مروری کوتاه بر فناوری های نوین در زمینه سنجش و مدیریت بیماری های ویروسی و شبه ویروسی گیاهان 1 - سنجش

برای مدیریت موفقیت آمیز بیماری های ویروسی و شبه ویروسی گیاهان، سنجش4 موثر بیمارگرها ضروری است. سنجش ممکن است زیستی5 (مبتنی بر عفونت زایی)، ریخت شناختی6 (شکل و اندازه برای نمونه بر مبنای الکترون میکروسکوپی) یا براساس ویژگی های پروتیین و نوکلییک اسید بیمارگر باشد. شیوه های مبتنی بر ویژگی های پروتیین دربرگیرنده روش های گوناگون سرولوژیک مانند ELISA7، میکروآری، الکتروفورز و حسگرهای زیستی است. شیوه های مبتنی بر ویژگی های ژنوم بیمارگر دربرگیرنده دورگه سازی نوکلییک اسید، الکتروفورز، تراشه میکروآری، انواع واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR)8 و توالی یابی های نسل جدید (NGS)9 است. ترکیبی از روش های مختلف (مانند immuno-electron microscopy، immunoelectrophoresis  و immunocapture PCR)  نیز ممکن است بهره گیری شوند. در این مقاله به قابلیت اجرا، حساسیت، اختصاصیت و موردهای استفاده از این روش ها اشاره شده است. در حال حاضر، متداول ترین و کاراترین فناوری ها برای ردیابی هدفمند بیمارگرهای ویروسی و شبه ویروسی ELISA، PCR، LAMP10 و انواع روش های مبتنی بر این ها و برای شناسایی و ردیابی غیرهدفمند انواع بیمارگرها در گیاه، فناوری های مبتنی بر توالی یابی نسل جدید است. بیوانفورماتیک در موفقیت و پیشرفت این فناوری ها نقش برجسته ای داشته است. همه این فناوری ها بوم سازگار و در داخل کشور قابل اجرا هستند.