شناسایی microRNA و ژن های هدف مرتبط در گیاه دارویی .Trachyspermum ammi L

microRNA (میکروارنا)، دسته ای از مولکول های کوچک و غیر کد کننده بوده که بیان ژن را در حیوانات و گیاهان تنظیم می کند. زنیان (Trachyspermum ammi)، گیاه شناخته شده ای از نظر خواص دارویی می باشد. تاکنون گزارشی از شناسایی میکروارنا برای گیاه دارویی زنیان در پایگاه داده mirbase ثبت نشده است. از این رو در مطالعه حاضر به منظور پیش بینی میکروارنا و ژن های هدف، از رویکرد محاسباتی مبتنی بر جستجوی همسانی از طریق الگوریتم Blastx در برابر پایگاه داده mirbase استفاده شد. پارامترهای درصد باز GC، حداقل انرژی آزاد تاخوردگی، شاخص حداقل انرژی آزاد تاخوردگی و ساختار ثانویه صورت گرفت و توالی های کاندید پیش ساز میکروارنا شناسایی شدند. به منظور بررسی بیان ژن های منتخب با استفاده از PCR time Real یک آزمایش در قالب طرح کاملا تصادفی در گلدان روی اکوتیپ اراک زنیان در سه سطح صفر، 12 و 24 ساعت پس از اعمال متیل جاسمونات صورت گرفت. در مجموع تعداد نه میکروارنای mi156، miR160، miR166، miR168، miR171، miR172، miR396، miR477 وmiR827 شناسایی شد. نتایج تخمینی نشان داد که آنها 931 ژن متعلق به چندین خانواده ژنی با عملکردهای بیولوژیکی متفاوت در زنیان را تنظیم می کنند. جاسمونات و مشتقات آن مولکول های سیگنال دهنده گیاهی هستند. از این رو، بیان miR160 و miR166 با تکنیک PCR time Real مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان داد که pri-miR160 و pri-miR166 در پاسخ به تیمار متیل جاسمونات افزایش پیدا می کنند. این موضوع نشان می دهد که pri-miR160 و pri-miR166 با انتقال هورمون مرتبط است.