بررسی بیوانفورماتیکی برهمکنش آندروژن رسپتور با داروی بیکالوتامید

اکثر قریب به اتفاق داروها با اتصال به پروتئین هدف خود عمل می‏کنند. پیش بینی برهمکنش بین مولکول‏های کوچک و پروتئین ها، یک عنصر کلیدی در فرایند کشف دارو محسوب می‏شود. پیشرفت در ژنتیک ساختاری، دسترسی به ساختارهای سه بعدی پروتئین‏هایی که مورد هدف دارو قرار می‏گیرند را برای ما امکان‏پذیر کرده است. با توجه به اینکه پروسه های آزمایشگاهی در ارتباط با بررسی برهمکنش‏های بین دارو و پروتئین هدف آن با صرف هزینه و انرژی بالا صورت می‏گیرد، بهره‏گیری از روش هایin silico می‏تواند راهکار موثری برای ارائه‏ی اطلاعات مفید در حمایت از روش‏های تجربی باشد.
در این پژوهش نحوه ی برهمکنش آندروژن رسپتور با داروی بیکالوتامید، به عنوان یک داروی پرکاربرد در درمان سرطان پروستات، با استفاده از آنالیزهای محاسباتی مورد بررسی قرار گرفته است.
اطلاعات حاصل از این پژوهش نشان داد، اسیدهای آمینه ی Met-895، Trp-741، Arg-752،Ile-899 ، Leu-707،Gly-708 ،Gln-711 ،Met-745 ، Met-749، Thr-877، Phe-764 و Met-742که در پیوند هیدروفوب و اسیدهای آمینه ی Asn-705 و Leu-704 که در پیوند هیدروژنی با دارو قرار دارند، نقش بسزایی در برهمکنش میان این پروتئین و دارو ایفا می نمایند.
نتایج حاصل را می توان در مراحل بعد، جهت بررسی مقاومت های دارویی به بیکالوتامید و نیز جهت طراحی داروهایی کارآمدتر مورد استفاده قرار داد.