مطالعه ساختار و اندازه موثرجمعیت گاونجدی، هلشتاین وآمیخته های آن ها با استفاده از پویش کل ژنوم

برای محافظت از نژادهای بومی به منظور حفظ تنوع ژنتیکی، نگهداری حیوان در محل زندگی خود است چرا که هزینه محافظت از ذخایر ژنتیکی بالا بوده و امکان حفظ همه ذخایر ژنتیکی در آزمایشگاه ها و موسسات تحقیقاتی ممکن نیست. هدف از این تحقیق مشخص کردن ساختار جمعیتی و اندازه موثر جمعیت گاو نجدی، هلشتاین و آمیخته های آن‎ها در گله های استان خوزستان بود. به این منظور از اطلاعات ژنومی 329 نمونه گاو شامل 141، 60 و 128 نمونه به ترتیب از نژادهای هلشتاین و آمیخته و نجدی استفاده شد. نمونه ها با آرایه های ژنومی Illumina SNP30K تعیین ژنوتیپ شدند. آنالیز جمعیت با استفاده از PCA و plotNJ انجام شد که در هر دو روش جمعیت ها تا حدودی از هم تفکیک شدند. دامنه r2 از 359/0 ± 150/0 26 تا 450/0 ± 244/0 در کروموزوم در 20 برای نژاد هلشتاین و 319/0 ± 130/0 28 تا 462/0 ± 271/0 در کروموزوم 20 در دام ه‍ای آمیخته بود، در حالیکه بالاترین مقدار r2 در نژاد نجدی از دامنه 311/0 ± 120/0 28 تا 483/0 ± 271/0 در کروموزوم 20 مشاهده شد. اندازه موثر جمعیت ها در نسل پنج برای جمعیت های این مطالعه، نجدی 45 راس، آمیخته 101 راس و هلشتاین 110 راس به دست آمد. این اعداد برای گاو نجدی برای مقادیر پیشنهاد شده جهت حفاظت از جمعیت ها فاصله زیادی دارد و این امر نشان دهنده خطر جدی حذف گاو بومی نجدی در آینده نزدیک است.