فهرست مطالب

مجله علوم دامی ایران
سال چهل و هشتم شماره 1 (بهار 1396)

  • تاریخ انتشار: 1396/03/30
  • تعداد عناوین: 10
|
  • آزاده بوستان *، الهام رضوان نژاد، اردشیر نجاتی جوارمی، نعمت هدایت ایوریق، رضا سید شریفی صفحات 1-9
    یکی از پرسش های مطرح در زمینه ارزیابی ژنگانی (ژنومیک)، تاثیرگذاری یا تاثیرگذار نبودن استفاده از حیوانات برتر به عنوان گروه مرجع، بر درستی ارزش اصلاحی برآوردی کاندیدای انتخاب است. در این تحقیق درستی ارزیابی ژنگانی در شرایطی که تنها حیوانات برتر در جمعیت مرجع بودند (راهبرد1) با شرایطی که حیوانات گروه مرجع نمونه ای تصادفی از جمعیت بودند (راهبرد2) و شرایطی که این گروه از بین برترین و ضعیف ترین حیوانات انتخاب شده بودند (راهبرد3) مقایسه شد. برای برآورد اثرات نشانگرها از مدل بهترین پیش بینی نااریب خطی استفاده شد. نتایج نشان داد که به کار بردن تنها حیوانات برتر به عنوان جمعیت مرجع می تواند باعث کاهش درستی ارزیابی ژنگانی شود. اگر نسبت حیوانات در گروه مرجع کم باشد (به طور مثال 10درصد)، تفاوت بین راهبرد1 و دیگر راهبرد ها بیشتر از شرایطی است که این نسبت زیاد باشد (به طور مثال 50درصد). به عنوان مثال در شرایطی که 10درصد حیوانات نسل چهارم (نسل پیش از گروه تایید) به عنوان جمعیت مرجع استفاده شدند، درستی ارزش های اصلاحی برآوردی راهبرد3، 34/0 بیشتر از راهبرد1 بود ولی تفاوت این دو راهبرد هنگامی که 50درصد حیوانات در جمعیت مرجع بودند، تنها 04/0 بود. نتایج نشان داد افزون بر حیوانات برتر که ارزش اصلاحی برآوردی سنتی با درستی بالا دارند، تعیین ژنوتیپ شماری از حیواناتی که از نظر ژنتیکی برتر نیستند و قرار گرفتن آن ها در جمعیت مرجع، می تواند باعث افزایش درستی ارزیابی ژنگانی شود.
    کلیدواژگان: ارزش اصلاحی برآوردشده، جمعیت مرجع، حیوانات برتر، درستی ارزیابی ژنگانی، گروه تایید
  • سمیه بارانی، محمد مرادی شهربابک *، اردشیر نجاتی جوارمی، محمدحسین مرادی، محسن قلی زاده، مجید خان سفید صفحات 11-18
    شناخت الگوی عدم تعادل پیوستگی در جمعیت های مختلف اطلاعات سودمندی برای بررسی های انتخاب ژنومیک (ژنومیک) (GS) و پویش ژنوم یا ژنوم (GWAS) و شناخت معماری ژنتیکی صفات از طریق بررسی فاز پایداری عدم تعادل پیوستگی بین نشانگر و جایگاه صفت کمی فراهم می کند. هدف از این پژوهش بررسی عدم تعادل پیوستگی در سه نژاد از گوسفندان بومی ایران (بلوچی، لری-بختیاری و زل) است. بدین منظور از 186 نمونه گوسفند (شامل 96 نمونه بلوچی، 45 نمونه لری بختیاری و 45 نمونه زل) خون گیری به عمل آمد و با استفاده از آرایه های Ovine 50K SNPChip شرکت ایلومینا تعیین ژنوتیپ و آنگاه عدم تعادل پیوستگی در هر نژاد با استفاده از آماره r2 اندازه گیری شد. بنابر نتایج این بررسی، بیشترین میانگین LD در فاصله های کمتر از Kb10 در نژاد بلوچی، لری بختیاری و زل به ترتیب 323/0±392/0، 308/0±360/0 و 306/0±340/0 برآورد شد. بررسیLD در کروموزوم های اتوزوم هر نژاد، کروموزوم های 24 و 25 در نژاد بلوچی، 9 و 21 در نژاد لری بختیاری و 23 و 24 در نژاد زل بیشترین میانگین r2 را داشتند. بررسی همبستگی عدم تعادل پیوستگی بین نژادهای مختلف، بیشترین پایداری فاز LD را بین نژادهای زل و لری بختیاری نشان داد که احتمال دارد ناشی از وجود نیاکان مشترک بین این نژادها باشد. هر چه میزان LD بالاتر باشد تراکم نشانگری پایین تری در بررسی های ارتباطی مورد نیاز است. نتایج این بررسی مشخص کرد برای به دست آمدن صحت 85 درصدی (با فرض اینکه دیگر عامل های موثر بر صحت انتخاب ژنومیک برطرف شده باشد) در بررسی های انتخاب ژنومیک و GWAS به آرایه هایی با تراکم نشانگری بالاتر از 50K نیاز خواهد بود.
    کلیدواژگان: انتخاب ژنومیک، پویش ژنومیک، لری، بختیاری، زل، بلوچی، عدم تعادل پیوستگی
  • سهیلا آذرزرتشت، احمد کریمی *، قربانعلی صادقی صفحات 19-28
    این آزمایش به منظور تعیین میزان تاثیر سطوح مختلف تعادل آنیون-کاتیون جیره در مرحله آغازین (1 تا 10 روزگی) بر عملکرد جوجه های گوشتی، میزان کانی شدن استخوان درشت نی، الکترولیت های سرم، ویژگی های لاشه و ریخت شناسی روده باریک انجام گرفت. در این آزمایش از 280 قطعه جوجه گوشتی سویه راس 308 در قالب طرح کامل تصادفی استفاده شد. گروه های آزمایشی عبارت از پنج سطح مختلف تعادل آنیون-کاتیون جیره (150، 200، 250، 300 و 350 میلی اکی والان در کیلوگرم) در چهار تکرار و هر تکرار شامل چهارده قطعه جوجه بودند. نتایج نشان داد که تغذیه با استفاده از جیره دارای تعادل آنیون-کاتیون 350 میلی اکی والان در کیلوگرم، موجب کاهش وزن زنده و میانگین افزایش وزن در دوره های آغازین و رشد، کاهش مصرف خوراک و افزایش ضریب تبدیل خوراک در دوره آغازین شد. تعادل آنیون-کاتیون جیره بدون تاثیر معنی داری روی الکترولیت های سرم، وزن نسبی اجزاء لاشه و ریخت شناسی روده بود. کاهش سطح آنیون-کاتیون جیره به کمتر از 300 میلی اکی والان در کیلوگرم، بدون تاثیر بر خاکستر استخوان، موجب کاهش معنی دار (05/0>P) فسفر و کلسیم درشت نی به ترتیب در سنین 21 و 42 روزگی شد. به طورکلی نتایج بیانگر اهمیت تامین سطح مناسب تعادل آنیون-کاتیون جیره در مرحله آغازین (200 تا 300 میلی اکی والان در کیلوگرم جیره) برای دستیابی به عملکرد بهینه در جوجه های گوشتی است.
    کلیدواژگان: تعادل الکترولیت ها، جوجه گوشتی، عملکرد، فسفر، کلسیم
  • شاهپور خیرآبادی، مهدی دهقان بنادکی*، مهدی گنج خانلو صفحات 29-37
    هدف از این تحقیق بررسی تاثیر جایگزینی سطوح مختلف چربی و انواع مکمل های آن به جای منابع نشاسته ای جیره بر عملکرد رشد، تخمیر شکمبه ای و شاخص های خونی در تغذیه گوساله های نر پرواری هلشتاین بود. در این آزمایش 28 راس گوساله نر پرواری هلشتاین Kg BW)9/31±274) در قالب طرح کامل تصادفی به مدت صد روز با چهار جیره غذایی (1- سطح بالای چربی اشباع شده، 2- سطح پایین چربی اشباع شده، 3- سطح بالای چربی غیراشباع، 4- سطح پایین چربی غیراشباع) تغذیه شدند. جیره ها صورت هم انرژی و هم پروتئین ترکیب و مخلوط (فرموله) شدند. شاخص های عملکردی مربوط به مصرف خوراک روزانه و تغییرپذیری وزن بدن به صورت روزانه محاسبه شد. نتایج مربوط به تغییر وزن روزانه، وزن نهایی، مصرف خوراک روزانه و ضریب تبدیل غذایی تفاوتی را میان تیمارها نشان ندادند. شاخص های شکمبه ای و خونی نیز اندازه گیری شدند و بین میانگین تیمارها تفاوت معنی داری دیده نشد، غیر از سطح کلسترول خون که در تیمارها با سطح چربی بالا میزان بالاتری (05/0P<) داشت. درنهایت با توجه به شاخص های اندازه گیری شده مشخص شد که با در نظر گرفتن هزینه نهایی جیره ها و دسترسی به مواد خوراکی مختلف می توان از پودر چربی برای تامین انرژی جیره پرواری استفاده کرد.
    کلیدواژگان: گوساله پرواری، پودر چربی، نشاسته
  • محمدحسین مرادی*، امیرحسین خلت آبادی فراهانی، اردشیر نجاتی جوارمی صفحات 39-49
    هدف از این تحقیق برآورد اندازه موثر (Ne) برخی از نژادهای گوسفند ایرانی با استفاده از اطلاعات نشانگرهای SNP در سطح ژنگان (ژنوم) بود. به این منظور از اطلاعات ژنگانی مجموع 217 نمونه حیوان شامل 45، 37، 34، 35، 45 و 11 نمونه به ترتیب از نژادهای زل، افشاری، مغانی، قزل، لری بختیاری و یک نژاد گوسفند وحشی ایرانی که با استفاده از آرایه های Illumina OvineSNP50K Beadchip تعیین ژنوتیپ شده اند، استفاده شد. این تحقیق با همکاری پروژه Sheep HapMap انجام شد. اندازه موثر با استفاده از اطلاعات نداشتن تعادل پیوستگی (لینکاژی) در طی 4 تا 3500 نسل پیش محاسبه شد. نتایج تجزیه مولفه های واریانس (PCA) نشان داد که همه نژادها با استفاده از دو مولفه اول از همدیگر مجزا می شوند. میانگین ناخالصی (هتروزیگوسیته) مورد انتظار و مشاهده شده در نژادهای مختلف به ترتیب در دامنه 37/0-36/0 و 43/0-37/0 به دست آمد. نتایج به دست آمده از محاسبه اندازه موثر در نژادهای مختلف، نشان دهنده روند کاهش تدریجی Ne در طی 3500 سال گذشته تاکنون با یک شیب کاهشی زیاد در حدود 550 نسل پیش برای همه نژادها بود. اندازه Ne در نسل های حاضر (4 نسل قبل) در نژادهای گوسفند ایرانی در دامنه 89-9 راس بود. بیشترین Ne در نژاد زل (89 راس) و کمترین در نژادهای افشاری (44 راس) و نژاد وحشی گوسفند (9 راس) مشاهده شد. درمجموع، نتایج این تحقیق نشان داد که باوجود تنوع ژنتیکی مناسب در این جمعیت ها، اندازه موثر آن ها به ویژه در نژاد گوسفند افشاری و نژاد وحشی در طی نسل های اخیر به شدت کاهش یافته است و طراحی برنامه های مناسب برای حفاظت از حیوانات خالص باقی مانده این نژادهای بومی ضروری است.
    کلیدواژگان: تجزیه مولفه واریانس، ژنتیک حفاظت، نژادهای گوسفند ایرانی، ناخالصی، نشانگرهای تک نوکلئوتیدی
  • هانیه رمضانی نژاد، محمد روستایی علی مهر* صفحات 51-59
    این آزمایش برای بررسی عصاره الکلی برگ رزماری بر ذخیره سازی اسپرم خروس در °C 4 آزمایشی با استفاده از هشت قطعه خروس بالغ انجام شد. گرد آوری منی سه روز یک بار در پنج نوبت انجام شد. انزال ها در هر نوبت پس از تجمیع به شش قسمت تقسیم و مقدار 0 (R0)، 10 (R10)، 20(R20)،30 (R40)، 40 و 50 (R50) میکروگرم عصاره الکلی رزماری در میلی لیتر به هر قسمت اضافه شد. سپس نمونه ها تا °C 4 سرد شد و به مدت 72 ساعت در این دما نگهداری شد. در زمان های 0 (T0)، 24 (T24)، 48 (T48) و 72 (T72) ساعت ذخیره سازی، سلامت غشای پلاسمایی، زنده مانی (رنگ آمیزی هوخست 33258) و تحرک اسپرم ارزیابی شد. در زمان 48 به منظور بررسی پراکسیداسیون چربی، غلظت مالون دی آلدهید (MDA) در یک میلیون اسپرم اندازه گیری شد. نتایج نشان داد، غلظت MDA در تیمار R50 (nM 93/0) کمتر از شاهد (nM15/1) و بیشتر از R40 (nM82/0) بود (05/0>P). سلامت غشای پلاسمایی و زنده مانی اسپرم در غلظت های μg/mL 40 عصاره الکلی رزماری (به ترتیب 72/75درصد و 56/73درصد) از غلظت های 0 (به ترتیب 60/70درصد و 08/69درصد) و μg/mL 10 (به ترتیب 56/71درصد و72/69درصد ) عصاره بیشتر بود (05/0>P). اثر متقابل عصاره الکلی رزماری و زمان ذخیره سازی بر تحرک پیش رونده اسپرم خروس معنی دار بود (05/0>P). پس از 72 ساعت، تحرک پیش رونده اسپرم در تیمار R40 (46درصد) بیشتر از تیمارهای R0 (34درصد)، R10 (6/35درصد) و R20 (8/38درصد) بود (05/0>P). بنابراین عصاره الکلی رزماری سبب بهبود کیفیت اسپرم خروس طی ذخیره سازی در °C 4 شد.
    کلیدواژگان: اسپرم، پراکسیداسیون چربی، خروس، عصاره زرماری
  • هما سلیمانی، رسول واعظ ترشیزی*، مرادپاشا اسکندری نسب، سید رضا میرایی آشتیانی، محمدحسین شهیر صفحات 61-67
    در این بررسی از اطلاعات مربوط به 37300 رکورد وزن تخم مرغ و 1540 رکورد وزن سفیده، وزن زرده، وزن پوسته، استحکام پوسته، ضخامت پوسته و واحد هاو مرغ های بومی مازندران برای برآورد فراسنجه های ژنتیکی ویژگی های کیفی تخم مرغ استفاده شد. رکوردهای وزن تخم مرغ در طی سال های 1371 تا 1385 و دیگر رکوردها در سال 1385 از تخم مرغ های 3 روز متوالی 769 مرغ گرد آوری شده بود. برآوردها با روش حداکثر درستنمایی محدود شده (REML) و مدل حیوان چند صفتی انجام گرفت. وراثت پذیری وزن تخم مرغ، وزن سفیده، وزن زرده، وزن پوسته، استحکام پوسته، ضخامت پوسته و واحد هاو به ترتیب 471/0، 747/0، 334/0، 595/0، 218/0، 465/0 و 532/0 برآورد شدند. همبستگی ژنتیکی افزایشی واحد هاو با وزن سفیده مثبت (11/0) و با دیگر ویژگی های منفی ولی کم برآورد شد. وزن تخم مرغ با ویژگی های وزن زرده (45/0)، وزن آلبومین (95/0)، وزن پوسته (73/0) و ضخامت پوسته (39/0) همبستگی ژنتیکی افزایشی مثبت و بالا داشت. دامنه تغییر همبستگی های ژنتیکی افزایشی دیگر ویژگی ها از 04/0 (بین وزن سفیده و استحکام پوسته) تا 81/0 (بین وزن پوسته و ضخامت پوسته) بود. این برآوردها برای همبستگی های فنوتیپی از 13/0- (بین وزن زرده و واحد هاو) تا 95/0 (بین وزن تخم مرغ و وزن سفیده) متغیر بود. این نتایج نشان داد که با انتخاب بر پایه وزن تخم مرغ می توان وزن زرده، وزن آلبومین و کیفیت پوسته را افزایش داد.
    کلیدواژگان: فراسنجه های ژنتیکی، مدل حیوان، مرغ بومی مازندران، ویژگی های تخم مرغ
  • نیلوفر بلندی، سید رضاهاشمی *، داریوش داودی، بهروز دستار، سعید حسنی، امین عشایری زاده صفحات 69-75
    برای ارزیابی تاثیر پوشش دهی زئولیت با ذرات نانونقره بر خصوصیات عملکردی و وزن اندام های کبد، طحال و بورس فابریسیوس در جوجه های گوشتی، آزمایشی با استفاده از 375 قطعه جوجه سویه کاب در قالب طرح کاملا تصادفی با پنج تیمار، پنج تکرار و 15 جوجه در هر تکرار انجام شد. تیمارهای آزمایشی شامل جیره پایه و جیره پایه حاوی یک درصد زئولیت پوشش داده شده با سطوح مختلف نانوذرات نقره (صفر، 25، 50 و 75 قسمت در میلیون یاppm ) بودند. عملکرد جوجه ها به طور هفتگی اندازه گیری، و بازده استفاده از انرژی و پروتئین به صورت دوره ای محاسبه شدند. در روزهای 21 و 42 دو جوجه از هر واحد آزمایشی جهت اندازه گیری وزن اندام های درونی کشتار شدند. بر اساس نتایج به دست آمده، افزایش وزن و میزان خوراک مصرفی در هفته های مختلف پرورش، بین تیمارهای این پژوهش معنی دار نبود. با این حال نانوذرات نقره به طور معنی داری موجب بهبود بازده استفاده از انرژی و پروتئین در دوره رشد و همچنین کل دوره پرورش در تیمارهای آزمایشی شد (05/0> P). با افزایش سطح نانوذرات نقره، وزن نسبی کبد افزایش و وزن نسبی بورس کاهش یافت (05/0> P). نتایج نشان می دهد که استفاده از زئولیت پوشش داده شده با نانونقره در خوراک دام می تواند باعث افزایش بهره وری از انرژی و پروتئین در جوجه های گوشتی گردد.
    کلیدواژگان: آغازین، بازدهی، رشد، خوراک مصرفی، عملکرد
  • احسان شهرامی* صفحات 77-87
    هدف از این آزمایش بررسی تاثیر استفاده از رژیم های غذایی غیرفیبری و فیبری در مقایسه با روش رایج گرسنگی بر عملکرد و فعالیت میکروبی و تولید تخمیری دستگاه گوارش مرغان تخم گذار تولک برده شده بود. بدین منظور از 180 قطعه مرغ تخم گذار تجاری (های لاین 36W) در قالب طرح کامل تصادفی با پنج تیمار، شش تکرار و شش پرنده در هر تکرار به مدت دوازده روز استفاده شد. تیمارهای آزمایشی شامل: 1- شاهد (تغذیه جیره تخم گذاری)، 2- محروم از خوراک (در حالت گرسنه)، 3- تغذیه جیره تخم گذاری حاوی اکسید روی، 4- تغذیه جیره تخم گذاری در سطح 10 درصد به همراه 90 درصد پودر یونجه و 5- تغذیه جیره تخم گذاری در سطح 10 درصد به همراه 90 درصد کنجاله پالم بودند. تولید پرندگان در دوره پس از تولک، به مدت 12 هفته ثبت شد. نتایج نشان داد،در انتهای دوره تولک جمعیت باکتری های لاکتوباسیلوس و اشریشیاکلی محتویات روده کور (سکوم) به ترتیب در پرنده های تغذیه شده با تیمار حاوی کنجاله پالم و تیمار محروم از خوراک به طور معنی داری بالاتر از دیگر تیمارها بود (05/0P<)؛ همچنین غلظت کل اسیدهای چرب فرار روده کور در تیمار حاوی پودر یونجه به طور معنی داری بیش از دیگر تیمارهای آزمایشی بود (05/0P<). میانگین توده تخم مرغ تولیدی نیز به طور معنی داری در تیمارهای تغذیه ای بالاتر از گروه شاهد و گرسنه بود (05/0P<). نتایج به دست آمده از این آزمایش نشان داد، جیره های غذایی حاوی فیبر در مقایسه با رژیم غیر فیبری و رژیم گرسنگی سبب افزایش جمعیت باکتری های سودمند و تولیدهای تخمیری روده کور گشته و تاثیر مطلوبی بر تولید پس از تولک داشت.
    کلیدواژگان: اسیدهای چرب فرار، اشریشیاکلی، تولک بری، لاکتو باسیلوس، مرغان تخم گذار
  • محمد تقی علیپور، آرش آذرفر*، علی کیانی، مجید خالداری صفحات 89-99
    این پژوهش با هدف بررسی تاثیر استفاده از موننسین و متافیکس به تنهایی و یا به صورت مخلوط بر فراسنجه های تخمیر شکمبه و الگوی اسیدهای چرب عضله راسته بره های نژاد فراهانی اجرا شد. جیره های آزمایشی شامل جیره بدون موننسین و متافیکس (شاهد)، 2) جیره شاهد حاوی 24 میلی گرم در کیلوگرم موننسین (موننسین) ، 3) جیره شاهد با 4 گرم در کیلوگرم متافیکس (متافیکس) و 4) جیره شاهد حاوی 24 میلی گرم موننسین و 4 گرم در کیلوگرم متافیکس (موننسین+متافیکس) بود. افزودن موننسین به تنهایی و یا همراه با متافیکس باعث کاهش غلظت استات در شکمبه شد (05/0>P). درحالی که مکمل سازی جیره با موننسین، متافیکس و یا مخلوط آن ها غلظت پروپیونات را در شکمبه افزایش داد (05/0>P). افزودن موننسین و متافیکس و مخلوط آن ها باعث افزایش معنی دار در اسیدهای چرب لوریک، مریستیک و مارگاریک و در مقابل کاهش در اسیدهای چرب پالمیتیک، استئاریک و بهینیک عضله راسته در مقایسه با گروه شاهد شد (05/0>P). تیمارهای آزمایشی تاثیری بر مقادیر اسیدهای چرب تک اشباع (به استثنای اسید نرونیک)، ایکوزاتترانوئیک، آراشیدونیک، ایکوزانونیک و آلفا-لینولئیک عضله راسته نداشت (05/0P). نتیجه اینکه موننسین و متافیکس هر دو می توانند برای ایجاد تغییر در فراسنجه های تخمیر شکمبه و ترکیب اسیدهای چرب گوشت بره های پرواری موثر باشند، هرچند سازوکار دقیق تاثیر آن ها نیاز به تحقیقات بیشتر ضروری است.
    کلیدواژگان: اسیدهای دی کربوکسیلیک، بره های پرواری، ترکیب اسیدهای چرب گوشت، فراسنجه های تخمیر شکمبه، یونوفر
|
  • Azade Boustan *, Elham Rezvannejad, Ardeshir Nejati Javaremi, Reza Seyedsharifi Pages 1-9
    An important question about genomic evaluation is the effectiveness of using superior animals as reference population, on the accuracy of estimated breeding values of selection candidates. In this research, the accuracy of genomic evaluation is selecting superior animals as reference population (strategy1) was compared to situations in which the animals in reference population were a random sample of population (strategy2) and superior and inferior animals (strategy3). Best linear unbiased prediction method was used to estimate marker effects. The results showed that using only superior animals as reference population would decrease the accuracy of genomic evaluation. If the ratio of animals in the reference group is low (for example 10%) the difference between strategy1 and the other strategies would be more than the situation in which this ratio is high (for example 50%). For example in situation that the generation before validation set (generation four) was used as reference population, the accuracy of strategy1 was about 0.34 lower than strategy3 when 10% of animals were used as reference population but this difference was decreased to 0.04 when 50% of animals were used as reference population. These results showed that genotyping and using some of no superior animals in the reference population, beside to superior animals with high accurate traditional estimated breeding values, could lead to increase in the accuracy of genomic evaluation.
    Keywords: Accuracy of genomic evaluation, estimated breeding value, reference population, superior animals, validation set
  • Somayeh Barani, Mohammad Moradi-Shahrbabak *, Ardeshir Nejati-Javaremi, Mohammad Hosein Moradi, Mohsen Gholizadeh, Majid Khansefid Pages 11-18
    Understanding the pattern of linkage disequilibrium (LD) in different populations provides useful information for genomic selection (GS), genome wide association studies (GWAS) and identification of genetic architecture of traits by estimating the persistence of LD phase between markers and quantitative trait loci (QTL). The aim of this research was to estimate of the extent of LD in three Iranian native sheep breeds. Therefore, 186 blood samples were taken from three sheep breeds (96 Baluchi, 45 lori-Bakhtiari and 45 Zel) and genotyped by Illumina ovine 50K SNPChip, then linkage disequilibrium in any breed were measured using r2. The results showed that the highest average values of r2 at inter marker distance of less than 10Kb were 0.392± 0.323, 0.360±0.308 and 0.340±0.306 in Baluchi, Lori-Bakhtiari and Zel, respectively. The highest average values of r2 in autosome chromosomes of each breed were obtained for chromosome 24 and 25 in Baluchi, 9 and 21 in Lori-Bakhtiari and 23 and 24 in Zel. The amount of LD reduced with increasing the distance between markers, the extent of LD was less than 0.1 at inter marker distances greater than 100Kb. The comparison of correlation coefficients LD between different breeds showed a strong persistence of LD phase between Zel and Lori-Bakhtiari breeds which is probably due to recent common ancestors between these two breeds. Generally, with increase amount of LD means that lower marker density in association studies will be required. The results of this study showed to achieve genomic prediction accuracy of 85% (assuming there is no other accuracy limiting factor) and robust GWAS results, the density of markers must be higher than 50K SNPChip.
    Keywords: Blochi, Genomic selection (GS), Genome Wide Association Studies (GWAS), Linkage disequilibrium, Lori-Bakhtiars, Zel
  • Sohaila Azarzartosht, Ahmad Karimi *, Gorbanali Sadeghi Pages 19-28
    This experiment was carried out to investigate the effects of starter period’s (1 to 10 d) dietary cation-anion balance on performance, tibia bone mineralization, serum electrolyte level, carcass characteristics and small intestine morphology. A total of 280 day-old broiler chicks of Ross 308 strain were used in a completely randomized design. Treatments consisted of five different level of dietary cation-anion balance (150, 200, 250, 300, and 350 mEq/Kg) and each of them replicated four times (14 birds per replicate). The results showed that feeding a diet with anion-cation balance of 350 mEq/Kg, significantly (P0.05) effects on tibia bone ash content, but significantly (P
    Keywords: Broiler chicken, Calcium, electrolyte balance, Performance, Phosphorus
  • Shahpour Kheirabadi, Mehdi Dehghan-Banadaky *, Mehdi Ganjkhanlou Pages 29-37
    The aim of this study was to evaluate the effect of starch sources replacement by fat supplements on growth performance, rumen fermentation and blood metabolite parameters of Holstein young bulls. 28 Holstein young bulls (274±31 Kg BW) were fed with four diets containing 1) diet with high level of saturated fat supplement 2) diet with low level of saturated fat supplement 3) diet with high level of unsaturated fat supplement and 4) low level of unsaturated fat supplement for in completely randomized design duration about 100 days. Diets were formulated to be isoenergetic and isonitrogenous. Body weight changes and dry mater intake, were measured montly and daily repectively. Daily body weight gain, final weight, DMI and feed conversation rate were not different between treatments. Individual volatile fatty acids concentration not affected by treatments. Blood metabolite parameter were measured and there was no significant effect observed between treatments except for total cholesterol which in diets with high level of crude fat (6.9%) was grater (p
    Keywords: Fat supplement, feedlot steers, starch
  • Mohammad Hossein Moradi *, Amir Hossein Farahani, Ardeshir Nejati-Javaremi Pages 39-49
    The aim of the present study was to estimate the effective population size (Ne) in some Iranian sheep breeds using genome wide SNP data. A total of 217 animal samples consisting of 45, 37, 34, 35, 45 and 11 samples from Zel, Afshari, Moghani, Qezel, Lori-Bakhtiari and a wild-type of Iranian sheep breeds, genotyped by Illumina OvineSNP50K Beadchip assay were used in this study respectively. This study has been performed in collaboration with the Ovine HapMap project. The Ne was estimated using linkage disequilibrium across 4 up to 3500 generations ago. The result of principal component analysis (PCA) indicated that all breeds will be separated from each other in the first two principal components. Average expected and observed heterozygosity for different breeds ranged 0.36-0.37 and 0.37-0.43 respectively. The Ne results showed a decreasing trend over the last 3500 generations for all breeds, with an increasingly slope since about last 550 generations. The Ne in Iranian sheep breeds for 4 generations ago were ranged from 9 up to 89. The highest historically effective population size was found for Zel breed (89 heads) and the lowest for Afshari (44 heads) and wild_type (9 heads) sheep breeds. Generally, the results indicated that although a considerable genetic variation exists in these populations, however Ne has been decreased strongly in Iranian sheep breeds especially in Afshari and wild-type sheep breeds during recent years and designing of appropriate programs is necessary to conserve remaining purebred animals of these indigenous sheep breeds.
    Keywords: effective population size, genetic conservation, genome wide evaluation, Iranian sheep breeds
  • Haniyeh Ramezaninejad, Mohammad Roostaei Ali Mehr * Pages 51-59
    Current experiment was conducted to evaluate the effect of alcoholic extract of rosemary leaves on rooster sperm storage at 4 °C by using eight mature roosters. Semen collection was performed three days’ interval in 5 times. In each session, ejaculates were pooled, split into six parts and the amounts of 0 (R0), 10(R10), 20 (R20), 30 (R30), 40 (R40) and 50 µg/mL (R50) of rosemary extract were added to each part. After that, samples were chilled to 4 ℃ and kept until 72 h. Sperm viability (by staining Hoechst 33258), motility and functional membrane integrity were evaluated at 0 (T0), 24 (T24), 48 (T48) and 72 h (T72). Concentration of malondialdehyde (MDA) was determined to assay lipid peroxidation by one million spermatozoa at 48 h. The results showed that the concentration of MDA was lower in R50 (0.93 nM) than control (1.15 nM), but, it was higher than R40 (0.82 nM, P
    Keywords: lipid peroxidation, rooster, rosemary extract, Spermatozoa
  • Homa Soleimani, Rasoul Vaez Torshizi *, Morad Pasha Eskandari Nasab, Seyed Reza Mirati Ashtiani, Mohammad Hossein Shahir Pages 61-67
    A total of 37300 records of egg weight (EW) and 1540 records of egg quality traits, namely, albumen weight (AW), yolk weight (YW), egg shell weight (ESW), egg shell strength (ESS), egg shell thickness (EST) and haugh unit (HU) of Mazandaran native hens were used to estimate genetic and phenotypic parameters. Egg weight data collected during 1991 to 2006 and egg quality traits were measured in 3 consecutive days on 769 hens. Data were analyzed with restricted maximum likelihood procedure by using multiple-trait animal model. Estimates of heritabilities were 0.471, 0.747, 0.334, 0.595, 0.218, 0.465 and 0.536 for EW, AW, YW, ESW, ESS, EST and HU, respectively. The genetic correlation between HU and AW was positive and low (0.11), whereas it was negative and low with other egg quality traits. The EW had a positive and high genetic correlation with AW (0.95) and moderate with YW (0.45) and EST (0.39). The range of genetic correlations among all other traits varied from 0.04 (between AW and ESS) to 0.81 (between EST and ESS). These estimates for phenotypic correlations ranged from -0.13 (between YW and HU) to 0.95 (between EW and YW). These results indicated that selection based on EW may increase YW, AW and egg shell quality.
    Keywords: Animal Model, egg quality traits, genetic parameters, Mazandaran native hen
  • Niloofar Bolandi, Seyed Reza Hashemi *, Daryoush Davoodi, Behrooz Dastar, Saeed Hassani, Amin Ashayerizadeh Pages 69-75
    This experiment was carried out to study the effect of coating zeolite with nanosilver on performance, energy and protein efficiency and the weight of liver, spleen and burs of fabricius in broilers, using 375 Cobb strain chicks in a completely randomized design with five treatments, five repetitions and 15 chicks in each replicate. Treatments were included basal diet and basal diet supplemented with one percent zeolite coated with different levels of nanosilver (zero, 0.25, 0.50 and 0.75 ppm). Broilers performance investigated weekly. Energy and protein efficiency were calculated in each period of production. On days of 21 and 42 two birds from each experimental unit were slaughtered to measure the weight of internal organs. The results didn’t show any significant different in weight gain and feed intake between exmerimental diets. The efficiency of energy and protein increased significantly on grower period and total period of production (p
    Keywords: Efficiency, feed intake, grower, Performance, starter
  • Ehsan Shahrami * Pages 77-87
    The objective of this experiment was to studythe effects of fiber-rich molting diets as alternative to the conventional feed withdrawal method, on performance, gastro intestinal fermentation and microbial activity of laying hens. One hundred eighty Hy-line (W36) laying hens were used in a completely randomized design with 5 treatments and 6 replicates by 12 birds in each replication during 12 days. Treatments were: 1- control group (hens fed with a layer diet), 2- feed withdrawal group, 3- laying hen diet containing 20000 mg zinc oxide/kg, 4- laying hen diet diluted by adding 90% alfalfa meal, 5- laying hen diet diluted by adding 90% palm kernel meal. Egg production of hen was monitored for 12 weeks during post molting period. Results show that lactobacilli and Escherichia coli bacteria population was significantly greater (P
    Keywords: Escherichia coli, Lactobacillus, Laying hens, molting, volatile fatty acids
  • Mohammad Taghi Alipour, Arash Azarfar *, Ali Kiani, Majid Khaldari Pages 89-99
    This study was conducted to evaluate the effects of dietary inclusion of monensin alone or in combination with Methafix (a commercial product containing malate and fumarate) on rumen fermentation parameters and fatty acids composition of longissimus dorsi muscle (LD) of Farhani finishing lambs. Twenty four male Farhani lambs (4-6 months old, average body weight 35.9 ± 7.4 kg) were used. The lambs were randomly divided into four groups and individually fed with one of the four dietary treatments; control diet (Control), Control plus 24 mg of monensin/kg of DM (Monensin), control plus 4 g of Methafix/kg DM (Metafix) and Controlplus 24 mg of monensin and 4 g of Methafix/kg DM (MonMet). Results showed that Monensin and/or MonMet decreased acetate (P0.05). However, dietary supplementation with M and ME increased LM concentrations of docosahexaenoic, docosatetraenoic, eicosapentaenoic and omega-3 fatty acids in comparison with control (P
    Keywords: Fatty acids composition, volatile fatty acids, di-carboxylic acids, ionophers fattening lamb