آن حضرت، روز دوشنبه، سوم صفر سال 57 هجری در مدینه منوره متولد شد. ایشان در واقعه عاشورا حضور داشت و در آن وقت 4 سال از سن مبارکش گذشته بود. پدرش حضرت علی بن الحسین زین العابدین و سیدالساجدین است و مادرش فاطمه دختر امام حسن مجتبی(ع) است. اسم شریف آن حضرت محمد و کنیه ایشان ابوجعفر است. مشهورترین لقب ایشان باقر است زیرا او علم و دانش را شکافت و اسرار آن را آشکار ساخت و پرده از روی آن برداشت. رافع، شاکر و هادی از دیگر القاب آن حضرت است. آمدن امام مقدمه ای بود برای اقدام به وظایف دگرگون سازی امت. زیرا امت، او را فردی منحصر از فرزندان کسانی می شناخت که جان خود را فدا کردند تا موج انحراف که نزدیک بود