Oral Squamous Cell Cancer protein-protein interaction network interpretation in comparison to esophagus adenocarcinoma
Abstract:
Aim: The aim of this study is to present the oral Squamous Cell Cancer protein-protein interaction network interpretation in comparison to esophageal adenocarcinoma.
Background
Oral squamous cell cancer (OSCC) is a common disease worldwide, with poor prognosis and limited treatment. Thus, introducing molecular markers through network analysis can be helpful.
Methods
STRING database (DB) was applied for network construction through Cytoscape 3.4.0. Clue GO handled the gene annotation for the retrieved clusters. Eight proteins were indicated to be differential in the network constitution.
Results
The centrality and clustering analysis indicate that TP53 plays an over-significant role in network integrity among eight most central proteins including TP53, AKT1, EGFR, MYC, JUN, CDH1, CCND1, and CTNNB1. The suggested biomarker set is very similar to the related biomarker panel of esophageal adenocarcinoma.
Conclusion
The ontology analysis implies that the prominent proteins are involved in regulation of smooth muscle cell proliferation, regulation of fibroblast proliferation, and response to UV-A processes. In conclusion, these proteins and their associated biological processes may be more critical compared to other reported biomarkers for OSCC. Nevertheless, validation studies are required for confirming the pivotal role of potential candidates. Similar biomarker panel of this disease and esophagus adenocarcinoma is corresponded to the origin of the two malignancies.
Language:
English
Published:
Gastroenterology and Hepatology From Bed to Bench Journal, Volume:10 Issue: 2, Spring 2017
Pages:
118 to 124
magiran.com/p1700666  
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!