ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در چند استان شمالی ایران

باکتری (Pss) Pseudomonas syringae pv. syringae عامل بیماری های بسیاری روی محصولات زراعی و باغی می باشد یکی از مهم ترین بیماری های ناشی از این باکتری شانکر، لکه برگی و نکروز پوست در درختان میوه هسته دار (هلو، شلیل، زردآلو، آلو و گیلاس) است. به منظور بررسی همسانی یا تنوع جدایه های عامل بیماری، طی سال های 1386-1388 از باغات درختان میوه هسته دار واقع در مناطق مختلف استان های اردبیل، گیلان، مازندران و خراسان رضوی نمونه برداری صورت گرفت. باکتری های جداشده از بافت های آلوده جوانه، برگ، شاخه و تنه بر اساس آزمون های گروه LOPAT و GATTa، Pss شناسایی شدند. تعداد 70 جدایه مورد بررسی های فنوتیپی (مورفولوژیکی، فیزیولوژیک و بیوشیمیایی) و الکتروفورز پروتئین های سلولی (SDS-PAGE) قرار گرفتند. جدایه ها از نظر خصوصیات فنوتیپی و الگوی پروتئین های سلولی اختلاف های جزئی نشان دادند. جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی، DNA ژنومی جدایه ها استخراج و در واکنش زنجیره ای پلیمراز (rep-PCR) با استفاده از آغازگرهای ERIC و REP بررسی شد. آنالیز خوشه اینتایج به دست آمده نشان داد که در ERIC-PCR در سطح تشابه 75 درصد، جدایه ها به 8 گروه و با REP-PCR به 5 گروه و با ترکیب همه آغازگرها به 9 گروه تقسیم شدند. نتایج نشانگر وجود تنوع ژنتیکی درون جدایه های Pss عامل بیماری شانکر درختان میوه هسته دار بود.