هنگامی «سلطان حسین بایقرا» در سال 911 ه.ق. درگذشت، فرزندانش بر سر قدرت نزاع کردند. به این ترتیب در خراسان آشوب و نابسامانی فزونی یافت. از طرف دیگر «شیبانیان» که از مدت ها پیش در ماوراءالنهر صاحب قدرت شده بودند، عزم تصرف هرات را کردند. شیبانی خان هرات را در سال 913 ه.ق. به تسلط خود درآورد. «بدیع الزمان میرزا» فرزند سلطان حسین بایقرا نیز به ناچار به شاه اسماعیل در غرب ایران پناهنده شد. در نتیجه شیبانی خان فرصت را مغتنم شمرده و شماری از هنرمندان و کتب نفیس کتابخانه های هرات را به بخارا منتقل کرد. بعضی معتقدند که «بهزاد» جزو این گروه از هنرمندان بود که بعدها به هرات بازگشت.