Gene Screening of Astrocytoma Grade III Relative to Grade II via Network Analysis: A New Molecular Insight
Message:
Article Type:
Research/Original Article (دارای رتبه معتبر)
Abstract:
Background
Astrocytomas (sub-group of gliomas) are central neuron system malignant diseases, which are originated from astrocytes. There are several documents about molecular mechanism of astrocytomas and many related genes are introduced. Here, gene expression profile alteration for grade III relative to grade II of astrocytoma is analyzed via protein-protein interaction (PPI) network to screen and introduce critical differentially expressed genes (DEGs).
Methods
The significant DEGs were extracted from gene expression omnibus (GEO) database and included in a PPI network by Cytoscape software. The common significant DEGs and central nodes of the network were selected and enriched by ClueGO to find related biological terms.
Results
Twenty critical genes including zinc finger protein 765 (ZNF765), zinc finger protein 540 (ZNF540), Zeste white 10 (ZW10) ZW10 interacting kinetochore protein (ZWINT), collagen type XVIII alpha 1 chain (COL18A1), protamine 2 (RRM2), kinesin family member 23 (KIF23), minichromosome maintenance 10 (MCM10), anaphase promoting complex subunit 7 (ANAPC7), NADPH oxidase activator 1 (NOXA1), ryanodine receptor 2 (RYR2), myozenin 3 (MYOZ3), myosin binding protein C (MYBPC2), fast type, keratin 17 (KRT17), zinc phosphodiesterase ELAC protein 2 (ELAC2), Abelson helper integration site 1 (AHI1), latent transforming growth factor beta binding protein 1 (LTBP1), kaptin (actin binding protein) (KPTN), BEN domain containing 3 (BEND3), cysteine and histidine rich 1 (CYHR1), and hyaluronoglucosaminidase 2 (HYAL2) were identified. Eight class of biological terms related to the critical genes were determined and discussed.
Conclusions
A wide range of the introduced significant genes indicates that there are several possible therapeutic ways to challenge astrocytoma.
Language:
English
Published:
International Journal of Cancer Management, Volume:11 Issue: 11, Nov 2018
Page:
8
magiran.com/p1903655  
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!