorical (NS) or binary traits. However interval traits may be affected by management decisions such as the length of the voluntary waiting period or estrus synchronization applied in some farms (Ghiasi et al. 2011). In general, negative and moderate additive genetic and phenotypic correlations estimates were obtained between fertility traits. Estimated additive genetic correlations in the range of -0.56 (between GL and AFC) and 0.83 (between IFL and NS). However, estimated phenotypic correlations in the range of -0.80 (between PR and OD) and 0.85 (between GL and OD). The first one is formed by the traits that measure overall fertility of the cow (i.e. CI, OD and PR) which can be obtained directly from calving dates. In particular, OD and PR showed additive genetic (-0.39) and phenotypic (-0.80) correlation estimates which indicates that these two traits are genetically the same as expected because PR is a linear function of OD. The same results were found by VanRaden et al. (2004) and Ghiasi et al. (2011) in Holstein cattle. The mean breeding values were estimated -0.31 to 0.38, -4.14 to -3.34, -6.70 to -5.64, -0.0435 to -0.0064, -2.20 to -1.93, 9.16 to 10.73, 8.72 to 10.15, 3.29 to 4.21 and 4.34 to 5.84 for SCR, AFC, AFS, GL, PR, CI, OD, IFL DFS, respectively. However, the mean phenotypic values was positive, except SCR (range -0.62 to 0.66). These results were in agreement with reported Aghajari et al. (2015); Ansari-Lari et al. (2009) and Shirmoradi et al. (2010). Were estimated negative genetic trend for SCR (-2.22), AFS (-4.02 %), AFC (-2.66 %), GL (-0.07) and PR (-0.83) traits. Subsequently, for CI, DO, IFL and DFS traits, positive phenotypic trends were obtained. These estimated genetic and phenotypic trend agreed with other reports (Faraji-Arough et al. 2011; Rahbar et al. 2016).

    Conclusion

    Genetic parameters (heritabilities and genetic correlations) have been estimated for fertility traits in heifers and cows and fertility bulls. The results of this study indicated that breeding programs have paid little attention to reproductive traits in Iranian Holstein cows, and therefore it is recommended to pay more attention to these traits in order to improve the performance of Holstein cows. According to the results suggest that the genetic prediction of dairy bull fertility is feasible. This could have a positive effect on the dairy industry, for example, the early culling of bull calves with very low SCR predictions.

    Keywords: Fertility traits, Sire conception rate, Heritability, Genetic trend}
  • یحیی خالقی فرد، محمد رکوعی*، احمد مقیمی اسفند آبادی، هادی فرجی آروق

    منظور کردن گروه بندی ژنتیکی در مدل های ارزیابی می تواند تفاوت های مورد انتظار در ارزش های اصلاحی حیوانات که به دلیل نامعلوم بودن والدین تخمین زده نمی شود را نشان دهد. هدف از مطالعه حاضر برآورد پارامترهای ژنتیکی و روند ژنتیکی صفات تولیدی (تولید شیر، چربی و پروتئین) گاوهای هلشتاین ایران براساس یک مدل حیوانی بدون در نظر گرفتن (مدل 1) و با در نظر گرفتن گروه بندی ژنتیکی (مدل 2) بود. بدین منظور از اطلاعات صفات تولیدی گاوهای هلشتاین سه شکم زایش که توسط مرکز اصلاح نژاد دام کشور تا سال 1392 جمع آوری شده بود، استفاده شد. برای حیوانات با پدر و مادر نامعلوم، گروه بندی ژنتیکی براساس سال و جنس تولد انجام گرفت. تجزیه و تحلیل برای صفات در دوره های شیردهی مختلف با و بدون در نظر گرفتن گروه بندی ژنتیکی انجام شده و روند ژنتیکی محاسبه گردید. برای بررسی تغییر در رتبه بندی حیوانات در نتیجه در نظر گرفتن گروه بندی ژنتیکی از همبستگی رتبه ای اسپیرمن استفاده شد. نتایج نشان داد که در نظر گرفتن گروه ژنتیکی در مدل باعث کاهش واریانس ژنتیک افزایشی و وراثت پذیری تمامی صفات شد. رتبه بندی حیوانات با منظور کردن گروه بندی ژنتیکی تغییر کرده و این تغییر برای 10 درصد بهترین نرها نسبت به کل حیوانات، کل نرها و ماده ها بیشتر بود. روند ژنتیکی و صحت برآوردهای ارزش اصلاحی بین دو مدل 1 و 2 دارای تفاوت معنی دار بود. مدل 2 ارزش های اصلاحی با صحت بالاتری و همچنین روند ژنتیکی بیشتری نسبت به مدل 1 داشت. نتایج نشان داد که افزودن گروه بندی ژنتیکی برای داده هایی با والدین نامعلوم باعث برآورد دقیق تر ارزش اصلاحی می شود.

    کلید واژگان: روند ژنتیکی, گروه بندی ژنتیکی, هلشتاین, همبستگی اسپیرمن}
    Yahya Kheleghi fard, Mohammad Rokouei*, Ahmad Moghimi Esfand Abadi, Hadi Faraji-Arough
    Introduction

    The lack of sufficient information in the pedigree of the animals prevents the correct estimation of the breeding values. Henderson proposed a genetic grouping for a more realistic estimation of breeding values for phenotypic records in different years. For these groups, the birth year, the year that the first daughter of the male had recorded, or the year that the male animal was used for insemination were used for grouping. In fact, this grouping was considered for calculating the genetic trend over the years. The incomplete recording of the animals in the population will result in the elimination of true genetic relationships between animals. Although, these animals are considered as the base animal in the analysis, but not born at the same time, and can affect the accuracy of estimated breeding values. The available pedigree information in Iran does not have a good quality index. So that the average of pedigree completeness criterion for Iranian Holstein cows has been reported less than 0.7. Genetic evaluation of Iranian Holstein cows with unknown parents may cause a bias in estimating genetic parameters and breeding values. The use of genetic groups in genetic analysis can partly correct the problem of animals with unknown parents. In this regard, the purpose of this study was to estimate the genetic parameters and breeding values of the production traits (milk, fat, protein) of Iranian Holstein cows with and without genetic grouping in model.

    Materials and Methods

    In this study, the pedigree of 1555702 heads of the Iranian Holstein cattle from 14623 sires and 697940 dams that collected by Animal breeding center of Iran till 2013, were used. Production traits, including milk, fat and protein corrected for 305 days and twice milking from first to third lactation periods were used to estimate variance components and breeding values. Herds under 100 heads were not considered for analysis and for all production traits; pedigree related to animals with the record was extracted from the general pedigree using CFC software and used. For animals with unknown parents, genetic grouping was performed based on the sex and the birth year. Traits at different lactation periods analyzed with (model 2) and without (model 1) genetic grouping in the model and genetic trend was calculated. Then the accuracy of breeding values and genetic trend of traits obtained from different models were compared with each other. The Spearman rank correlation was used to investigate the change in animal ranking in a result of considering the genetic grouping.

    Results and Discussion

    The additive genetic variance and their standard error were lower for milk, fat and protein production traits in model with genetic grouping (model 21) than the model without genetic grouping (model 1). The estimated heritability range for milk, fat and protein production in three lactation periods with model 1 was 0.094-0.162, 0.069-0.114, and 0.079-0.123, respectively, that these values were higher than model 21 in terms of magnitude. Spearman rank correlation between the estimated breeding values with model 1 and 21 was significantly different from 1, indicating a change in animal rank with consideration of genetic grouping in the model. The spearman rank correlation was lower for males than females, suggesting a higher change in male animal's rank than females. The average accuracy estimated breeding values with model 21 was higher than model 1 and the average accuracy difference was significant between two models. The genetic trend in the first, second and third lactation periods with the model 21 was estimated 63.06, 59.60 and 44.64 for milk production, 1.346, 1.095 and 0.943 for fat and 1.542, 1. 514 and 1.035 kg per year for protein, which were higher than the estimates of model 1.

    Conclusion

    The results showed that consideration of genetic grouping in the model reduced the additive genetic variances of traits and the heritability estimated were higher without consideration of genetic grouping. The significance of the Spearman rank correlation indicates that the rank of males and females changed by inserting genetic groups into the model and change in the animal's rank for males was higher than females. The high accuracy of estimated breeding values and the genetic trends of traits in the model with genetic grouping suggests that genetic grouping for animals with unknown parents has been done and entered into the model in order to more accurately estimate the breeding values and to better reflect the performance of the breeding programs.

    Keywords: Genetic grouping, Genetic trend, Holstein, Spearman correlation}
  • سعید نیسی*، جمال فیاضی، هدایت الله روشنفکر
    در این پژوهش اثر عوامل محیطی تاثیرگذار و روندهای ژنتیکی و فنوتیپی برای صفات وزن بدن در سنین مختلف گوسفندان عربی برآورد گردید. بدین منظور از تعداد 11365 رکورد وزن تولد، 6930 رکورد وزن شیرگیری، 3275 رکورد وزن 6ماهگی، 2043 رکورد ورن نه ماهگی و 1750 رکورد وزن یکسالگی استفاده شد. داده های مورد استفاده در این مطالعه طی سال های 1373 تا 1394 در استان خوزستان جمع آوری شدند. ارزش اصلاحی حیوانات بوسیله روش حداکثر درست نمایی محدود شده برآورد شد. نرم افزار آماری SAS جهت تعیین عوامل محیطی موثر بر این صفات و نرم افزار Wombat جهت برآورد ارزش اصلاحی دام ها مورد استفاده قرار گرفت. برای برآورد روندها از روش رگرسیون وزنی نرم افزار SPSS استفاده شد. عوامل محیطی سال تولد، جنسیت بره، تیپ تولد و سن مادر، معنی دار بودند و به عنوان اثرات ثابت در مدل قرار گرفتند. سن دام هنگام وزن کشی به عنوان متغیر کمکی وارد مدل شد. روندها به صورت تابعیت میانگین وزنی فنوتیپی و ژنتیکی بر اساس سال تولد محاسبه شدند. روند ژنتیکی مستقیم برای صفات اوزان تولد، شیرگیری، شش ماهگی، نه ماهگی و یکسالگی به ترتیب 07/0، 17-، 2، 1 و 1 گرم در سال برآورد شد. روند فنوتیپی برای صفات مذکور به ترتیب 5، 256، 76، 83 و 194 گرم در سال بود. می توان نتیجه گرفت که افت میانگین ارزش ارثی در روندهای ژنتیکی و ایجاد نوسان در روند فنوتیپی به دلیل کاهش دقت رکورد گیری و ورود دام هایی با ارزش اصلاحی پایین به گله و یا تاثیر منفی عوامل محیطی در بروز پتانسیل تولیدی دام ها باشد.
    کلید واژگان: گوسفند عربی, روند ژنتیکی, صفات رشد, عوامل محیطی}
    Saeid Neysi *, Jamal Fayazi, Hedayatollah Roshanfekr
    In this study environmental effects, genetic and phenotypic trends for body weight traits in different age in Arabi Sheep estimated. In this study used a total of 11365 records on birth weight, 6930 records of weaning weight, 3275 records of 6 month weight, 2043 records of 9 month weight and 1750 records of 12 month weight. The data used in this study, collected during 1994-2015 in Khuzestan province. The breeding value of the animal were estimated by restricted maximum likelihood method. The SAS statistical software was used to evaluate the effect of environmental factors and Wombat software was employed to estimate animals breeding value. The SPSS software was used for estimation of the trends. Environmental factors such as birth year, Sex, birth type and age of Mather were significant on all traits and were fixed effects in model. Animal’s age was introduced to the model as covariate. Estimation of direct genetic trend for birth weight, weaning weight, 6 month weight, 9 month weight and 12 month weight were as -0.07, -17, 2, 1 and 1 gr per year respectively. The phenotypic trend for considered traits was respectively 5, 256, 76, 83 and 194 gr per year. It can be concluded that reduction of the average breeding value in the genetic trends and the oscillation in the phenotypic trend are due to reduction of recording accuracy and entering livestock with low breeding value to the herd or negative impact of environmental factors on the production potential of livestock.
    Keywords: Arabi Sheep, genetic trend, growth traits, Environmental Effects}
  • سیما ساور سفلی*، مهدی بهلولی

    هدف از این تحقیق بررسی تاثیر شاخص دما-رطوبت بر روند تولید شیر و درصد چربی شیر گاوهای هلشتاین اقلیم مدیترانه ای ایران بود. داده ها شامل 348868 و 302851 رکورد روز آزمون تولید شیر و درصد چربی از 42781 و 38829 راس گاو شیری مربوط به 9 استان از منطقه ی مدیترانه ای ایران بین سال های 1380 تا 1395 بود. برای محاسبه شاخص دما و رطوبت نسبی (THI) از اطلاعات آب و هوایی نزدیکترین ایستگاه های هواشناسی به گله های مورد بررسی استفاده شد. میانگینTHI  مربوط به سه روز قبل از تاریخ رکوردگیری به عنوان یک توصیف گر محیطی برای صفات تولیدی در نظر گرفته شد. آزمون معنی داری با رویه ی GLM برای در نظر گرفتن اثرات ثابت در مدل مورد استفاده قرار گرفت. مدل رگرسیون تصادفی با روش بیزی برای برآورد ارزش اصلاحی (EBV) حیوانات در تابعی از روزهای شیردهی (DIM) و THI به کار گرفته شد و روند ژنتیکی صفات در تابعی از سال تولد و THI برآورد شد. نتایج نشان داد که علاوه بر تغییر رتبه بندی گاوهای نر در DIMهای متفاوت، رتبه بندی در تابعی از THI نیز متفاوت بود. حیوانات پاسخ های متفاوتی در تابعی از THI داشتند به طوری که گاوهای نر با بیشترین EBV در THI پایین دارای EBV کمتری در THI بالا بودند. در تابعی از THI، تغییر رتبه بندی گاوهای نر برای درصد چربی نسبت به تولید شیر بیشتر بود. به عبارت دیگر، حیوانات برای درصد چربی در پاسخ به تغییرات آب و هوایی حساس تر بودند. برای هر دو صفت، با افزایش THI روند ژنتیکی منفی مشاهده شد؛ به علاوه بر خلاف تولید شیر، درصد چربی روند منفی در تابعی از سال تولد داشت. می توان نتیجه گرفت که THI اثر قابل توجهی بر صفات تولیدی شیر داشته و در نظر گرفتن این عامل با به کارگیری مدل رگرسیون تصادفی می تواند برای بررسی مقاومت گرمایی گله های گاوهای شیری در اقلیم آب و هوایی مدیترانه ای قابل استفاده باشد.

    کلید واژگان: روزهای شیردهی, شاخص دما-رطوبت, ارزش اصلاحی, روند ژنتیکی, اقلیم مدیترانه ای}
    Sima Savar Sofla*, Mehdi Bohlouli

    The objective of this research was to investigate the impact of temperature-humidity Index (THI) on milk yield (MY) and fat percentage (FP) trend of Holstein dairy cattle in Mediterranean climate of Iran. Data included 348,868 and 302,851 test-day records, respectively for milk yield and fat percentage from 42,781 and 38,829 cows, respectively. Data were collected from 9 provinces located in the Mediterranean region of Iran between 2001 and 2016. The climate information from the nearest weather stations to each herd was used to calculate THI. Then the average of daily THI for 3 days before test date was considered as an environmental descriptor for milk production traits. Significance test using GLM procedure was applied to consider fixed effects in the model. Random regression model using Bayesian methodology was applied to estimate breeding values (EBV) across different combinations of days in milk (DIM) and THI via and subsequently, genetic trends for production traits were estimated along year of birth and THI values. The results showed that in addition to re-ranking of sires in different DIM, the different ranks were observed across different THI. In the other word, animals had different responses along THI and sires with higher EBVs for lower THI had lower EBVs for higher THI. Across THI, the re-ranking of sires for FP was more considerable than for MY. In other words, animal for FP were more sensitive in response to climate changes. For both traits, negative genetic trends were observed with increasing THI. In addition, in contrast with MY, a negative trend for FP was obtained based on year of birth. It could be concluded that THI has substantial effect on milk production traits and including this factor with applying random regression model could be useful to investigate heat tolerance of dairy cattle herds in Mediterranean climate.

    Keywords: Breeding Value, Days in Milk, Genetic Trend, Mediterranean Climate, Temperature-Humidity Index}
  • رضا بهمرام*، مریم اسرافیلی تازه کند محمدیه
    برای ارزیابی پیشرفت ژنتیکی صفات رشد از اطلاعات شجره 12140 راس بز کرکی رایینی مربوط به سال های 1369 تا 1389 در مرکز پرورش و اصلاح نژاد بز کرکی رایینی استفاده شد. صفات مورد بررسی شامل وزن تولد، شیرگیری، شش ماهگی، نه ماهگی و یک سالگی بود. مولفه های واریانس و پارامتر های ژنتیکی صفات با روش حداکثر درستنمایی محدود شده و شش مدل حیوانی مختلف با استفاده از نرم افزار Wombat برآورد شد. وراثت-پذیری مستقیم صفات وزن تولد، شیرگیری، شش ماهگی، نه ماهگی و یک سالگی به ترتیب 24/0، 29/0، 33/0، 35/0 و 37/0 بود. ارزش اصلاحی دام ها برای هر صفت، با استفاده از بهترین مدل دام تک صفتی برآورد گردید. روند فنوتیپی، ژنتیکی و محیطی صفات به ترتیب از طریق تابعیت میانگین فنوتیپی، میانگین ارزش اصلاحی و تفاوت ارزش اصلاحی از ارزش فنوتیپی بر سال تولد برآورد شد. روند ژنتیکی صفات وزن تولد، شیرگیری، شش ماهگی، نه ماهگی و یک سالگی به ترتیب 71/16، 83/85، 16/105، 67/123 و 53/122 گرم در سال محاسبه شد (01/0>p). میزان پیشرفت ژنتیکی صفات وزن تولد، شیرگیری، شش ماهگی، نه ماهگی و یک سالگی به ترتیب 483/0، 561/0، 767/1، 647/1 و 465/1 کیلو گرم برآورد شد. با توجه به روند های ژنتیکی مثبت برآورد شده برای صفات رشد در بز های رایینی، به نظر می رسد برنامه انتخاب دام ها بر مبنای ارزش اصلاحی در این نژاد منجر به پیشرفت ژنتیکی قابل مناسبی شده و باید این راهکار ادامه یابد.
    کلید واژگان: ارزش اصلاحی, پارامتر های ژنتیکی, روند ژنتیکی, روند فنوتیپی, صفات رشد}
    Reza Behmaram *, Maryam Esrafili Tazeh Kand Mohammadiyeh
    For genetic progress evaluation of growth traits, the pedigree information of 12140 Raeini Cashmere goats in Raeini Chashmere goats breeding station from 1990 to 2010 were used. Investigated traits were included birth weight, weaning weight, 6 month weight, 9 month weight and 1 year weight. Variance components and genetic parameters of each trait was estimated by restricted maximum likelihood and six animal models using Wombat software. Direct heritability of birth weight, weaning weight, 6 month weight, 9 month weight and 1 year weight were 0.24, 0.29, 0.33, 0.35 and 0.37 respectively. Breeding values of animals for each trait was estimated using univariate animal model. Phenotypic, genetic and environmental trends of traits were estimated via regression of phenotypic value, breeding value and difference of breeding value from phenotypic value on the year of birth. Genetic trend of birth weight, weaning weight, 6 month weight, 9 month weight and 1 year weight were estimated 16.71, 85.83, 105.16, 123.67 and 122.53 gr/year respectively (p<0.01). The genetic gain of traits including birth weight, weaning weight, 6 month weight, 9 month weight and 1year weight were estimated 0.483, 0.561, 1.767, 1.647 and 1.465 Kg respectively. Regarding to positive genetic trends estimated for growth traits for Raeini goats, the livestock selection program, based on the breeding value in this breed, seems to lead to a good genetic improvement and this strategy should continue.
    Keywords: Breeding value, genetic parameters, genetic trend, phenotypic trend, growth traits}
  • همایون فرهنگ فر*، سارا نظام دوست، محمدباقر منتظر تربتی، محمدرضا اصغری
    زمینه مطالعاتی
    با استفاده از مدل های مکانیستیک (زیست شناختی) می توان خصوصیات ژنتیکی منحنی شیردهی گاوها را از نقطه نظر بیولوژی ترشح شیر در بافت پستان، مورد بررسی قرار داد.
    هدف
    این تحقیق، با هدف استفاده از یک مدل مکانیستیک در ارزیابی خصوصیات ژنتیکی منحنی شیردهی گاوهای زینه (آمیخته) و اصیل هلشتاین اجرا گردید.
    روش کار
    از تعداد 1. 448. 292 رکورد شیر روز آزمون متعلق به 161. 676 راس گاو شیری (دختران 3. 979 راس گاو نر) در 921 گله که طی سال های 1376 تا 1391 برای نخستین بار زایش داشتند، استفاده شد. از مدل مکانیستیک پلوت - گوتوین با دو پارامتر MS (صفت مرتبط با حداکثر ظرفیت ترشح شیر) و DR (صفت مرتبط با کاهش نسبی تعداد سلول های ترشح کننده شیر) برای توصیف شکل منحنی شیردهی استفاده گردید. تابع غیرخطی فوق، بر داده های شیر روز آزمون هر گاو، به طور جداگانه برازش و پارامترهای آن برای هر یک از گاوها، برآورد شد. به منظور تخمین وراثت پذیری برای صفات MS و DR از مدل دام تک متغیره استفاده شد. روند ژنتیکی با روش تابعیت وزنی میانگین ارزش اصلاحی از سال زایش محاسبه گردید.
    نتایج
    وراثت پذیری MS و DR به ترتیب 293/0 و 190/0 بود. همبستگی پیرسون بین ارزش اصلاحی صفات مزبور 29/0- به دست آمد (0001/0P<). روندهای فنوتیپی و ژنتیکی برای MS به ترتیب 52/0 و 063/0 کیلوگرم در سال، و برای DR به ترتیب 000025/0- و 000007/0- و همه ی آن ها به لحاظ آماری معنی دار بودند (0001/0P<).
    نتیجه گیری نهایی
    با توجه به وراثت پذیری نسبتا بالا برای MS و DR ، درنظر گرفتن آن ها در شاخص انتخاب گاوها، می تواند منجر به بهبود ژنتیکی مناسبی برای صفات مزبور گردد.
    کلید واژگان: روند ژنتیکی, گاوهای شیری, مدل مکانیستیک, منحنی شیردهی, وراثت پذیری}
    H Farhangfar*, S Nezamdoust, MB Montazer, MR Asgari
    Introduction
    Successful animal breeding strategies rely on selecting superior animals to produce progeny which are expected to have better performance compared to contemporaries at different rearing environments (Doeschl-Wilson 2007). Based on this, the main aim of a breeding scheme is to promote genetic potential of livestock for the traits of great economic importance. Milk yield varies over a course of lactation as a result of continuous physiological mechanisms of growth and death of udder cells (Val-Arreola 2004). Mathematical models used for description of the lactation curve can be empirical (shape-oriented) or mechanistic (biology-oriented) (Farhangfar 2015). Using mechanistic (biological) models it would be possible to study genetic aspects of cows' lactation curve from the biology of milk secretion in udder tissue standpoint. Vast majority of the research undertaken on the lactation curve of Iranian dairy cows have been focused on the use of empirical models. This research was carried out with the objective of evaluating genetic characteristics of the lactation curve of Iranian Holstein grade and pure-bred dairy cows using a mechanistic model.
    Material and methods
    The data used in this research were provided by Animal Breeding Centre, Karaj, Iran. The data set consisted of 1,448,292 test day milk records belonging to 161,676 first parity cows (progeny of 3979 bulls) in 921 herds (in 14 provinces over the country) and calved during 1997- 2012. Minimum and maximum number of test day records were 4 and 13, respectively. Based on the percentage of Holstein gene inheritance (H), cows were divided into four groups. Pollott-Gootwine mechanistic model with two parameters of MS (maximum secretion potential of the lactation) and DR (relative decline in cell numbers) was applied to describe the shape of lactation curve. This nonlinear function was fitted to the individual lactation curves and the parameters were estimated for each cow by using nonlinear procedure of SAS software. Heritability of MS and DR traits was estimated using a fitting univariate animal model. In the model, effects of province, contemporary group of herd-year-season, calving age, type of genotype, interval of first test day from calving, fat to protein ratio, length of lactation as well as random effect of cow were included. All relationship among the animals were taken into account through including pedigree. The model was run for each trait using DMU software and restricted maximum likelihood (REML) estimate of additive genetic and residual variance components and prediction of breeding value of the animals were obtained. Genetic trend was subsequently calculated through fitting weighted regression of mean breeding value on calving year.
    Results and discussion
    Additive genetic and residual variance components for MS were 5.7123 and 13.7759, respectively and the corresponding figures for DR were 0.0000012 and 0.0000051, respectively. Heritabilities of MS and DR were found to be 0.293 (SE=0.008) and 0.194 (SE=0.120), respectively indicating that there is relatively good genetic variation for the traits to be used in selection programmes. Mean predicted breeding value (PBV) of the cows with records were 0.255 (Kg) and -0.000005 for MS and DR, respectively. Regarding MS, cows with 50  H  75 had minimum PBV (0.072 Kg) while cows with 87.5  H 100 had maximum PBV (0.309 Kg) and the difference was statistically significant (P<0.05). Based upon mean PBV for MS, mean PBV for the trait of 305-day milk yield in pure-bred Holstein cows (H=100) was expected to be 82.96 Kg. Pearson correlation between breeding values of the traits was -0.29 (P<0.0001) suggesting that cows of high genetic potential for MS are expected to have low breeding value for DR. Phenotypic and genetic trends for MS were 0.52 (SE=0.017) and 0.063 (SE=0.004, R2=0.95) kg per year, respectively, while the corresponding figures for DR were -0.000025 (SE=0.0000021) and -0.000007 (SE=0.00000054, R2=0.92), respectively and that all the trends were statistically significant (P<0.0001).
    Conclusion
    High heritability of MS and DR suggests that appropriate genetic gain could be obtained as the selection of the cows is based upon these traits. As DR is associated with lactation persistency, it could be therefore concluded that Iranian dairy cows have become phenotypically and genetically persistent over the years of 1997-2012.
    Keywords: Dairy cows, Genetic trend, Heritability, Lactation curve, Mechanistic model}
  • حسام عمو پشت مساری*، سید حسن حافظیان، رستم عبدالهی آرپناهی، مرتضی ستایی مختاری، قدرت الله رحیمی میانجی
    برای تجزیه ژنتیکی صفات رشد گوسفند لری بختیاری با مدل های معادلات ساختاری و مدل های چند متغیره استاندارد از داده های فنوتیپی و شجره ای جمع آوری شده طی سال های 1390-1374 در ایستگاه اصلاح نژاد گوسفند لری بختیاری استفاده شد. صفات مورد بررسی شامل وزن تولد، میانگین افزایش وزن روزانه از تولد تا شیرگیری، وزن شیرگیری، میانگین افزایش وزن روزانه از شیرگیری تا شش ماهگی و وزن شش ماهگی بودند. سه مدل مختلف شامل مدل چند متغیره استاندارد، مدل یک طرفه بر اساس توالی زمانی و مدل یک طرفه کامل در نظر گرفته شد. بر مبنای معیار اطلاعات انحراف (DIC)، مدل یک طرفه بر اساس توالی زمانی دارای بالاترین مطلوبیت بود. در مدل یک طرفه بر اساس توالی زمانی، ضرایب ساختاری بین وزن تولد و میانگین افزایش وزن روزانه از تولد تا شیرگیری، میانگین افزایش وزن روزانه از تولد تا شیرگیری و وزن شیرگیری، وزن شیرگیری و میانگین افزایش وزن روزانه از شیرگیری تا شش ماهگی و میانگین افزایش وزن روزانه از شیرگیری و شش ماهگی به ترتیب 343/9، 03/0، 632/10 و 14/0 بدست آمدند. وراثت پذیری مستقیم صفات در مدل های استاندارد و یک طرفه بر اساس توالی زمانی به ترتیب 32/0-29/0، 2/0-22/0، 17/0-18/0، 11/0-11/0 و 16/0-16/0 برآورد شدند. روند ژنتیکی در مدل های استاندارد و یک طرفه بر اساس توالی زمانی نیز برای صفات مورد بررسی به ترتیب 6-23، 7/0- 3، 69- 129، 4/0-2/1 و 110-187 گرم در سال برآورد شدند که معنی دار بودند. تجزیه ژنتیکی صفات رشد ضرورت قرار دادن روابط علی بین صفات به منظور توسعه موثر اصلاح نژاد گوسفند لری بختیاری را نشان می دهد
    کلید واژگان: روند ژنتیکی, صفات رشد, گوسفند لری بختیاری, مدل های معادلات ساختاری}
    H. Amou Posht-E Masari*, S. H. Hafezian, R. Abdollahi-Arpanahi, M. Sattaei Mokhtari, Gh. Rahimi Mianji
    In order to estimate genetic parameters and genetic trends of growth traits in Lori Bakhtiari sheep using structural equation models and standard multivariate models, pedigree and phenotypic data which were collected from 1994 to 2011 in Lori Bakhtiari sheep breeding station were used. The studied growth traits included birth weight (BW), average daily gain from birth to weaning (ADG1), weaning weight (WW), average daily gain from weaning to six-month weight (ADG2) and six-month weight (6MW). Three different models including standard multivariate model (SMM), multivariate temporal recursive model (TRM) and multivariate fully recursive model (FRM) were considered. Based on DIC values, TRM had the highest plausibility. Under TRM, structural coefficients between BW-ADG1, ADG1-WW, WW-ADG2 and ADG2-6MW were estimated to be 9.343, 0.03, 10.632 and 0.14, respectively. Direct heritability estimates for mentioned traits were 0.32-0.29, 0.2-0.22, 0.17-0.18, 0.11-0.11 and 0.16-0.16, respectively. The estimated values for genetic trends under SMM and TRM were 6-23, 0.7-3, 69-129, 0.4-1.2 and 110-187 grams per year for BW, ADG1, WW, ADG2 and 6MW, respectively. The results of genetic analyses of growth traits indicated the necessity of considering causal relationships between the studied traits for developing efficient breeding program in Lori Bakhtiari sheep
    Keywords: Genetic trend, Growth traits, Lori, Bakhtiari sheep, Structural equation models}
  • سمیرا خسروی، مسعود اسدی فوزی*، علی اسمعیلی زاده کشکوییه
    به منظور ارزیابی پیشرفت ژنتیکی صفات رشد شامل وزن بدن در سنین تولد، سه ماهگی، شش ماهگی، نه ماهگی و دوازده ماهگی در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند کرمانی از 10459 رکورد وزن بدن اندازه گیری شده بر روی 3132 حیوان از 78 پدر و1163 مادر استفاده شد. این رکوردها طی 17 سال از سال 1372تا 1389 جمع آوری شده و با استفاده از یک مدل چند متغیره حیوانی مورد آنالیز قرار گرفت. سن، جنس، نوع تولد، سال و فصل تولد بعنوان اثرات ثابت در مدل گنجانده شدند. همچنین علاوه بر اثرات ژنتیکی افزایشی مستقیم، اثرات ژنتیکی مادری و اثرات محیط دائمی مادری نیز به عنوان اثرات تصادفی در نظر گرفته شدند.آنالیز ژنتیکی صفات رشد با استفاده مدل حیوانی چند متغیره و توسط نرم افزار ASReml انجام گرفت. وراثت پذیری وزن بدن در زمان تولد، سه ماهگی، شش ماهگی، نه ماهگی و دوازده ماهگی به ترتیب 14/0، 33/0، 34/0، 12/0 و 16/0 برآورد گردید. همچنین همبستگی ژنتیکی بین این صفات در دامنه 78/0 (بین وزن تولد و وزن دوازده ماهگی ) و 98/0 (بین وزن نه ماهگی و دوازده ماهگی) برآورد شد. روند ژنتیکی صفات مورد نظر با برازش متوسط ارزش های اصلاحی بر سال تولد تعیین گردید. بر این اساس میزان پیشرفت ژنتیکی وزن تولد، وزن سه ماهگی، شش ماهگی، نه ماهگی و دوازده ماهگی به ترتیب 2/0، 83/0، 81/0، 42/0 و 42/0 به دست آمد. این نتایج نشان می دهد که روند ژنتیکی براورد شده برای این صفات منظم نبوده و از نظر مقدار نیز قابل توجه نمی باشد. این امر می تواند به دلیل عدم وجود یک برنامه اصلاح نژادی مناسب و کارآمد باشد. به عبارت دیگر انجام انتخاب بر اساس ملاک های ظاهری کارایی لازم را برای بهبود ژنتیکی صفات رشد ندارد و لازم است ارزیابی ژنتیکی گوسفندان موجود در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند کرمانی با استفاده از ارزش های اصلاحی حاصل از رکوردهای انفرادی و اطلاعات شجره ای موجود صورت پذیرد. این نتایج نشان می دهد که با انجام انتخاب می توان این صفات را از نظر ژنتیکی بهبود بخشید. همچنین انجام انتخاب برای هر کدام از صفات ذکر شده موجب بهبود ژنتیکی سایر صفات نیز می شود.
    کلید واژگان: صفات رشد, وراثت پذیری, همبستگی ژنتیکی, گوسفند کرمانی, روند ژنتیکی}
    Samira Khosravi, Masood Asadi Fozi *, Ali Esmaili Koshkooyeh
    For genetic analyses of growth traits of Kermani sheep including body weight at birth, three, six, nine and twelvemonths of age, 10, 459 body weight records measuredon 3132 animals originated from 78 sires and 1163 dams were used. The data were collected at Kermani sheep breeding station during 1988 to 2010. The data were analyzed using a multivariate animal model. In the model, animal age, sex, type of birth, year and season of birth were fitted as fixed effects. Maternal genetic effects as well as the direct additive genetic effects were fitted as the random effects. Heritability estimates of the body weight measured at birth, 3, 6, 9 and 12 months of ages were 0.14, 0.33, 0.34, 0.12, and 0.16, respectively. The genetic correlations between the growth traits were in a range of 0.78 to 0.98. These results show that the growth traits can be improved genetically. In the station, the genetic trends of the traits investigated were generally erratic and the genetic progress was low which were mostly due to the lack of an efficient breeding program. The genetic progress can be achieved if the animals are genetically evaluated based on their individual performance records and pedigree information.
    Keywords: Growth traits, Heritability, Genetic correlation, Kermani sheep, Genetic trend}
  • حسین بانی سعادت، شیدا ورکوهی*، سرین رزاق زاده
    در این مطالعه، بررسی روند ژنتیکی، فنوتیپی و محیطی صفات بیومتریک در گوسفند نژاد ماکویی با استفاده از داده هایی که طی سال های 1368 تا 1392 از مرکز اصلاح نژاد گوسفند ماکویی جمع آوری شده بود، انجام شد. تخمین روندها با استفاده از مدل حیوانی چند صفتی و نرم افزار DFREML انجام شد. روند ژنتیکی، فنوتیپی و محیطی به ترتیب از طریق تابعیت میانگین ارزش های اصلاحی بر سال، میانگین ارزش های فنوتیپی بر سال و میانگین تفاوت ارزش اصلاحی با ارزش فنوتیپی بر سال برآورد شد. نتایج نشان داد که وراثت پذیری صفات بیومتری ارتفاع از جدوگاه، ارتفاع از کفل، طول بدن، دور سینه و دور ران به ترتیب 05/0±23/0، 05/0±25/0، 04/0±19/0، 05/0±28/0 و 04/0±06/0 برآورد شد و بالاترین مقادیر همبستگی های ژنتیکی و فنوتیپی، بین صفات ارتفاع از جدوگاه و ارتفاع از کفل (به ترتیب 98/0و 93/0) برآورد گردید. روند ژنتیکی برای صفات فوق به ترتیب 07/0 ± 25/0، 07/0 ± 26/0، 05/0 ± 59/0، 09/0± 22/0 و 03/0± 23/0 سانتی متر، روند فنوتیپی به ترتیب 08/0±08/0، 05/0±07/0، 06/0±39/0، 16/0±23/0- و 05/0±08/0 سانتی متر و روند محیطی به ترتیب 06/0±16/0- ، 06/0±15/0-، 06/0±20/0-، 15/0±45/0- و 04/0±16/0- سانتی متر برآورد شد. همچنین پیشرفت ژنتیکی کل بعد از 24 سال در جامعه مورد مطالعه کم بود که در این میان بیشترین پیشرفت در صفات طول بدن و دور سینه مشاهده شد، بنابراین می توان نتیجه گرفت که با وجود روند ژنتیکی مثبت، انتخاب در این گله بر اساس ارزش اصلاحی و برنامه ای مشخص و منظم انجام نشده است.
    کلید واژگان: ارزش اصلاحی, وراثت پذیری, همبستگی, پیشرفت ژنتیکی, روند ژنتیکی}
    Hosein Bani Saadat, Sheida Varkoohi *, Sarain Razagh Zadeh
    In this research, investigation of genetic, phenotypic and environmental trends of biometric traits in Makuie sheep was performed using collected data from 1989 to 2012 at Makouei sheep breeding station. Estimation of trends was performed by multivariate animal model using the DFREML software. Genetic, phenotypic and environmental trends were estimated by regression of breeding values average, phenotypic values average and average of difference between breeding values with phenotypic values on birth year, respectively. Results showed that heritability estimates for biometric traits including height at withers, height at rump, body length, heart girth and thigh circumference were 0.23±0.05, 0.25±0.05, 0.19±0.04, 0.28±0.05 and 0.06±0.04, respectively; and the highest genetic and phenotypic correlations were between height at withers and height at rump traits (0.98 and 0.93, respectively). Genetic trends of mentioned traits were 0.25±0.07, 0.26±0.07, 0.59±0.05, 0.22±0.09 and 0.23±0.03 cm; phenotypic trends were 0.08±0.08, 0.07±0.05, 0.39±0.06, -0.23±0.16 and 0.08±0.05 cm and environmental trends were -0.16±0.06, -0.15±0.06, -0.20±0.06, -0.45±0.15 and -0.16±0.04 cm, respectively. Total genetic improvement after 24 years was low and the highest improvement was observed in body length and chest girth traits therefore, it can be concluded that despite the positive genetic trend, selection in this herd were not based on breeding value and regular plan.
    Keywords: Breeding value, Correlation, Genetic improvement, Genetic trend, Heritability}
  • علیرضا شهدادی*، داوودعلی ساقی
    هدف از مطالعه حاضر برآورد روند ژنتیکی، فنوتیپی و محیطی صفات وزن بدن در سنین مختلف در گوسفندان کردی شمال خراسان بود. برای انجام این مطالعه از رکوردهای مربوط به صفات رشد 5144 راس بره حاصل از 161 راس قوچ و 1982 راس میش استفاده گردید. صفات مورد ‏بررسی شامل وزن های تولد (5069 رکورد)، 3 (3968 رکورد)، 6 (3519 رکورد)، 9 (2840 رکورد) و 12 (2595 رکورد) ماهگی بودند ‏که طی سال های 1375 تا 1392 در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند کردی واقع در شهرستان شیروان استان خراسان شمالی جمع ‏آوری شده بودند. ‏مولفه های واریانس و پارامترهای ژنتیکی صفات با استفاده از روش حداکثر درست نمایی محدود شده و برازش 6 مدل حیوانی مختلف با استفاده از نرم افزار WOMBAT برآوردید گردید. تعیین مناسب‏ترین مدل برای هر صفت با استفاده از مقادیر لگاریتم حداکثر درست نمایی صورت گرفت. ارزش‏های اصلاحی حیوانات با روش معادلات مدل های مختلط با استفاده از بهترین مدل دام تک صفتی برآورد گردید. روند ژنتیکی، فنوتیپی و محیطی به ترتیب از طریق تابعیت میانگین ارزش اصلاحی، میانگین فنوتیپی و تفاوت میانگین ارزش اصلاحی از میانگین فنوتیپی بر سال تولد برآورد شدند. وراثت پذیری مستقیم وزن های تولد، 3، 6، 9 و 12 ماهگی به ترتیب 03/0±10/0، 03/0±28/0، 04/0±32/0، 03/0±22/0 و 04/0±20/0 برآورد گردید. روند ژنتیکی مستقیم برای صفات وزن تولد، 3، 6، 9 و 12 ماهگی به ترتیب 25/0±13/4، 91/5±01/117، 78/5±24/148، 83/5±01/110 و 89/6±21/122 گرم در سال و روند فنوتیپی به ترتیب 47/7-، 32/126-، 21/490-، 69/493- و 48/599- گرم در سال برآورد شد. ب
    کلید واژگان: روند ژنتیکی, روند فنوتیپی, صفات وزن بدن, گوسفند کردی}
    A. R. Shahdadi *, D. A. Saghi
    The objective of the present study was to estimate genetic, phenotypic and environmental trends for body weight traits at different ages in Kourdi sheep. Thus, the records of growth traits from 5144 lambs (from 161 rams and 1982 ewes) were used. The studied traits were birth weight (5069 records), 3-month weight (3968 records), 6-month weight (3519 records), 9-month weight (2840 records) and 12-month weight (2595 records) that collected from 1996 to 2013 in Kordi Breeding Station in Shirvan city of northern Khorasan province. Variance components and genetic parameters were estimated applying restricted maximum likelihood method fitting six animal models using WOMBAT. The most appropriate model for each trait was determined based on likelihood values. Breeding values were estimated via mixed model equations by the best model for univariate analysis. Genetic, phenotypic and environmental trends were calculated by regression of means of predicted breeding values, phenotypic means and difference between estimated means of breeding values and phenotypic means on birth year for each trait, respectively. Direct heritability estimates for birth, 3, 6, 9 and 12 month weights were 0.10±0.03, 0.28±0.03, 0.32±0.04, 0.22±0.03 and 0.20±0.04, respectively. Direct genetic trends for birth, 3, 6, 9 and 12 month weights were 4.13±0.25, 117.01±5.91, 148.24±5.78, 110.01±5.83 and 122.21±6.89 g per year, respectively. The phenotypic trends for these traits were -7.47, -126.32, -490.21, -493.69 and -599.48 g per year, respectively.
    Keywords: Genetic trend, Phenotypic trend, Body weight traits, Kourdi sheep}
  • B. Eteqadi, N. Ghavi Hossein Zadeh, A. A. Shadparvar
    The main objective of the present study was to estimate genetic and phenotypic trends for body weight traits in Guilan province sheep. Traits included were birth weight (BW, n=14,549), 3-month weight (3MW, n=13,109) and 6-month weight (6MW, n=10,141). Data and pedigree information used in this study were collected during 1994 to 2011 by the Agricultural Organization of Guilan province in Iran. Animal breeding values were predicted using univariate analysis based on animal model. The GLM procedure of SAS was used for determining the fixed effects which had significant influence on the traits under study. The Wombat software was employed to estimate the breeding values. The Best Liner Unbiased Predictions (BLUP) of breeding values were obtained, and genetic and phenotypic trends were estimated as the regression of the average predicted breeding and phenotypic values on birth year, respectively. Environmental trends were calculated as the difference between phenotypic and genetic trends. Direct genetic trends were positive and significant (P
    Keywords: genetic trend, phenotypic trend, body weight, Guilan province sheep}
  • سیما ساور سفلی*، زهرا پتی آبادی، شیدا ورکوهی، محمدحسین هادی تواتری
    هدف از انجام این پژوهش، بررسی روندهای ژنتیکی، فنوتیپی و محیطی صفات رشد در گوسفند شال بود. به این منظور رکوردهای مربوط به صفات رشد 6692 راس بره که طی سال های 1376 تا 1392 در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند شال واقع در استان قزوین جمع آوری شده بود، استفاده گردید. صفات مورد مطالعه شامل وزن های تولد (6690 رکورد) ، سه (6654 رکورد) ، شش (6662 رکورد) ، نه (6599 رکورد) و دوازده ماهگی (6528 رکورد) بودند. با استفاده از روش حداکثر درستنمایی محدود شده نرم افزار WOMBAT، پارامترهای ژنتیکی برآورد شدند. روندهای ژنتیکی، فنوتیپی و محیطی صفات، به ترتیب با کمک ضریب تابعیت میانگین ارزش های اصلاحی، فنوتیپی و محیطی از سال تولد برآورد شدند. وراثت پذیری مستقیم وزن بدن در سنین مختلف بر اساس مناسب ترین مدل برای وزن تولد، سه، شش، نه و دوازده ماهگی به ترتیب 02/0±13/0، 05/0±57/0، 05/0±52/0، 04/0±79/0 و 05/0±73/0 برآورد گردید. همبستگی بین ژنتیک افزایشی مستقیم و مادری در تمامی صفات مورد بررسی منفی به دست آمد. روند ژنتیکی برای صفات به ترتیب 86/0، 19/10-، 45/27-، 73/15- و 44/2- ، روند فنوتیپی به ترتیب 84/12، 19/65-، 35/57-، 92/53- و 59/57- و همچنین روند محیطی به ترتیب 33/4، 56/21-، 47/26-، 98/0- و 91/41- گرم در سال برآورد شدند. روندهای ژنتیکی، فنوتیپی و محیطی کلیه صفات معنی دار نبودند. نتایج این تحقیق نشان دهنده عدم وجود رشد ژنتیکی مثبت صفات وزن بدن گوسفند شال در سالیان گذشته می باشد، بنابراین برنامه های اصلاح نژادی مناسب برای بهبود ژنتیکی صفات یاد شده در گوسفندان شال توصیه می شود.
    کلید واژگان: صفات رشد, روند ژنتیکی, روند محیطی, روند فنوتیپی, گوسفند شال}
    S. Savar Sofla*, Z. Patiabadi, Sh. Varkoohi, M. H. Hadi Tavatori
    The purpose of this study was to investigate the genetic, phenotypic and environmental trends of growth traits in Shal sheep. In this regard, records were collected on the growth traits of 6692 lambs that were collected from 1997 to 2013 at Shal Sheep breeding station located in Qazvin province. The studied traits included birth weight (6690 records), three months weight (6654 records), six month weight (6662 records), nine months weight (6599 records) and twelve months weight (6528 records). Genetic parameters were estimated using WOMBAT software with limited likelihood method. The genetic, phenotypic and environmental trends of the traits were estimated using the regression coefficient of average breeding values, phenotypic and environmental on birth year, respectively. Direct heritability of body weight at different ages based on the most suitable model for birth weight, three, six, nine, and twelve months were 0.13±0.02, 0.57±0.05, 0.52±0.05, 0.79±0.04, and 0.73±0.05 respectively. Correlation between direct and maternal incremental genetics in all negative traits was obtained. The genetic trend for the traits was -0.86, -10.19, -27.45, -15.73 and -2.44 g/y, respectively. The phenotypic trend was 12.84, -65.19, -57.35, -53.92 and -57.59 g/y, respectively, and also the environmental trends were estimated and environmental trends were 4.33, -21.56, -26.47, -0.98 and -41.91 g/y, respectively. Genetic, phenotypic and environmental trends of all traits were not significant. The results of this study indicate that there is no positive genetic growth of Shal sheep weight traits in recent years. Therefore, appropriate breeding programs are recommended for genetic improvement of the mentioned traits in shal sheep.
    Keywords: Growth traits, Genetic trend, Environmental trend, Phenotypic trend, Shal sheep}
  • آذر راشدی ده صحرایی، جمال فیاضی، محمدتقی بیگی نصیری، محمود وطن خواه
    هدف از انجام این مطالعه برآورد روندهای ژنتیکی و فنوتیپی صفات وزن بدن در برخی سنین در بره های لری بختیاری بود. برای انجام این تحقیق از تعداد 7721 رکورد وزن تولد، 6462 رکورد وزن یک ماهگی، 7275 رکورد وزن شیرگیری، 5745 رکورد وزن شش ماهگی، 3326 رکورد وزن نه ماهگی و 3088 رکورد وزن یک سالگی بره های لری بختیاری که طی سال های 1368 تا 1389 در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند لری بختیاری واقع در شهرستان شهرکرد جمع آوری شده بود، استفاده شد. نرم افزار آماری SAS برای تعیین سازه های محیطی موثر بر این صفات و نرم افزار Wombat برای برآورد پارامترهای ژنتیکی و ارزش اصلاحی دام ها مورد استفاده قرار گرفت. عوامل محیطی سال تولد، جنس بره، تیپ تولد و سن مادر هنگام زایش بر این صفات معنی دار بودند. روندها به صورت تابعیت وزنی بر اساس سال تولد محاسبه شدند. روند ژنتیکی مستقیم برای وزن تولد، یک ماهگی، شیرگیری، شش ماهگی، نه ماهگی و یک سالگی به ترتیب برابر 1±12، 2±18، 4±78، 8±163، 10±183 و 11±205 گرم در سال و از لحاظ آماری معنی دار بودند (01/0>P)، روند فنوتیپی برای صفات مذکور به ترتیب برابر 5±24، 17± 113، 63±272، 76±349، 101±288 و 99±211 گرم در سال و از لحاظ آماری معنی دار بودند و روند ژنتیکی مادری برای وزن تولد، یک ماهگی و شیرگیری به ترتیب 1±3، 2±12 و 2±28 گرم در سال برآورد شدند و از لحاظ آماری معنی دار بودند (01/0>P).
    کلید واژگان: گوسفند لری بختیاری, ارزش اصلاحی, روند ژنتیکی, وزن بدن}
    Azar Rashedi Dehsahraei, Jamal Fayazi, Mohammad Taghi Beige Nasiri, Mahmoud Vatankhah
    The aim of present study was to estimate genetic and phenotypic trends for body weight traits at some ages in Lori-Bakhtiari lambs. In this study a total of 7721 records on birth weight, 6462 records of one month weight, 7275 records of weaning weight 5745 records of 6 month weight, 3326 records of 9 month weight and 3088 records of 12 month weight of Lori-Bakhtiari sheep was used to reveal the genetic and phenotypic trend of growth traits. The data was collected in Shahrekord sheep breeding station during 1989-2010. The SAS statistical software was used to evaluate the effect of environmental factors. Wombat software was employed to estimate genetic parameters and animals breeding value. Environmental factors, like birth year, sex, birth type and the age of mother were significant factors as fixed effects (P
    Keywords: Body Weight, Breeding Value, Genetic Trend, Lori, Bakhtiari Sheep}
  • علی وجدان حسن کیاده، محمد رکوعی*، غلام رضا داشاب، احمدرضا سیدعلیان
    هدف از این پژوهش برآورد روند و فراسنجه های ژنتیکی صفت بقاء در گوسفند بلوچی است. در این پژوهش از رکوردهای بقاء 27978 راس گوسفند بلوچی مرکز اصلاح نژاد دام کشور، در سال های 1358 تا 1388 استفاده شد. صفات موردبررسی شامل صفت بقاء از 1 تا 400 روزگی و بقاء از یک روزگی تا تاریخ حذف یا تا آخرین تاریخ ثبت شده بود. فراسنجه های ژنتیکی با دو مدل حیوانی (با و بدون محیط دائم مادری) با توجه به داده های سانسورشده راست و توزیع احتمال نمایی به روش نمونه برداری گیبس برآورد شد. عامل های ثابت موثر بر صفت بقاء در مدل حیوانی شامل تاثیر سال و ماه تولد، جنس، نوع تولد و گله بودند. میانگین وراثت پذیری افزایشی برای صفات بقاء از 1 تا 400 روزگی و بقاء از یک روزگی تا آخرین تاریخ رکوردبرداری در مدل 1 و 2 به ترتیب در محدوده 135/0-159/0 و 085/0- 168/0 برآورد شد. میانگین نسبت واریانس محیط مشترک مادری محاسبه شده برای صفت بقاء از 1 تا 400 روزگی 076/0 و بقاء از یک روزگی تا آخرین تاریخ رکوردبرداری 144/0 محاسبه شد. روند ژنتیکی بقاء بر پایه دو معیار موردبررسی به ترتیب 0005/0-، 0001/0- به دست آمد که نزدیک به صفر بود. وراثت پذیری برآوردشده نشان داد، که انتخاب ژنتیکی برای صفت بقاء می تواند موثر باشد و با توجه به اهمیت این صفت در سودآوری، بهتر است در برنامه های اصلاح نژادی این صفت استفاده شود.
    کلید واژگان: روند ژنتیکی, صفت بقاء, فراسنجه های ژنتیکی, گوسفند بلوچی, نمونه گیری گیبس}
    Ali Vojdan Hassan Kiyadeh, Mohammad Rokouei *, Gholam Reza Dashab, Ahmad Reza Seyedalian
    The aim of this study was to estimate the genetic trend and genetic parameters of survival traits in Baluchi sheep using survival records from 27978 Baluchi sheep, which were collected by the Animal Breeding Center of Iran during1979 to 2009. Genetic parameters of lamb survival from 1 to 400 days of age and from 1 to the last recording date. Traits were estimated using animal model (with or without permanent environment of dam) for right censored data assuming an exponential distribution via Gibbs sampling. Effect of year and month of birth, sex, litter size and herd were assumed as fixed. The posterior mean of direct heritability for survival from 1 to 400 days of age and from 1 to the last recording date in first and second model ranged from 0.135- 0.158 and 0.085- 0.168, respectively. Posterior mean permanent variance ratio was 0.076 for survival from 1 to 400 days of age and 0.144 for survival from1 to last recording date. The genetic trend for these traits was −0.0005 and −0.001, respectively. Heritability for survival trait suggested that genetic selection for this trait would be effective in the breeding programs.
    Keywords: Baluchi sheep, genetic parameters, genetic trend, Gibbs sampling, survival trait}
  • همایون فرهنگ فر*، زکیه آزادوار، محمدباقر منتظر تربتی، محمدرضا اصغری
    زمینه مطالعاتی: در ارزیابی ژنتیکی گاوهای شیری، استفاده از رکوردهای واقعی و مدل آماری صحیح، اهمیت زیادی دارد.
    هدف
    این تحقیق، با هدف مقایسه دو روش ارزیابی ژنتیکی گاوهای هلشتاین برای صفت شیر اجرا شد.
    روش کار
    رکوردهای مورد استفاده، مربوط به صفات شیر تصحیح نشده (برای تعداد روزهای شیردهی) و شیر تصحیح شده (بر مبنای 305 روز) بودند. تعداد 332160 رکورد شیر از 332160 راس گاو شکم اول هلشتاین ایران در 2318 گله که طی سال های 1369 تا 1389 جمع آوری شده بودند، استفاده گردید. مدل های حیوانی شامل اثرات گله، سال و ماه زایش، درصد خلوص حیوان، منشا اسپرم (داخلی، خارجی و نامعلوم)، متغیرهای کمکی طول دوره ی شیردهی (برای تولید شیر تصحیح نشده)، سن زایش، و اثر تصادفی ژنتیکی افزایشی بود. برازش مدل به وسیله نرم افزار DMU اجرا گردید.
    نتایج
    وراثت پذیری صفات شیر تصحیح نشده و تصحیح شده به ترتیب 23/0 (اشتباه معیار 004/0) و 25/0 (اشتباه معیار 004/0) بود که با یکدیگر تفاوت معنی دار آماری داشتند. برای گاوهای نر، همبستگی بین ارزش اصلاحی حاصل از دو روش ارزیابی ژنتیکی، با بالا رفتن تعداد دختران آن ها، افزایش قابل ملاحظه نشان داد. مقدار روند ژنتیکی در دو شیوه ی ارزیابی مذکور برابر با 18/22 (برای شیر تصحیح نشده) و 5/18 (برای شیر تصحیح شده) کیلوگرم در سال بود که تفاوت معنی دار آماری با یکدیگر نداشتند.
    نتیجه گیری نهایی: با توجه به مزیت استفاده از رکوردهای واقعی (شیر تصحیح نشده)، پیشنهاد می گردد برای پیش بینی ارزش اصلاحی گاوهای هلشتاین ایران از رکوردهای خام شیر در مدل حیوانی استفاده شود که در آن طول دوره ی شیردهی، به صورت متغیر کمکی گنجانده شده باشد.
    کلید واژگان: روند ژنتیکی, مقدار شیر دوره ی شیردهی, گاو هلشتاین ایران}
    H. Farhangfar *, Z. Azadvar, Mb Montazar Torbati, Mr Asghari
    Background
    In dairy cattle genetic evaluation, the use of real records as well as accurate statistical model are of great importance.
    Objectives
    The main objective of the present research was to compare two methods of genetic evaluation of Holstein cows for milk yield. The records were unadjusted (for days in milk) and adjusted (for 305-days) milk yields.
    Methods
    A total of 332,160 records obtained from 332,160 first-parity Iranian Holsteins in 2,318 herds and collected from 1990 to 2010 were utilized. Animal models were used in which the effects of herd, year and month of calving, cow type (crossbred or pure), inseminated sperm (internal, external or unknown), covariables of lactation length (only for unadjusted milk trait), calving age, as well as additive genetic random effect of the cows were included. DMU software was applied to fit the models.
    Results
    Heritability of unadjusted and adjusted milk traits were 0.23 (SE=0.004) and 0.25 (SE=0.004), respectively and significantly different from each other. For the bulls, correlation between breeding values obtained from two methods considerably increased as the number of their daughters increased. The magnitude of genetic trends in two methods were found to be 22.18 (for unadjusted milk) and 18.5 (for adjusted milk) kg per year which were not significantly different from each other.
    Conclusions
    With respect to the advantage of real records, it is suggested that unadjusted milk records to be used in an animal model (with covariable of lactation length) for predicting breeding value of Iranian Holstein cattle.
    Keywords: Genetic trend, Lactation milk yield, Iranian Holstein cows}
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال