با وجود مراکز پژوهشی متعدد در کشور (به دلایل گوناگون از جمله وجود نیروهای نخبه دانشجو در مقاطع تحصیلات تکمیلی)، انتظار از دانشگاه ها برای انجام پژوهش هایی که آثار سودمند آن به صورت مستقیم یا غیرمستقیم به جامعه برسد، زیاد است. در مورد سهم بودجه پژوهشی از تولید ناخالص ملی و کم بودن آن در کشور در مقایسه با بسیاری از کشورها، مطالب مختلفی منتشر شده است که در اینجا قصد بازگوکردن آنها را نداریم. این نوشتار با امید به اختصاص بودجه مناسب پژوهشی به همه مراکز پژوهشی داخل کشور، به برخی چالش های پیش روی دانشگاه ها می پردازد. به نظر می رسد پژوهش های دانشگاهی در کشور ما در معرض آسیب های جدی است آن گونه که در بیشتر موارد، فواید پژوهش ها برای عموم مردم محسوس نیست.