Full Sequence Analysis and Characterization of Human Bocavirus Type 2 in South Korea
Message:
Article Type:
Research/Original Article (دارای رتبه معتبر)
Abstract:
Background
Human bocavirus (HBoV) is found worldwide and can infect the respiratory and gastrointestinal tracts of infants and children.
Objectives
The aim of the present study was to characterize the complete genome of a new HBoV2A strain isolated from a patient in Korea with gastroenteritis.
Methods
Viral genomic DNA was extracted from an HBoV-positive stool specimen isolated from 3-year-old female with gastroenteritis. Entire coding sequences were analyzed using a newly designed set of primers in the conserved regions in 2017.
Results
The full-length genome was 5,107 bp long. Phylogenetic analysis based on the complete genome sequence, including the three open reading frames (ORFs), indicated that CUK18 belonged to the HBoV2A genotype. The CUK18 strain showed the highest similarity with strain Nsc10-N386 isolated in Russia. Analysis of the ORF3, which encodes the viral capsid proteins VP1 and VP2, found that amino acid sequences corresponding to the three-fold-symmetry-related monomer were frequently substituted, a distinguishing feature of this specific genotype.
Conclusions
Results of this study may provide valuable information for HBoV epidemiology studies and vaccine development.
Language:
English
Published:
Jundishapur Journal of Microbiology, Volume:12 Issue: 4, Apr 2019
Page:
5
magiran.com/p1968837  
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!