نخستین گزارش از گونه Neocosmospora vasinfecta جداسازی شده از خاک های بکر در ایران

در تابستان سال 1396، طی یک بررسی به منظور شناسایی گونه های قارچی از خاک های بکر استان کرمانشاه، نمونه های خاک از عمق 20-0 سانتی متری جمع آوری و از خاک جداسازی و سپس با روش تهیه رقت با استفاده از محیط کشت سیب زمینی دکستروز آگار صورت گرفت. در این بررسی، یک جدایه از خاک بکر (دامنه کوه) سومار واقع در منطقه قصر شیرین به دست آمد. میسلیوم در این جدایه به رنگ سفید مایل به کرم بود (شکل 1A). پریتسیوم نارنجی رنگ تا قرمز تیره، کروی تا گلابی شکل با گردن کوتاه، روزنه دار، دارای پریفیز و به ابعاد 240 تا 350 میکرومتر بود (شکل 1B). آسک ها سیلندری، دارای هشت آسکوسپور، دیواره نازک، غیرآمیلوییدی، با انتهای صاف و پدیسل کوتاه و به ابعاد 12–10 × 100–80 میکرومتر بود (شکل 1C). آسکوسپورها یک جداره، دارای دیواره مضرس، کروی تا بیضوی، شفاف و در زمان بلوغ قهوه ای و گاهی اوقات دارای قطره روغن و به ابعاد 63/9 × 23/11 میکرومتر بود (شکل 1D).براساس خصوصیات مورفولوژیکی، این جدایه Neocosmospora شناسایی شد.برای شناسایی گونه، اسخراج دی.ان.ای. به روش سی تب صورت گرفت و نواحی نسخه برداری شده داخلی دی.ان.ای. ریبوزومی هسته (ITS) و قسمتی از فاکتور طویل کننده ترجمه (TEF1) با واکنش زنجیره ای پلیمراز و جفت آغازگرهای ITS1/ITS4 و EF1F/EF1R تکثیر شدند. آنالیز فیلوژتیکی به روش بیشینه درست نمایی (Maximum likelihood) و با استفاده از نسخه 5 نرم افزار مگا صورت گرفت. در توالی یابی ناحیه نسخه برداری شده داخلی دی.ان.ای. ریبوزومی هسته و قسمتی از فاکتور طویل کننده ترجمه برای این جدایهتعداد 550 و 650 جفت باز به ترتیب به دست آمد که ناحیه نسخه برداری شده داخلی دی.ان.ای. ریبوزومی هسته 99 درصد با گونه Neocosmosporavasinfecta با شماره دسترسی KM231804 از کشور هند و فاکتور طویل کننده ترجمه 100 درصد با گونه ای به همین نام با شماره دسترسی JX997934 از فرانسه شباهت داشت. این جدایه با شماره دسترسی MG811579 برای ناحیه نسخه برداری شده داخلی دی.ان.ای. ریبوزومی هسته و با شماره دسترسی MH976665 برای فاکتور طویل کننده ترجمه در پایگاه اطلاعاتی بانک ژن ثبت گردید.آنالیز فیلوژنتیکی ناحیه نسخه برداری شده داخلی دی.ان.ای. ریبوزومی هسته با بیشینه درست نمایی صحت شناسایی گونه را تایید کرد و نمونه ما با ضریب اطمینان بالا همراه با نمونه های معتبر از کشورهای دیگر در یک گروه قرار گرفت (شکل 2). جدایه قارچ فوق در مجموعه قارچ های زنده وزارت جهاد کشاورزی در موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور (تهران) نگهداری می شود. این گونه برای فلور قارچی ایران برای نخستین بار از ایران گزارش می شود. نمونه بررسی شده: استان کرمانشاه، قصر شیرین، سومار، 45° 95 E, 33° 96 N، 5/4/1396، جداسازی شده از خاک بکر، شیما سعیدی (IRAN 3320 C).