بررسی مولکولی جمعیت ماهی کیلکای معمولی (Clupeonella cultriventris) در حوضه جنوبی دریای خزر به روش PCR - RFLP

در این بررسی 100 عدد ماهی کیلکای معمولی از حوضه جنوبی دریای خزر (50 عدد از منطقه امیرآباد در استان مازنداران و 50 عدد از منطقه بندر انزلی در استان گیلان) جمع آوری گردید. DNA با روش فنل - کلوفرم از بافت باله ماهی استخراج شد. واکنش PCR با استفاده از یم جفت پرایمر از توالی نوکلوئیدهای ناحیه D-Loop مولکول mtDNA انجام شد که در نتیجه آن محصول PCR در کلیه نمونه ها حدود 1015 جفت باز بدست آمد. جهت هضم آنزیمی محصول PCR از 13 آنزیم مورد استفاده، 5 آنزیم (Nda II, Mae III, Msp I, Hae III, Acy I) الگوهای پلی مورفیک را نشان دادند که در نتیجه آن 9 هاپلوتیپ مختلف بدست آمد. فاصله ژنتیکی بین هاپلوتیپها از 0. 0073 تا 0. 0369 متغیر بود. میانگین عددی تنوع هاپلوتیپ ها 0. 7339±0. 00068 و تنوع نوکلوتیدی 0. 0000±0. 0098 بود. همچنین اختلاف نوکلوتیدی بین جمعیت ها 0. 01 درصد بود.
بر اساس نتایج حاصله و آنالیز آماری داده ها، تفاوت بین هاپلوتیپها معنی دار بود ((P? 0. 01 و بنابراین می توان گفت ساختار ژنتیکی متفاوتی بین دو منطقه نمونه برداری مشاهده گردیده است.