بررسی همگنی ساختار ژنتیکی در جمعیت گوسفند نژاد زندی با استفاده از داده های ژنومی

داده های ژنومی می تواند ما را به چگونگی شکل گیری نژادها و جمعیت ها و روند تاثیرگذاری رخدادهای ژنتیکی هرچند کمیاب در گذر زمان رهنمون سازد. از موارد بسیار ارزشمند جهت حفظ ذخایر ژنتیکی که خود موضوعی پر اهمیت تلقی می گردد و همچنین بهبود برنامه های اصلاح نژادی، پی بردن به ساختار ژنتیکی جوامع مورد مطالعه است. جهت مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند زندی واقع در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند زندی تهران از روش آنالیز تفکیکی مولفه های اصلی (DAPC) و همچنین از آنالیز مولفه های اصلی (PCA) استفاده شد .پس از99 راس گوسفند نژاد زندی خونگیری و تعیین ژنوتیپ با تراشه های اسنیپ K50 شرکت ایلومینا صورت گرفت. روش تجزیه ی تفکیکی مولفه های اصلی، به وضوح ساختار ژنتیکی جمعیت مورد مطالعه و تفکیک حیوانات را در دو گروه نشان داد که می تواند ناشی از حساسیت روش DAPC باشد که قادر به بررسی همگنی واریانس در جوامع حیوانی است. در روش DAPC، برای ارزیابی تعداد بهینه ی خوشه با معیار BIC، 2=k بهترین نتیجه را نشان داد. بررسی نتایج حاصل جهت حفظ تعداد مولفه ی اصلی برای آنالیز تفکیکی، 31 مولفه ی اول را تعداد بهینه ی مولفه برای مراحل بعدی آنالیز در نظر گرفت. با توجه به اهمیت در نظر گرفتن واریانس درون گروهی و همچنین ساختار ژنتیکی جوامع جهت آنالیزهای مهم ژنومی مشخص شد که روش DAPC در مطالعه ی ساختار ژنتیکی گوسفند زندی به دلیل در نظر گرفتن تعداد مولفهی بیشتر و متعاقبا افزایش واریانس در نظر گرفته شده نسبت به روش PCA کاراتر می باشد.