الگوی تنوع ژنتیکی جمعیت در بادرنجبویه Melissa officinalis L براساس نشانگرهای IRAP
نویسنده:
چکیده:
تجزیه تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت در گیاهان دارویی، گام ضروری در نگهداری، استفاده و اصلاح آن ها است. در این مطالعه، هفت آغازگر طراحی شده براساس توالی های تکراری بلند انتهایی (LTRs) رتروترانسپوزون های جو و ترکیبات آن ها برای تکثیر قطعات DNA از 12 اکوتیپ ایرانی و دو جمعیت خارجی از آلمان و ژاپن براساس تکنیک IRAP استفاده شدند. مجموعه هشت آغازگر با چند شکلی بالا از 28 آغازگر منفرد و ترکیبات ممکن آن ها، 456 نشانگر تکرار پذیر با 95% چندشکلی ایجاد کردند. میانگین شاخص تنوع ژنی نی و شاخص شانون به ترتیب برابر 10/ 0 و 16/ 0 برآورد شد. میزان اطلاعات چندشکلی (PIC) از 22/ 0 تا 32/ 0 با میانگین 27/ 0 و شاخص نشانگر (MI) از 10/10 تا 30/ 29 با متوسط 39/14متغیر بود. تجزیه واریانس مولکولی نشان دهنده تنوع مولکولی درون جمعیتی بالا (30/ 76%) در مقایسه با تنوع بین جمعیتی (70/ 23%) بود. حداکثر و حداقل ناهمگنی ژنتیکی به ترتیب در جمعیت های همدان-2 و قزوین-1 مشاهده شد. براساس داده های IRAP و با استفاده از الگوریتم Neighbor-Joining و ضریب فاصله p-distance، ژنوتیپ های مورد مطالعه به پنج گروه منتسب شدند. روابط جمعیت ها براساس الگوریتم Neighbor-Joining و ضریب ژنتیکی نی بررسی و جمعیت ها در سه کلاستر قرار گرفتند. نتایج نشان داد که نشانگرهای مبتنی بر رتروترانسپوزون ها، مانند IRAP، نشانگرهای کارآ و معتبر برای تعیین سطح تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت در بادرنجبویه می باشند.
کلیدواژگان:
زبان:
انگلیسی
در صفحه:
39
لینک کوتاه:
magiran.com/p1043931
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یکساله به مبلغ 1,390,000ريال میتوانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.
In order to view content subscription is required
Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!