مدل سازی رشته های کوتاه پلی پپتیدی برای شناسایی آمینواسیدهای ضروری از طریق محاسبه طیف تشدید مغناطیسی هسته

پروتئین ها به دلیل آنکه نشانگر زیستی بیماری های خاصی هستند از اهمیت ویژه ای برخوردارند به نحوی که کاهش یا افزایش آن ها در بدن می تواند نشانه بیماری باشد. این پژوهش به منظور بررسی و شناسایی رشته های پروتئینی کوچک از طریق محاسبه طیف تشدید مغناطیسی هسته انجام شده است. آمینواسیدها واحدهای سازنده پروتئین در بدن هستند و آمینواسیدهای ضروری به آمینواسیدهایی گفته می شود که توسط بدن تولید نمی شوند و باید از طریق زنجیره غذایی به بدن برسند. ازآنجایی که آمینواسیدهای ضروری برای فرآیندهای حیاتی ازجمله ساخت پروتئین ها و سنتز هورمون ها مورد نیاز هستند، از اهمیت بالایی برخوردارند و در این پژوهش مورد مطالعه قرار می گیرند. ابتدا رشته هایی به طول دو تا شش آمینواسید با مونومرهای یکسان با استفاده از نرم افزار Gauss View مدل سازی و طیف تشدید مغناطیسی هسته آن ها، با استفاده از نرم افزار Gaussian 09w محاسبه شده است. این ساختارها به منظور بررسی عواملی چون نوع و طول رشته آمینواسید، بر دامنه و محل پیک ماکزیمم در طیف تشدید مغناطیسی هسته مدل سازی شده اند. با تحلیل نتایج حاصل از مدل سازی طیف تشدید مغناطیسی، می توان دریافت هر آمینواسید طیف تشدید مغناطیسی مخصوص به خود را دارد و نوع آمینواسیدهای موجود در یک زنجیره پلی پپتیدی بر طیف تشدید مغناطیسی آن اثرگذار است. توانایی روش تشدید مغناطیسی هسته در تشخیص و شناسایی انواع بیماری ها، ماهیت غیرتهاجمی آن، و همچنین امکان تکرارپذیری آزمایشات، علاوه بر اینکه هزینه های آزمایشات را کاهش می دهد، این روش را به عنوان یکی از روش های نوین و پیشرفته جهت مطالعه بیماری ها تبدیل کرده است.