بررسی مقایسه ای خانواده ژنی CCCH Zinc finger در آرابیدوپسیس تالیانا و برنج

ژن های خانواده زینک فینگر CCCH (C3HZNF)، کد کننده پروتیین هایی با سه سیستیین و یک هیستیدین می باشند. پروتیین های این خانواده دسته مهمی از فاکتورهای رونویسی زینک فینگر بوده که در فعالیت های مختلف از جمله رشد و نمو گیاه و پاسخ به تنش های زیستی و غیر زیستی و در واقع در مقاومت به تنش ها موثر می باشند. در این مقاله از داده های پروتیینی C3HZNF دو گیاه آرابیدوپسیس و برنج برای تجزیه و تحلیل روابط فیلوژنتیک، ساختار اگزون/ اینترون، سازماندهی موتیف ها/ دامنه ها استفاده شد. این بررسی ها نشان از همولوژی بالای این ژن ها با ژن های CCCH در برنج داشتند. تجزیه و تحلیل ساختار ژنی نشان داد که AtC3Hها دارای تعداد اگزون های متغیری می باشند، اما به طور کلی ژن هایی با 1 و 7 اگزون، بیشترین تعداد را در بر می گیرند. بررسی ویژگی های فیزیکی و شیمیایی پروتیین های این خانواده نشان داد که AtC3H36 پایدارترین پروتیین در بین اعضای این خانواده می باشد همچنین بیشترین نقطه ایزوالکتریک متعلق به پروتیین AtC3H7 (96/9) است. مشاهدات نشان داد اعضای این خانواده ژنی دارای 1 تا 6 دمین Znf C3H و مجموعا 17 دمین عملکردی می باشند. مقایسه ی فیلوژنی بین پروتیین های C3H در برنج و Arabidopsis نشان داد که این پروتیین ها از حفاظت شدگی بالایی برخوردارند. در آنالیز فیلوژنتیکی مقایسه ای AtC3H وOsC3H، ژن های اورتولوگ در یک گروه قرار گرفتند. به عنوان مثال،OsC3H8 همولوژی نزدیکی با HUA1 در Arabidopsis (AtC3H37) نشان داد، که این ژن در توسعه گل نقش دارد. این مطالعه اطلاعات ارزشمندی در مورد خانواده مهم ژنی CCCH zinc finger در گیاه آرابیدوپسیس و برنج ارایه می دهد. این اطلاعات می تواند در درک نحوه عمل این ژن ها برای کمک به مقاومت گیاه در هنگام مواجه با تنش-های زیستی و غیر زیستی کمک کننده باشد.