شناسایی پلی فازی Lechevaliera fradia subsp. Iranica، یک اکتینومایست نادر جدا شده از منطقه لوشان ایران

اکتینومایست ها به طور وسیعی در محیط های طبیعی و ساخته دست بشر پراکنده شده اند و توانایی تجزیه مواد آلی را دارا هستند. همچنین، آن ها به عنوان یک منبع غنی برای تولید آنتی بیوتیک ها و مولکول های فعال زیستی شناخته می شوند و از اهمیت چشمگیری در صنعت برخوردار هستند. در این مطالعه، یک اکتینومایست نادر با نام LO5 جداسازی شد و تحت شناسایی پلی فازی قرار گرفت. این اکتینومایست نادر بر اساس دیدگاه تاکسونومی پلی فازی که به وسیله کمیته بین المللی سیستماتیک پروکاریوت ها (ICSP) مصوب شده است، شناسایی شد. دیواره سویه LO5 دارای دی آمینو پایملیک اسید نوع مزو یا دی (D) و همچنین، گالاکتوز، مانوز و رامنوز به عنوان قندهای تشخیصی است. محتوای فسفولیپیدی غشا شامل: دی فسفاتیدیل گلیسرول، فسفاتیدیل گلیسرول و فسفاتیدیل اتانول آمین است. تحلیل فیلوژنی بر اساس مقایسه توالی کامل ژن 16S rRNA نشان داد که این سویه از اعضای خانواده Pseudonocardiaceae و دارای شباهت 6/98 درصدی به Lechevalieria fradiae CGMCC 4.3506T است. ارتباط DNA-DNA بین سویه LO5 و Lechevalieria fradiae CGMCC 4.3506T گویای مقدار 75 درصدی است که با توجه به بالاتر بودن آن از حد 70 درصد که برای معرفی گونه های جدید به آن استناد می شود، سویه LO5 به عنوان زیرگونه Lechevalieria fradiae CGMCC 4.3506T با نام Lechevalieria fradiae subsp. Iranica IBRC-M 10378 معرفی می شود.
یک روش پلی فازی مبتنی بر مطالعات فنوتیپی، شیمیوتاکسونومی و فیلوژنی برای طبقه بندی یک اکتینومایست نادر در حد زیرگونه پیشنهاد شده است. برای به دست آوردن اطلاعات مورد نیاز برای تعیین وضعیت تاکسونومیک سویه LO5، از تکنیک هایی استفاده شده است که با حداقل استانداردهای لازم برای طبقه بندی یک میکروارگانیسم خاص که توسط زیرکمیته های تاکسونومی کمیته بین المللی سیستماتیک پروکاریوت ها تصویب شده اند، مطابقت دارند.