مکان یابی QTL های کنترل کننده تحمل به سرما در برنج

به منظور شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با تحمل به دماهای پایین در برنج، یک جمعیت F2 متشکل از 124 بوته حاصل از تلاقی لاین PR27137-CR153 (متحمل به سرما) و رقم دمسیاه (حساس به سرما) مورد ارزیابی قرار گرفت. نقشه پیوستگی با استفاده از 20 نشانگر SSR و 81 نشانگر چندشکل AFLP تشکیل شد و در مجموع 3111 سانتی مورگان از ژنوم برنج را با متوسط فاصله 67/31 سانتی مورگان تحت پوشش قرار داد. برای شناسایی QTLها از روش مکان یابی فاصله ای مرکب استفاده شد که در مجموع تعداد 13 فاصله نشانگری واجد QTL برای 4 صفت تحمل به پژمردگی (CIWT)، تحمل به نکروزه شدن (CINT)، تحمل به زرد شدن (CIYT) و تحمل به سرما (CT) مکان یابی شدند. از این تعداد، سه جایگاه QTL برای صفت CIWT روی کروموزوم های 2، 8 و 12، پنج جایگاهQTL برای صفت CINT روی کروموزوم های 1، 3، 3، 10 و 12، سه جایگاه QTL مربوط به صفت CIYT روی کروموزم های 1، 2 و 8 و دو جایگاه QTL برای صفت CT روی کروموزوم های 3 و 12 مکان یابی شدند. در این تحقیق دو QTL بزرگ اثر qCIWT12 و qCINT12 روی کروموزوم 12 و در مجاورت نشانگرهای RM7200 و E64-M59-5 شناسایی شدند که سهم قابل توجهی از واریانس فنوتیپی را بیان کردند.