یک سوال اساسی اینکه چرا در کشورهای توسعه یافته در کنار دانشگاه های قوی و چند صد ساله، پژوهشگاه ها، اندیشکده ها و مراکز تحقیقاتی مادر ایجاد و توسعه داده شده اند؟ رسالت ذاتی دانشگاه ها، آموزش افراد متخصص در رشته های مختلف و در سطوح مختلف برای اهداف متفاوت است. در مقاطع تحصیلات تکمیلی علاوه بر هدف فوق، هدف دیگری نیز در راستای رسالت دانشگاه ها تعریف شده است: آموزش تحقیق. این مهم در قالب پایان نامه های دانشجویی مقاطع کارشناسی ارشد و دکترا انجام می شود و نتایج آن مهم ترین خروجی پژوهشی دانشگاه هاست. حال که دانشگاه ها به هر دو مقوله آموزش و پژوهش می پردازند، چه نیازی به وجود پژوهشگاه ها، اندیشکده ها