استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی برای مطالعه پروتئین مایوستاتین

ژن مایوستاتین متعلق به خانواده فاکتورهای تمایز رشد (TGF-β) می باشد که در رشد و نمو و بلوغ و به طور اختصاصی در توسعه ماهیچه اسکلتی بالغ بیان می شود. در این پژوهش با بهره گیری از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی، توالی اسیدآمینه ای پروتئین مایوستاتین در گونه های مختلف ازجمله گاو، گوسفند، بز، اسب، خوک، مرغ، بوقلمون، اردک، غاز، کبوتر، موش و انسان بررسی شد. در هم ردیفی بخش پایانی پروتئین مایوستاتین (فرم فعال پروتئین مایوستاتین که به صورت دایمر بیان می شود)، درجه بالایی از حفاظت شدگی مشاهده شد، به طوری که نوسان تغییرات در این بخش نسبت به سایر قسمت های توالی پروتئینی، کمترین مقدار ممکن بود. با استفاده از سایت های تخصصی Proteus و Phyre2 ساختارهای ثانویه ای از قبیل مارپیچ آلفا، صفحات بتا و ساختار سه بعدی پروتئین مایوستاتین مورد بررسی قرار گرفت. اسیدآمینه های لوسین، لیزین، ایزولوسین و گلوتامیک اسید در گاو و گوسفند و بز فراوانی یکسانی را نشان دادند اما در مقایسه با ماکیان مانند مرغ، فراوانی بیشتری داشتند. حال آن که فراوانی این اسیدآمینه ها در توالی پروتئینی مایوستاتین انسان و خوک متوسط بود. بررسی درخت فیلوژنی نشان داد که تفاوت در توالی اسیدآمینه ای مایوستاتین در بین گونه های یاد شده باعث قرار گرفتن پرندگان در گروهی جدا شده از پستانداران شده است. بررسی ساختار سه بعدی نشان داد که ژن مایوستاتین دارای حفاظت شدگی بالایی در گونه ها است.