بررسی میزان تنوع توالی های تکرارشونده درسویه های اشریشیا کلی جداشده از منابع آب استان البرز

اشریشیا کلی (E. coli) باسیل گرم منفی از خانواده انتروباکتریاسه است. باکتری E. coli به عنوان شاخص آلودگی آب شهری به فاضلاب استفاده می شود. توالی های تکرارشونده، تکرارهایی از خود ژن ها یا قسمت هایی از آن ها است که تکرار شده اند. تکرارهای پشت سرهم ممکن ازنظر تعداد تکرارها در یک موجود نسبت به سایر جمعیت های آن موجود متفاوت باشند، که در اصطلاح به آن ها، تکرارهای پشت سرهم با تعداد متغیر می گویند. هدف از این مطالعه بررسی میزان تنوع توالی های تکرارشونده مربوط به دو لوکوس مهم یعنی ms06 و ms23 در E.coli های جداشده از منابع آب استان البرز است.
تعداد 72 ایزوله جداشده E. coli که از مهرماه سال 91 تا مهرماه سال 92، از منابع آب استان البرز جمع آوری شده بودند موردبررسی قرار گرفت و از آزمون های بیوشیمیایی و استاندارد جهت شناسایی و جداسازی باکتری E. coli استفاده شد و پس ازآن استخراج ژنوم به وسیله روش جوشاندن صورت گرفت. بررسی میزان تنوع توالی های تکرارشونده مربوط به دو لوکوس ms06 و ms23 در E.coli با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلیمراز انجام گرفت.
نتایج حاصل از انجام الکتروفورز در 2 لوکوس ms06 و ms23 نشان داد که لوکوس ms06 دارای 5 نوع الل متفاوت (1 تکرار، 2 تکرار، 3 تکرار،4 تکرار، 5 تکرار) و لوکوس ms23 دارای 4 نوع الل متفاوت (1 تکرار، 2 تکرار،5/2 تکرار) می باشد و نیز لوکوس ms23، دارای الل null می باشد.
مطالعه حاضر برای اولین بار بر روی E. coli های جداشده از منابع آب استان البرز انجام شده است. میزان تنوع توالی های تکرارشونده در سویه های موردبررسی زیاد بود.