مطالعه رابطه تکاملی گندم نان و اجیلوپس تائوشی از طریق بررسی miRNA های مشترک و ژن های هدف آنها
گندم (Triticum aestivum) یکی از گیاهان مهم زراعی کشور و دنیاست که اهمیت استراتژیک در تامین غذای انسان دارد. گندم نان یک آلوهگزاپلویید (AABBDD) است که طی دو هیبریداسیون از اجداد وحشی خود به وجود آمده که در آن اجیلوپس تایوشی به عنوان دهنده ژنوم D گندم مطرح است. در این تحقیق با استفاده از بررسی miRNAهای مشترک آن ها و ژن های هدف به رابطه تکاملی گندم نان و اجیلوپس تایوشی بیشتر پرداخته شده است. بررسی کروموزوم های گندم نان و اجیلوپس تایوشی نشان می دهد تا حدود زیادی کروموزوم های متناظر از لحاظ طول و تعداد ژن ها یکسان هستند. در این مطالعه پنج miRNA رونوشت شده از ژنوم D گندم و مشترک با اجیلوپس تایوشی و همچنین سه miRNA جدید شناسایی شده از RNA Seq به روش بیوانفورماتیکی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. همردیفی و بررسی توالی های miRNA موردنظر در گیاهان تک لپه نشان داد که این miRNAها در گندم و اجیلوپس بیشترین تشابه را دارند و به نظر می رسد در طول تکامل، این توالی ها از اجیلوپس تایوشی به صورت حفاظت شده به گندم رسیده است. بررسی آنتولوژی ژن های هدف miRNAهای مشترک گندم نان و اجیلوپس تایوشی نشان از تشابه بالای آن ها داشت. بنابراین به نظر می رسد miRNAهای مشترک بین گندم نان و اجیلوپس تایوشی تا حدود زیادی نقش و عملکرد مشابهی در این گیاهان خویشاوند دارند. یافته های این تحقیق می تواند در شناخت بهتر مکانیسم و عملکرد miRNAهای گندم و اجیلوپس تایوشی و استفاده از آن ها در طرح های اصلاحی گندم از طریق خویشاوند وحشی خود مورد بهره برداری قرار گیرد.
اجیلوپس ، همردیفی ، روش محاسباتی ، RNA Seq
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.