آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش بینی میکرو RNA های بالقوه مهارکننده فرایندهای رگزایی در سرطان

با افزایش اندازه تومور، محیط سلول‏های توموری هیپوکسیک و اسیدیک شده و سلول ها شروع به افزایش تولید چندین نوع عامل رشد می‏کنند که در نتیجه آن تشکیل رگ‏های خونی موضعی آغاز می‏شود. به دنبال آن متاستاز سلول های سرطانی از طریق عروق خونی اتفاق می افتد، لذا مهار رگزایی می تواند روش جدیدی برای درمان سرطان باشد. این مطالعه به منظور آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش بینی میکرو RNA های بالقوه مهارکننده فرایندهای رگزایی در سرطان انجام گردید.
در این مطالعه توصیفی میکرو RNA هایی با قابلیت اتصال به ژن های MMP دخیل در رگزایی تومور (MMP1-2-3-8-9-10-11-13) با استفاده از پایگاه داده mirwalk شناسایی گردید. انتخاب micro RNA های موثر براساس تعداد جایگاه اتصال آنها به 3''UTR ژن ها انجام شد. برای تعیین توالی مکمل ژن نمونه با micro RNA های منتخب از پایگاه داده Microrna استفاده گردید.
بیشترین تعداد جایگاه اتصال به ژن های دخیل در رگزایی تومور mir-1302 ، mir-516a ، mir-512 ، mir-511 ، mir-516b و mir-548 تعیین شد.
micro RNA ها گزینه های مناسبی برای کشت سلولی و بررسی آزمایشگاهی به منظور یافتن راه های جدید پیشگیری از پیشرفت سرطان از طریق مهار رگزایی هستند.