بررسی چند شکلی DNA در جمعیت های AG-4 Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP

توالی های DNA ریبوزومی به دلیل اینکه دارای کپی های زیادی از ژن های rRNA و نیز درجه بالایی از تغییر می باشند، به منظور بررسی روابط فیلوژنی در محدوده وسیعی از سطوح تاکسونومی مورد استفاده قرار می گیرند. نواحی ITS و فواصل داخل ژنی DNA ریبوزومی هسته ای، واحد های تکراری تکامل یافته ثابت می باشند و ممکن است در بین گونه های داخل یک جنس یا در بین افراد یک جمعیت متغیر باشند. به منظور ارزیابی چند شکلی نواحی حد فاصل ژن های s28 و s18 در ژنوم قارچ Rhizoctonia solani گروه آناستوموزی 4 (AG-4)، 28جدایه از میزبان های مختلف مورد ارزیابی قرار گرفتند. از جدایه ها DNA استخراج و از آن ها به عنوان الگو در واکنش های PCR استفاده شد. در تکثیر نواحی فاصله ساز داخلی بین ژن های ریبوزومی با استفاده از آغازگر های ITS1 و ITS4 یک قطعه DNA به اندازه 700 جفت باز ردیابی شد. قطعه مذکور با آنزیم های برشیTaq I Xba I، Hae III، Bam HI، Hind III، Sac I، Pst I، Nde I، Xho I، Hinc II، Hinf I، Eco RI، هضم شد. ولی آنزیم های Xba I، Bam HI، Hind III، Sac I، Pst I، Nde I، Xho I فاقد محل برش بودند. نتایج حاصله نشان داد که جدایه های Rhizoctonia solani AG4 هتروژن بوده و ITS-RFLP با استفاده از آنزیم Hinc II تفاوت بین زیرگروه های AG4-HG I و AG4-HG II رااز نظر الگوی برش آنزیمی نشان داد.