شناسایی miRNAها و ایزومیرهای جدید در بافت کبد گاوهای شیری

تعادل منفی انرژی (NEB) در گاوهای شیری پرتولید در چند هفته نخست پس از زایمان رخ می دهد و به دلیل اثرگذاری منفی بر باروری و سلامتی اهمیت اقتصادی زیادی در گله های گاو شیری دارد. بنابراین، شناسایی هر چه بهتر سازوکارهای تنظیمی موثر در این اختلال سوخت وسازی (متابولیکی) اهمیت دارد. یکی از عامل های تنظیمی موثر در NEB، miRNAها هستند. به رغم اهمیت NEB، سازوکارهای تنظیمی مربوط به miRNAها در این دوره به خوبی شناخته نشده اند. در این بررسی داده های miRNA-seq مربوط به بافت کبد هشت گاو شیری هلشتاین موجود در بخش GEO بانک اطلاعاتی NCBI برای شناسایی miRNAها و ایزومیرهای جدید تجزیه وتحلیل شدند. در مجموع، 291 miRNA جدید که ژن همتا (همولوگ) در دیگر گونه ها داشتند، و 164 miRNA جدید بدون همتا شناسایی شد. بررسی عملکرد ژن های هدف miRNAهای شناسایی شده نشان داد، این ژن ها در مسیرهای زیستی (بیولوژیکی) مرتبط با NEB نقش دارند. افزون بر این 446 ایزومیر و 95 miRNA* جدید برای نخستین بار در ژنگان (ژنوم) گاو گزارش شد. یافته های به دست آمده از این بررسی اطلاعات جدیدی برای درک بهتر نقش تنظیمی miRNAها در NEB فراهم می کند.