برآورد میزان هم خونی به روش شجره و نشانگر و تاثیر آن بر صحت پیش بینی ژنومی در داده شبیه سازی

در سالیان گذشته بدلیل عدم شناخت روابط خویشاوندی ژنومی بین افراد جمعیت در گله  تنها از روابط شجره ای برای کنترل هم خونی استفاده می شد. در پژوهش کنونی میزان پیشرفت ژنتیکی (G)، میزان هم خونی به روش شجره و میزان هم خونی به روش لوکاس IBD برای دو روش GBLUP  و TBLUP برآورد و هم چنین تاثیر آن ها بر صحت پیش بینی ژنومی به کمک داده شبیه سازی بررسی شد. یک جمعیت پایه متشکل از 1000 حیوان برای 4000 نسل به کمک نرم افزار QMsim شبیه سازی شد. تعداد ده کروموزوم و بر روی هر کروموزوم 1000 نشانگر SNP شبیه سازی و تعداد کل QTL ها بر روی ده کروموزوم 1000 عدد در نظر گرفته شد. نتایج پژوهش حاضر نشان داد که  میزان پیشرفت ژنتیکی در روش ارزش اصلاحی ژنومی (GBLUP) 13 درصد بیش تر نسبت به روش TBLUP برآورد شد. میزان هم خونی به روش شجره در روش GBLUP بسیار پایین تر از روش TBLUP برآورد شد هر چند که در روش هم خونی برآورد شده به کمک IBD این میزان تفاوت بسیار ناچیز بود. میزان تفاوت صحت پیش بینی ژنومی برای روشی که هم خونی به کم نشانگر برآورد شد نسبت به روش شجره، 24 واحد بیش تر به دست آمد. به طور کلی نتایج پژوهش حاضر نشان داد که برآورد میزان هم خونی به کم نشانگر از صحت بیش تر برخوردار بوده و تاثیر آن بر صحت پیش بینی ژنومی معنی دار بود.