الگوی توزیع و چندشکلی ادغامی رتروترنسپوزون ها در جمعیت های Linum austriacum L

رتروترنسپوزون ها عناصر رایج در ژنوم گیاهان می باشند که فراوانی، فعالیت و توزیع یکنواخت آنها در ژنوم، استفاده از آنها را به عنوان نشانگرهای مولکولی ایده آل می سازد. به منظور مطالعه فعالیت، الگوی توزیع و چندشکلی ادغامی برخی رتروترنسپوزون های LTR (Long terminal repeat) در گیاه Linum austriacum L. از نشانگرهای IRAP (Inter-retrotransposon amplified polymorphism) و REMAP (Retrotransposon-microsatellite amplified polymorphism) استفاده شد. نتایج نشان داد که رتروترنسپوزون های LTR مورد استفاده به لحاظ انتقالی در ژنوم L. austriacum فعال بوده و در داخل یکدیگر به حالت آشیانه ای و همچنین در نواحی نزدیک ریزماهواره ها ادغام می شوند. از 58 آغازگر منفرد و ترکیب آغازگری بررسی شده، 20 آغازگر (7 آغازگر IRAP و 13 آغازگر REMAP) الگوی باندی واضح و قابل امتیازدهی تولید نمودند. در مجموع 199 مکان توسط 20 آغازگر تکثیر شد که از این تعداد 129 مکان (8/64 درصد) چندشکل بودند. آغازگرهای LTR1868 و LTR1854-A13 به ترتیب بیشترین و کمترین تعداد مکان چندشکل را تولید نمودند. براساس آزمون مانتل همبستگی بین ماتریس های کوفنتیک IRAP و REMAP معنی دار نبود. تجزیه خوشه ایبراساس داده های حاصل از ترکیب دو نشانگر (IRAP+REMAP) به روش Minimum evolution بر پایه ضریب Number of differences، ژنوتیپ ها را به چهار گروه منتسب کرد. افراد مربوط به هر جمعیت در گروه های مشابه قرار گرفت. براساس نتایج حاصل از این تحقیق می توان اظهار داشت که نشانگرهای IRAP و REMAP توسعه یافته براساس رتروترنسپوزون های فعال در جنس Linum می توانند به عنوان ابزار نسبتا جدیدی در برنامه های اصلاحی گونه های مختلف این جنس مورد استفاده قرار گیرند.