بررسی گستره ژنومی خانواده ژنی CIPK در گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (.Aeluropus littoralis L)

شبکه سیگنالینگ CBL-CIPK یکی از مهم ترین سیستم های انتقال سیگنال در گیاهان بوده که سیگنال های کلسیم ناشی از تنش های محیطی مختلف را رمزگشایی می کند. پروتیین های متصل به یون کلسیم به عنوان مولکول های حسگر عمل نموده و با دریافت سیگنال های یون کلسیم سلولی، وظیفه هدایت پیام را به آبشارهای ژنی پایین دست بر عهده دارند. تحمل بالقوه تنش های غیرزنده خصوصا تنش شوری و قرابت آن به غلات، انگیزه اصلی بسیار از محققین برای مطالعه مکانیسم های مولکولی گونه هالوفیت Aeluropus littoralis است. در این تحقیق با توجه به در دسترس قرار گرفتن توالی ژنومی این گیاه، شناسایی این سیلیکو اعضای خانواده ژنی AlCIPK و ارزیابی پاسخ های بیانی آن ها در برابر تنش شوری مدنظر قرار گرفت. بر مبنای همولوژی با ژن های آرابیدوپسیس، 20 ژن CIPK در ژنوم A. littoralis شناسایی شد. تجزیه وتحلیل جانمایی پروتیین ها نشان داد که این پروتیین ها در بخش های مختلف سلولی فعال هستند. درخت فیلوژنتیک بر مبنای توالی پروتیینی 20 AlCIPK، 26 AtCIPK و 33 OsCIPK، نشان داد که 79 CIPK موردبررسی از رابطه ارتولوژیکی قوی برخوردارند. آنالیز فیلوژنتیکی بر اساس تجزیه وتحلیل ساختار اگزون / اینترون، همه AlCIPKها را به دو گروه کم-اینترون و غنی- اینترون تقسیم نمودند. الگوهای بیان متمایز اعضای خانواده ژنی AlCIPK انشقاق عملکردی و ساختاری این ژن ها را در طی تکامل تایید می کند. یافته های این بررسی ضمن ارایه برخی خصوصیات عملکردی خانواده ژنی سنسورهای کلسیم، اطلاعات پایه ای را برای تحقیقات آتی در مورد کارکرد بیولوژیکی این ژن ها فراهم می سازد.