تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی گونه های نوکاردیا با استفاده از ژن های 16S rRNA، hsp65 و gyrB

نوکاردیا یکی از مهم ترین گروه از اکتینومایست های هوازی است که در خاک زندگی می کند و قادر است به وسیله تنفس و تلقیح تروماتیک به بدن انسان وارد شود و عفونت نوکاردیوزیس را به وجود آورد. روش های مولکولی یکی از بهترین روش های سریع و دقیق برای شناسایی و افتراق این گروه از باکتری ها می باشد. هدف از این مطالعه ارزیابی سه ژن خانه دار در تشخیص و تفریق مهم ترین گونه های نوکاردیا بود.
در این مطالعه مقطعی، ابتدا توالی ژن های 16S rRNA، gyrB و hsp65 برای ده گونه نوکاریا از بانک ژنی دریافت شد. سپس توالی ها به کمک نرم افزار های AL16S و jPhydit هم ردیف شدند، سپس اطلاعات به برنامه MEGA منتقل شد و در نهایت درخت فیلوژنتیک براساس هر یک از ژن های 16S rRNA، gyrB و hsp65 به طور جداگانه رسم شد.
تجزیه و تحلیل درخت فیلوژنتیک حاصل از ژن های 16S rRNA، gyrB و hsp65 نشان داد که همه این ژن ها گونه های نوکاردیا را تشخیص دادند. همچنین ژن gyrB بهترین گزینه برای ترسیم روابط فیلوژنتیک گونه نوکاردیا می باشد.
: براساس پژوهش حاضر، برای شناسایی و افتراق صحیح گونه های نوکاردیا می بایست چند ژن خانه دار به طور همزمان مطالعه شود.