ردیابی و تعیین ویژگی های مولکولی روتاویروس های پرندگان در مزارع گوشتی در گیلان

روتاویروس های پرندگان از عوامل مهم التهاب روده در پرندگان بوده و دارای گسترش جهانی می باشند. این ویروس ها نقش مهمی در سندروم کوتولگی و از رشد ماندگی در مرغ ها دارند. هدف این مطالعه ردیابی و تعیین ویژگی های مولکولی روتاویروس های پرندگان در مزارع گوشتی استان گیلان می باشد. در این مطالعه، 100 نمونه ازروده مرغان گوشتی سالم و بیمار در مزارع مختلف جمع آوری گردیدند و به وسیله روش RT-PCR بر روی ژن NSP4 مورد آزمایش قرار گرفتند. برای تعیین ویژگی های ویروس های ردیابی شده، از توالی یابی ژن NSP4 استفاده گردید. با استاده از RT-PCR روتاویروس های پرندگان در 46% نمونه ها ردیابی شدند. توالی یابی نسبی هفت ژن NSP4 و آنالیز فیلوژنتیکی آن ها نشان داد که ویروس ها متعلق به گروه A روتاویروس های پرندگان بوده و درصد شباهت بین آن ها 52/97 تا 100% است. تشابه توالی بین ویروس های این مطالعه و روتاویروس های مرغی قبلی 68/31 تا 5/99 % بود. در مقایسه با روتاویروس بوقلمون (Ty-1)، و روتاویروس کبوتر، شباهت به ترتیب بین 98/76 تا 22/78% و 75/74 تا 98/76% نشان داده شد. تفاوت های مشخصی بین روتاویروس های این مطالعه و روتاویروس های انسان و خوک با تشابه 19/31 تا 86/38% برای ویروس های خوک و 77/47 تا 02/48% برای ویروس های انسان مشاهده شد.
نتیجه گیری نهایی: این مطالعه، برای اولین بار، ویژگی های مولکولی روتاویروسهای پرندگان در ایران را تعیین نمود. نتایج این مطالعه نشان داد که گروه A روتاویروس های پرندگان یکی از پاتوژن های روده ای مهم در مرغ های گوشتی استان گیلان می باشند. مطالعه بیشتر بر روی ساختار کل ژنوم می تواند فرایند تکاملی روتاویروس های پرندگان در حال گردش در ایران را توضیح دهد.