طراحی و به کارگیری روش LAMP در جهت تشخیص مولکولی استرپتوکوک پیوژنز

استرپتوکوکوس پیوژنز کلونیزه کننده پوست و گلو در بسیاری از انسان ها است. این باکتری علاوه بر عفونت های چرکی حاد، مسئول عوارض و بیماری های خودایمن بعد از عفونت شامل آرتریت واکنشی، گلومرولونفریت و تب روماتیسمی می باشد. روش استاندارد طلایی برای شناسایی استرپتوکوکوس پیوژنز، کشت است. اما به دلیل زمان بر بودن روش مذکور و اهمیت تشخیص سریع آن، استفاده از روش های مولکولی مفید است. تکنیک LAMP روش نسبتا جدیدی است که حساسیت و اختصاصیت بالایی در تشخیص عفونت های باکتریایی دارد. هدف از این مطالعه، استفاده از تکنیک LAMP براساس ژن ستوکروم اکسیداز (oxaA) برای شناسایی استرپتوکوکوس پیوژنز است.
روش LAMP با 6 پرایمر برای توالی خاص oxaA در استرپتوکوکوس پیوژنز طراحی شد. غلظت های مختلفی از سولفات منیزیم، دزوکسی نوکلئوتید تری فسفات و پرایمرها برای بهینه سازی روش استفاده گردید.
واکنش LAMP با غلظت های 10 uM از هر کدام از پرایمرهای LB، LF،F3 و B3، 40 uM از هر کدام از پرایمرهای FIP و BIP، 0.4mM dNTPs و 8mM MgSo4 طی 1 ساعت و در دمای 63 درجه سانتیگراد راه اندازی گردید.
روش LAMP در مقایسه با PCR روش سریعی برای شناسایی استرپتوکوکوس پیوژنز می باشد.