طراحی پرایمرهای اختصاصی برای نشان دادن ژن های exoA، oprL و algD برای تشخیص سریع سویه های سودوموناس آئروژینوزا در نمونه های بالینی

تشخیص سریع سودوموناس آئروژینوزا در سیستیک فیبروزیس، سوختگی ها و بیماران با نقص ایمنی از اهمیت بسیاری برخوردار است. در این بررسی فراوانی وجود ژن های exoA، oprL و algD با استفاده از پرایمرهای منتشر شده در مقالات و نیز پرایمرهای اختصاصی طراحی شده در این تحقیق با روش PCR مورد بررسی قرار گرفت.
نمونه های بالینی برای جداسازی سودوموناس آئروژینوزا در محیط های باکتریولوژیک کشت داده شد. با روش آنالیز بیوانفورماتیکی برای نواحی بسیار ثابت ژن های فوق پرایمرهای اختصاصی طراحی شد. با استفاده از پرایمرهای طراحی شده و پرایمرهای منتشر شده در مقالات، نمونه ها به طور مستقیم با PCR مورد بررسی قرار گرفت.
تعداد 70 سویه سودوموناس آئروژینوزا در کشت نمونه ها جدا شد. با به کارگیری پرایمرهای طراحی شده نتایج مثبت PCR به ترتیب برای ژن های exoA، oprL و algD در 68، 70 و 69 نمونه ها به دست آمد که حساسیت به ترتیب 2/97%، 100% و 6/98% به دست آمد. در صورتی که با پرایمرهای منتشر شده نتایج مثبت به ترتیب برای ژن های فوق در 57، 49 و 28 نمونه به دست آمد که حساسیت به ترتیب 5/81%، 70% و 40% محاسبه شد.
نتایج این تحقیق نشان داد که با به کارگیری پرایمرهای اختصاصی مناسب در تکنیک PCR معمولی می توان با حساسیت و ویژگی بسیار بالا کلونیزاسیون سودوموناس آئروژینوزا در بیماران حساس مانند سیستیک فیبروزیس خیلی زودتر از مثبت شدن کشت نشان داد.