تنوع آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در ارقام مقاوم و حساس به زنگ گندم نان

بیماری های قارچی به خصوص زنگ های زرد و قهوه ای باعث کاهش عملکرد گندم در ایران و جهان می شوند. در این مطالعه، تنوع ژنتیکی 20 رقم گندم نان با پاسخ متفاوت به زنگ های قهوه ای و زرد با استفاده از آغازگرهای طراحی شده براساس نواحی حفاظت شده ژن های مقاومت به بیماری بررسی شد. الگوی نواری نشانگرهای چند شکل به صورت غالب امتیازدهی و تعداد نوار تکثیر شده و درصد چند شکلی تعیین گردید. علاوه بر این، برای هر ترکیب آغازگری، پارامترهای محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC) و شاخص نشانگر (MI) محاسبه شد. از مجموع 11 آغازگر منفرد و جفت، پنج ترکیب آغازگری به همراه یک آغازگر منفرد تکثیر مناسب و قابل امتیازدهی تولید کردند. حداکثر و حداقل میانگین PIC به ترتیب مربوط به آغازگر LLOOP-1 و جفت آغازگر H2016-H2020 با میزان 50/0 و 28/0 بود. جفت آغازگرهای H2016-H1146 و H2016-H2020 با میانگین80/4 و 84/2 به ترتیب حداکثر و حداقل MI را داشتند. تجزیه خوشه ایبراساس الگوریتم Neighbor-Joining و ضریب فاصله تکاملی P-distance، ارقام مورد مطالعه را به چهار گروه منتسب کرد و این گروه بندی با پاسخ به زنگ زرد ارقام مطابقت داشت. در تجزیه به بردارهای اصلی، پراکنش ارقام براساس دو بردار اصلی اول، چهار گروه حاصل از تجزیه خوشه ایرا تایید کرد.