بررسی های زیست محاسباتی ویژگی های ساختاری و عملکردی پروتئین های Cry با هدف کنترل زیستی مالاریا

پیام:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:
مقدمه
امروزه تغییرات اقلیمی و کاربرد گسترده حشره کش های شیمیایی ظهور گونه های مقاوم پشه آنوفل و مخاطرات زیست محیطی فراوانی را در پی داشته است؛ ازاین رو، ارائه راهکارهای جایگزین ازجمله روش های کنترل زیستی چشم انداز روشنی برای مبارزه با این مخاطرات فراهم کرده است و در این میان، به باکتری های دارای قابلیت پشه کشی به ویژه Bacillus thuringiensisو پروتئین های اشتقاق یافته از آن نظیر پروتئین های سمی Cry توجه ویژه شده است؛ هرچند به بررسی ویژگی های ساختاری و عملکردی این سموم که در پژوهش حاضر با بررسی های in silico هدف گذاری شده چندان توجه نشده است.
مواد و روش‏‏ها: توالی پروتئینی Cry4، Cry11، Cry19، Cry24 و Cry 39از پایگاه داده NCBI دریافت و پایش ویژگی های ساختاری، عملکردی، فیزیکوشیمیایی، توپولوژیکی، ساختارهای ثانویه و الگو سازی سه بعدی آنها با برنامه هایی نظیر Interproscan، Protparam، TMHMM، Psipredو Modeller 9.15 انجام شد و درنهایت با تعیین گیرنده های مرتبط قابلیت عملکردی آنها با داکینگ مولکولی با نرم افزار Patchdock سنجیده شد.
نتایج
نتایج ویژگی های متنوع فیزیکوشیمیایی، غیرترشحی و تجمعی بودن سموم را نشان دادند. پایش عملکردی به ردیابی دمین هایی با عملکرد مشابه با سایر اعضای پروتئین های خانواده Cry منجر شد. پیش بینی ساختار ثانویه وجود مارپیچ ها و صفحات را طبق الگوی توزیع مشابه با یکدیگر نشان داد؛ همچنین طراحی و ارزیابی کیفیت ساختار در تمام پروتئین های سمی در حد مطلوب حاصل شد و ارزیابی میل اتصالی مبین اتصال تمام پروتئین های Cry به گیرنده های مربوطه و اتصال قوی تر Cry11 و Cry24 به بیشتر گیرنده ها بود.
بحث و نتیجه‏ گیری: نتایج پژوهش حاضر ضمن فراهم آوری داده های عملکردی مرتبط با سموم پروتئینی Cry، الگوی عملی استفاده بهینه از آنها مبتنی بر تولید سموم توانا بر اساس طراحی پروتئین های چندعملکردی در راستای کنترل زیستی پشه های مالاریا را فراهم کرد.
زبان:
فارسی
صفحات:
25 تا 40
لینک کوتاه:
magiran.com/p1938762 
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!