بررسی الگوی بیان miR159 و miR171 تحت تنش خشکی در هلو، بادام و GN

میکرو RNAها، RNAهای کوچکی هستند که هیچ پروتئینی کد نمی کنند و به عنوان تنظیم کننده های منفی بیان ژن در یوکاریوت ها فعالیت دارند. miR159 وmiR171 میکرو RNAهای مهمی هستند که در رشد و نمو گیاه و همچنین پاسخ به تنش نقش دارند. در این پژوهش نقش miR159 و miR171به عنوان میکرو RNAهای کلیدی در برگ هلو و بادام و هیبرید GN بررسی شد. به این منظور دو سطح تنش ملایم و شدید خشکی جهت مقایسه با نمونه شاهد در نظر گرفته شد. استخراج RNA برای هر سه نمونه انجام شد و در مرحله بعد سنتز cDNA ساقه-حلقه صورت گرفت. همچنین بروز miR171 و miR159 با روش qRT-PCR بررسی شد. مقایسه بین نمونه شاهد و تنش، و بررسی معنی دار بودن بیان میکروRNAها و ژن های هدف آن ها با استفاده از آزمون T-test دوتایی انجام شد. شبکه ژنی برای این میکروRNAها تحت تنش خشکی با استفاده از نرم افزار Pathway studio 7 رسم شد. نتایج، نشان داد که miR159 و miR171 به تنش خشکی پاسخ دادند. ژن های MYB33 و SCL6 به ترتیب به عنوان ژن هدف miR159 و miR171 به صورت بیوانفورماتیکی پیش بینی شدند. این دو ژن در رشد و نمو گیاه دخیل هستند. رشد ضعیف یکی از ویژگی های مشخص گیاهان تحت شرایط تنش به خصوص تنش خشکی است که باعث کاهش متابولیسم گیاه و تغییر مسیر منابع غذایی در جهت سازش با شرایط جدید می شود. miR159و miR171 با توجه به ماهیت ژن هدف شان در تنظیم و توسعه گیاه نقش داشتند و طی شرایط تنش، تغییر بیان معنی داری نشان دادند.