Optimization of RT-qPCR for Detection of Aichi Virus in Sewage and River Water Samples in Karaj, Iran
Message:
Article Type:
Research/Original Article (دارای رتبه معتبر)
Abstract:
Background
Aichi virus (AiV) is an emerging virus, which belongs to Kobuvirus genus of the Picornaviridae family. AiV was recently determined as an etiologic agent of gastroenteritis in susceptible humans. After shedding of virus particles from affected people, AiV particles can contaminate water sources. Then, infection with this virus occurs in humans by the fecal-oral route after exposure with contaminated waters. Thus far, some research around the world demonstrated that different kinds of water sources including river water, ground water and treated or untreated sewage water have contamination with AiVs. Molecular detection of AiV has been mostly depended on reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) methods, which targeted 3CD junction region of the virus genome.
Methods
The present study aims to assess the molecular detection of AiVs in treated and untreated sewage water and river water specimens by the development of reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) assay for all AiV genotypes.
Results
Out of 50 samples tested (consisting of 28 river water samples and 22 sewage water samples), the AiV genomic RNA was identified in 15/28 (~50%) river water samples and in 14/22 (~70%) sewage samples.
Conclusion
Our results, for the first time, indicate that AiVs have been circulating in Iran.
Language:
English
Published:
Archives of Iranian Medicine, Volume:22 Issue: 5, May 2019
Pages:
242 to 246
magiran.com/p1988956  
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!