شناسایی و تحلیل فیلوژنتیکی و بیانی چپرون های هیستونی کلاس NAP در ذرت (Zea mays)

در یوکاریوت ها DNA ژنومی در ترکیب با پروتئین های هیستونی کروماتین را ایجاد می کند. چپرون های هیستونی از طریق تغییر دسترسی به DNA بر میزان رونویسی ژن ها تاثیر می گذارند. بر خلاف مخمر و جانوران، در مورد چپرون های هیستونی گیاهی اطلاعات کمی وجود دارد. در این رابطه، خانواده nucleosome assembly protein (NAP) در تمام یوکاریوت ها حفاظت شده بوده و جزء جدایی ناپذیر در پایداری، حفظ و پویایی کرماتین یوکاریوتی می باشد. این پروتئین ها در انتقال هیستون ها به هسته، تشکیل نوکلئوزوم و القاء سیالیت کروماتین نقش داشته و لذا رونویسی بسیاری از ژن ها را تحت تاثیر قرار می دهد. در این مطالعه با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی، 6 ژن شبه NAP (ZmNPL1 تا ZmNAPL6) در ذرت شناسایی شد. آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد که این ژن های NAPL همانند ژن های NAPL آرابیدوپسیس و برنج به دو زیر گروه تقسیم شده و رابطه تکاملی نزدیکتری با ژن های NAPL برنج داشتند. این ژن ها دارای 3 تا 11 اینترون بوده و بر روی 5 کروموزوم از 10 کروموزوم ذرت قرار گرفته اند. آنالیز بیانی بر پایه ریزآرایه نشان دهنده تنظیم دقیق رونویسی ژن های ZmNAPL در طول نمو ذرت می باشد. این امر حاکی از نقش مهم این ژن ها در برنامه ریزی مرتبط با فرآیندهای نموی ذرت بود. این مطالعه اولین گزارش در مورد شناسایی و بررسی روابط تکاملی، ساختاری و بیانی ژن های NAPL ذرت بوده و نتایج بدست آمده از آن اطلاعات پایه برای تحقیقات آتی در مورد کارکرد ژن-های NAPL ذرت را مهیا می سازد.