بررسی مهارپذیری متابولیت های ثانویه گیاهی در مقایسه با داروهای شیمیایی بر روی پروتئاز اصلی Mpro و Spike گلیکوپروتئین ویروس SARS-CoV-2 (nCov-19) به روش داکینگ مولکولی
عفونت ناشی از ویروس SARS-COV-2 یکی از عوامل اصلی مرگ و میر در قرن 21 است. پژوهش های زیادی با هدف معرفی ترکیبات موثر ضد ویروس SARS-COV-2 بویژه ترکیبات گیاهی در حال انجام است. هدف از پژوهش حاضر، غربالگری بیوانفورماتیکی مهار کننده های پروتیاز اصلی (Mpro) و پروتئین S ویروس از میان ترکیبات فنولی و ترپنوییدی گیاهی می باشد. ساختار سه بعدی و شیمیایی پروتئین های ویروس و ترکیبات فنولی و ترپنوییدی گیاهی از پایگاه داده های پروتئین و Pubchem دریافت شد. در نهایت ترکیبات گیاهی بر روی پروتیاز اصلی (Mpro) و پروتئین S ویروس به روش داکینگ مولکولی با استفاده از نرم افزار iGemdock 2.1 بررسی سپس خصوصیات فیزیکوشیمیایی ترکیبات از نظر نفوذپذیری، حلالیت و جذب گوارشی با استفاده از نرم افزار Swiss ADME پیش بینی شد. 4 ترکیب ترپنوییدی گلیسریزیک اسید (glycyrrhizic acid)، سیکوساپونین B2 (Saikosaponin B2)، پولیفیلین I (Polyphyllin I) و ویتافرین A (Withaferin A) و 7 ترکیب فنولی EGCG ، رزماریک اسید (Rosmarinic acid) ، سیلیبینین (Silibinin) ، کلروژنیک اسید (Chlorogenic acid) ، پروآنتوسیانیدین (Proanthocyanidin) ، پروسیانیدین B2 (Procyanidin B2) و آنتوسیانین (Anthocyanin) با داشتن انرژی اتصال قوی در مقایسه با ترکیبات دارویی مرجع مانند آزیترومایسین (Azithramycine) و رمدیسیویر (Remdesivir) و غیره ، کاندیدهای فیتوشیمیایی بسیار مناسبی برای مهار گلیکوپروتئین S و پروتیاز اصلی ویروس (Mpro) می باشند. طبق نتایج هر دو ترکیب فنولی و ترپنوییدی در مقایسه با داروهای شیمیایی ، قدرت مهار مناسبی برای پروتیاز Mpro و پروتئین S ویروس دارند و می توانند نامزدهای مناسبی جهت بررسی های in vitro و in vivo باشند.
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.