تنوع مولکولی و ساختار ژنتیکی ژنوتیپ های گندم دوروم دیم با استفاده از نشانگرهای SCoT

برنامه های اصلاحی مبتنی بر انتخاب و حفاظت از ژرم پلاسم، نیازمند مطالعه تنوع ژنتیکی هستند. در این تحقیق، تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت مجموعه ای متشکل از 90 ژنوتیپ گندم دوروم دیم بر اساس چندشکلی های بدست آمده از سیستم نشانگر هدفمند کدون آغاز (SCoT) مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. از بین 26 آغازگر اولیه آزمایش شده، 15 آغازگر چندشکلی مقیاس پذیر ایجاد کردند و بنابراین انتخاب شدند. به طور متوسط در هر واکنش، ​​11.27 نوار چندشکل برای هر آغازگر مشاهده شد. محتوای اطلاعات چندشکلی از 0.10 تا 0.32 در هر مکان با میانگین 0.23 در هر آغازگر متغیر بود. قدرت تفکیک آغازگرها از 0.98 تا 5.80 ثبت شد. تجزیه و تحلیل ساختار، جمعیت مورد مطالعه را به 3 زیرجمعیت طبقه بندی کرد. علاوه بر این، تجزیه خوشه ای و تجزیه مختصات اصلی، ژنوتیپ ها را به 3 و 5 خوشه مجزا تقسیم کردند. تجزیه و تحلیل واریانس مولکولی، تنوع درون جمعیتی بالایی را نشان داد. شاخص جریان ژنی احتمال نسبتا کمی از جریان ژنی بین زیر مجموعه های مورد مطالعه را نشان داد. تنوع ژنی  Nei، شاخص اطلاعات شانون و توزیع آللها نشان داد که افراد زیرجمعیت-2 از تنوع ژنتیکی بالایی برخوردار بودند. پرایمرهای SCoT مورد مطالعه، قدرت تفکیک قابل قبولی نشان دادند؛ بنابراین برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در گندم دوروم، کارآمد بودند. علاوه بر این، افراد زیرجمعیت-2، دارای سطح قابل توجهی از تنوع ژنتیکی بودند که می توان از آن برای اهداف اصلاحی مختلف استفاده کرد.