مقایسه ژنوتیپی جدایه های اورنیتوباکتریوم رینوتراکئال جدا شده از ماکیان صنعتی ایران

اورنیتوباکتریوم رینوتراکیال (ORT)، باکتری نوظهور بیماری زای تنفسی است که خسارات اقتصادی مهمی را در صنعت طیور ایجاد می کند.  مطالعات قبلی در ایران شباهت های مولکولی و ژنتیکی بالایی را بین جدایه های ORT طی سال های 1999-2009، براساس SDS-PAGE، ERIC-PCR و تعیین توالی ژن 16S rRNA نشان داد.  هدف از مطالعه حاضر تعیین ژنوتیپ جدایه های ORT به دست آمده از ماکیان صنعتی با استفاده از روش های تکثیر تصادفی پلی مورفیسم DNA (RAPD) و تعیین تیپ توالی یابی چندجایگاهی (MLST) بود.  در این مطالعه، از 30 باکتری ORT جدا شده از ماکیان صنعت طیور ایران در سال های 1379 تا 1395 تایید شده به روش بیوشیمیایی و مولکولی استفاده شد.  آزمایش RAPD با استفاده از پرایمر OPG11 بر روی تمام نمونه های ORT مورد مطالعه انجام شد.  با توجه به نتایج آزمون RAPD از بین 30 جدایه ORT تنها 5 جدایه برای آزمون MLST انتخاب شدند که برای انجام آن، هفت جفت پرایمر برای تکثیر و توالی یابی ژن های خانه دار adk، aroE، fumC، gdhA، mdh،pgi  و pmi طراحی گردید.  در آزمون RAPD با استفاده از پرایمرOPG11 ، تعداد 9 ژنوتیپ متفاوت مشاهده شد.  توالی DNA الل های این هفت لوکوس، در خصوص هر 5 سویه ORT، با توالی آلل های موجود در بانک اطلاعاتی MLST مقایسه شدند.  چهار ORT از پنج جدایه مورد مطالعه متعلق به تیپ سکانسی 9 (ST9) بودند و یک سویه هم تیپ سکانسی جدیدی بود.  بر اساس یافته های این مطالعه، یک تیپ سکانسی جدید از ORT های طیور صنعتی در ایران گزارش گردید که پیش از این از سایر نقاط جهان گزارش نشده است.  مطالعات بعدی جهت بررسی تعداد بیش تری از جدایه های ORT، می تواند در تشخیص تیپ های مختلف سکانسی و تیپ سکانسی غالب در کشور کمک کننده باشد.