تجزیه و تحلیل منابع EST در گندم، برنج، پنبه و فستوکا تحت تنش خشکی به منظور بررسی بیان ژن و ژنومیکس عملکردی

تنش خشکی از موانع اصلی در تولید محصولات زراعی محسوب می شود. این تحقیق به منظور شناسایی ژن های دخیل در به کمک تجزیه و تحلیل اطلاعات EST کتابخانه گیاهان گندم، برنج، پنبه و فستوکا انجام شد. اطلاعات اولیه چهار کتابخانه از بانک اطلاعاتی دانشگاه هاروارد جمع آوری شدند. در بررسی شباهت بین کتابخانه ها، همه توالی های EST با استفاده از نرم افزار EGassembler هم گذاری شدند. سپس همه کانتیگ ها به وسیله جستجوگر بلاست X توسط نرم افزار CLC Protein Workbench در مقابل پروتئین های غیر تکراری بانک ژن با 5-10×1E-value≤ تجزیه شدند. در شناسایی ژن های با بیان متفاوت در بین کتابخانه ها، نرم افزارIDEG6 مورد استفاده قرار گرفت. ژن های لیپید ترنسفراز، گلوتاتیون اس ترنسفراز، دهیدرین، متالوتیونئین، فسفاتازها، پروتئین های فراوان در اواخر جنین زائی از جمله ژن های مهم دخیل در پاسخ به تنش خشکی در چهار کتابخانه برنج، گندم، پنبه و فستوکا محسوب می شوند. چهار کتابخانه در گروه های کارکردی فتوسنتز، مسیر اکسایشی پنتوز فسفات، انتقال الکترون، دیواره سلولی، متابولیسم اسید آمینه، هورمون ها، اکسایش-کاهش، گروه کارکردی متفرقه، متابولیسم کربوهیدرات، تنش، متابولیسم نوکلئوتید، متابولیسم ثانویه، پروتئین و علامت دهی اختلافات معنی دار داشتند که نشان دهنده این است که این چهار گیاه با بکارگیری گروه های کارکردی متفاوتی به تنش خشکی پاسخ می دهد.