به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب ارسلان برازنده

  • نبی الله سالاری، یدالله بدخشان*، روح الله میرمحمدی، جمیل بهرام پور، ارسلان برازنده

    تریپتوفان سومین اسیدآمینه ضروری بدن و پیش ساز هورمون های مهمی مانند سروتونین و ملاتونین در بدن است. این اسید آمینه به دو مسیر متابولیکی کینورنین و سروتونین وارد و در یکی از این دو مسیر متابولیزه می شود، که تنها پنج درصد آن در مسیر سروتونین است و باقی آن در مسیر کینورنین وارد می گردد. به منظور بررسی تاثیر تزریق داخل صفاقی اسید آمینه تریپتوفان بر مصرف خوراک، دمای بدن و برخی متابولیت های بیوشیمیایی گوسفند 20 راس بره (10 راس نر و 10 راس ماده) هشت ماه سن، وزن 5/3± 9/24 کیلوگرم و در قالب طرح فاکتوریل استفاده شد. بره ها به دو گروه کنترل (تزریق سرم فیزیولوژیکی به صورت داخل صفاقی) و گروه تیمار (تزریق شده با 50 میلی گرم تریپتوفان/ کیلوگرم وزن بدن به صورت داخل صفاقی) تقسیم شدند. طول دوره عادت دهی بره ها به شرایط آزمایشی هفت روز بود. پس از تزریق بلافاصله خوراک کاملا مخلوط به نسبت 40 درصد کنسانتره و 60 درصد علوفه در اختیار بره ها قرار گرفت و در فواصل دو ساعت و به مدت چهار ساعت میزان مصرف خوراک اندازه گیری شد. میزان دمای رکتوم، ضربان قلب و تعداد تنفس در هر ساعت به مدت چهار ساعت انجام شد. این آزمایش نشان داد که خوراک مصرفی تجمعی در تیمار تریپتوفان نسبت به گروه کنترل کاهش یافت، هم چنین بره های ماده به طور معنی داری مصرف خوراک تجمعی کم تری داشتند (05/0<p). هم چنین تریپتوفان به روش تزریق صفاقی سبب افت مصرف خوراک تجمعی در دو ساعت اول آزمایش در مقایسه با گروه شاهد شد، اما در ادامه این کاهش جبران شد. تعداد ضربان قلب در جنس نر و تیمار تریپتوفان کاهش یافت (05/0<p). تزریق تریپتوفان به طور معنی داری باعث کاهش دمای رکتومی شد (05/0<p). تزریق تریپتوفان تاثیر معنی داری بر غلظت هورمون های T3 و T4 سرم بره ها نشان نداد (05/0>p)، اما نسبت هورمون T3 به T4 را کاهش داد (05/0<p). یعنی تبدیل هورمون تیروکسین به تری یدو تیرونین در گروه دریافت کننده تریپتوفان افزایش یافت. سطح کورتیزول، کلسترول، تری گلیسیرید، کراتین و اوره در بره های دریافت کننده تریپتوفان نسبت به گروه کنترل تفاوت معنی دار مشاهده نشد (05/0>p). غلظت آلبومین سرم در بره های دریافت کننده تریپتوفان نسبت به گروه کنترل کاهش یافت (05/0<p). با توجه به نتایج به دست آمده از این آزمایش و کاهش ضربان قلب و دمای رکتومی در تیمار تریپتوفان می توان نتیجه گرفت که تریپتوفان با تاثیر بر مکانیسم های مقابله با افزایش دمای بدن باعث بهبود وضعیت دام در شرایط تنش گرمایی شد.

    کلید واژگان: تزریق درون صفاقی, تریپتوفان, تنش گرمایی, متابولیت های خونی, گوسفند}
    Nabiallah Salari, Yadollah Badakhshan *, Rohallah Mirmahmoudi, Jamil Bahrampour, Arsalan Barazandeh

    Tryptophan is 3 th essential amino acid for the body. Also an important substrate for essential hormones such as serotonin and melatonin. This amino acid is metabolized in two ways in the body 1- Kynurunine pathway and 2- serotonin pathway. Tryptophan entry to These metabolizing pathways is five percent for serotonin production and ninety and five percent for kynurenine production. This experiment was performed to evaluate the Effect of intraperitoneal injection of the L-tryptophan on feed intake, rectal temperature, and some blood biochemical metabolites of the Kermani sheep breed. 20 eight-month-old lambs grouped in 10 males and 10 females in a factorial design. Lambs were divided into control groups (saline intraperitoneal injection) and treatment groups (intraperitoneal injection with 50 mg tryptophan amino acid/kg body weight ). The Control group of each gender was injected only with physiological serum intraperitoneally .immediately after injection, the feed was offered to them and cumulative feed intake was measured in 2 hours intervals for a four-hour duration. Feed was a total mixed ration consisting of 40 % concentrated and 60 % roughage. Heartbeat, respiration rate, and rectal temperature were measured every hour after amino acid or saline injection. This experiment showed that feed intake in tryptophan treatment was reduced compared to the control group, also female lambs had significantly lower cumulative feed intake (P<0.05). Heart rate decreased in males and tryptophan treatment (P<0.05). Tryptophan injection significantly reduced rectal temperature (P<0.05). Tryptophan injection did not show a significant effect on the serum concentrations of T3 and T4 hormones of lambs (P>0.05) but reduced the ratio of T3 to T4 (P<0.05). this means thyroxin converted to triiodothyronine more effectively in the group that received tryptophan amino acid. Levels of cortisol, total protein, cholesterol, triglyceride, creatine, and urea were not significantly different in the tryptophan-receiving lamb compared to the control group (P>0.05). Serum albumin concentration decreased in tryptophan-receiving lambs compared to the control group (P<0.05).blood Albumin level was decreased in tryptophan-injected lamb compared with the control group (P<0.05). According to the results of this experiment, reduction of heart rate and rectal temperature in tryptophan treatment, it could be concluded that tryptophan improves the condition of livestock under heat stress by affecting the mechanisms of coping with high ambient temperature. These mechanisms are related to heartbeat and respiration rate control centers that were affected by intraperitoneal injection of tryptophan amino acid. Tryptophan in route of intraperitoneal injection significantly reduced cumulative feed intake but this was compensated for some hours of post-injection.

    Keywords: Blood Parameter, Heat Stress, Intraperitoneal Injection, Kermani Sheep, L-‎Tryptophan‎}
  • ارسلان برازنده*
    پژوهش کنونی با هدف استفاده از فراتحلیل برای برآورد میانگین وزنی پارامترهای ژنتیکی صفات طول، قطر و درصد الیاف کرک با ادغام نتایج مطالعات پیشین جهت نیل به نتایجی با صحت بالاتر انجام گرفت. به این منظور از اطلاعات 14 مقاله مرتبط منتشر شده طی سال های 1367 تا 1400 استفاده شد. مدل فراتحلیل با اثرات تصادفی برای تخمین پارامترهای ژنتیکی، اشتباه استاندارد و فاصله اطمینان 95 درصدی صفات با استفاده از بسته Metafor در نرم افزار R بکار گرفته شد. مقدار میانگین وزنی ضریب وراثت پذیری صفات طول، قطر و درصد الیاف کرک به ترتیب 047/0 ± 24/0، 053/0 ± 42/0 و 103/0± 60/0 محاسبه گردید. نتایج بیانگر آن است که صفات مرتبط با الیاف کرک در بزهای کرکی وراثت پذیری های بالا دارند و بنابراین انتخاب ژنتیکی مستقیم و گزینش افراد با شایستگی مطلوب می تواند باعث بهبود عملکرد این صفات گردد. بالاترین مقدار همبستگی ژنتیکی و فنوتیپی بین درصد الیاف کرک و طول الیاف کرک (84/0و 54/0) و کمترین همبستگی ژنتیکی و فنوتیپی بین صفت درصد الیاف کرک و صفت قطر الیاف کرک (38/0و 35/0) به دست آمد. کاهش شدید اشتباه استاندارد تخمین وراثت پذیری صفات در روش فراتحلیل در نتیجه تجمیع نتایج و افزایش حجم نمونه نشان دهنده افزایش صحت تخمین نتایج است. پارامترهای ژنتیکی برآورد شده می توانند در توسعه برنامه های اصلاحی مرتبط با بهبود صفات الیاف کرک در بزهای کرکی استفاده شود. لذا نتایج حاصل از فراتحلیل می تواند موجب توسعه برنامه های اصلاح نژادی به ویژه در نژادهایی با تعداد رکورد ناکافی، گردد.
    کلید واژگان: بز, کشمیر, متاآنالیز, وراثت پذیری, همبستگی}
    Arsalan Barazandeh *
    By aggregating the previous studies, the present study aimed to perform a meta-analysis to estimate the weighted average of the genetic parameters of fiber length, fiber diameter and percentage yield of fiber in cashmere goats to increase the accuracy of estimations. The data of 14 related published papers between 1989 and 2021 were used. A model with random effects was used to estimate the genetic parameters, standard error and 95% confidence range of traits by using Metafor package in R environment. The weighted average of heritability estimates for length, diameter and percentage yield were 0.24 ± 0.047, 0.42 ± 0.053 and 0.60 ± 0.103, respectively. The obtained results indicated that the studied traits have high heritability estimates and therefore the direct genetic selection can lead to the improvement of the performance of these traits. The highest estimate of genetic and phenotypic correlations were obtained between the percentage yield and the fiber length as 0.84 and 0.54, respectively. The lowest genetic and phenotypic correlations were obtained between the percentage yield and the fiber diameter as 0.38 and 0.35, respectively. Sharp reductions in the standard errors of the heritability estimates due to aggregating the results and increasing the sample size, improve accuracy of the corresponding estimates. The genetic parameters estimated in the present study may be used for developing the breeding programs to improve the fiber traits in Cashmere goats. Therefore, the results of meta-analysis study can improve the breeding programs, especially in breeds with insufficient records.
    Keywords: Goat, Cashmere, Meta-Analysis, heritability, Correlation}
  • یدالله بدخشان*، زهرا رودباری، ارسلان برازنده
    هدف

    گابا اسید آمینه ی غیر پروتیینی است که از دکربوکسیله شدن گلوتامات توسط آنزیم گلوتامات دکربوکسیلاز بدست می آید. سیستم عصب مرکزی مملو از این اسیدآمینه می باشد، که به عنوان نورترانسمیتر اصلی مهاری در مغز عمل میکند. اثر بیولوژیک گابا بواسطه گیرنده های A,Bو C رخ می دهد که نوع A یونوتروپیک و دو نوع دیگر متابوتروپیک می باشند. وضعیت بیان ژنهای مسیر گاباارژیک در شرایط فیزیولوژیک مختلف متفاوت می باشد. یکی از این شرایط کرچی در طیور است که بررسی تحول این مسیر در وضعیت مرغ های با کرچی زیاد و بدون کرچی به کشف آن کمک خواهد کرد.

    مواد و روش ها

    ابتدا داده های مربوطه از پایگاه NCBI با شماره دسترسی DRA008396 در فرمت SRA دانلود گردیدند. در ادامه برای بررسی کیفیت داده ها از نرم افزار FastQC و برای ترمیم داده ها و حذف آداپتورها از نرم افزار Trimmomatic استفاده گردید. از وبسایت هستی شناسی برای تعیین مسیرهای متابولیکی ژنها و از نرم افزار STRING در جهت رسم شبکه ژنی و ژنهای هاب استفاده شد.

    نتایج

    در هیپوتالاموس مرغ های لگهورن غیر کورچ و مرغهای بومی کرچ 2943 ژن بیان شده مشاهده شد. که پس از آنالیز مسیر 7ژن مرتبط با مسیرهای گاباارژیک شناسایی شدند. این ژنها شامل آنزیم های تبدیل کننده گلوتامات به گابا دو نوع می باشند که GAD1 و GAD2 می باشد .هر دوی این آنزیم ها در مرغ های بومی کرچ در مقایسه با مرغ لگهورن کاهش بیان را نشان داد. گیرنده گابا A و G وB به طور معنی داری کاهش و گیرنده گابا نوع A زیرواحد Pi و گیرنده C زیرواحد R1 افزایش بیان در مرغ های بومی دچار کرچی نسبت به مرغ لگهورن در دادهای ترانسکریپتوم مشاهده شدند.

    نتیجه گیری

    از بررسی مقایسات ترانسکریپتوم مسیر گاباارژیک هیپوتالاموس میان مرغ لگهورن و مرغ بومی تفاوت معنی دار گیرنده ها، آنزیم های سنتز کننده گابا مشاهده گردید. در مرغ های تخم گذار گابا و گیرنده های آن بیان ژن بالایی دارند و احتمالا از بررسی مسیر گاباارژیک در مراحل مختلف دوره تولید مرغ های تخم گذار مشاهدات قابل توجهی متبادر خواهد شد.

    کلید واژگان: مرغ تخم گذار, کرچی, هیپوتالاموس, گابا, بیان ژن}
    Yadollah Badakhshan *, Zahra Roudbari, Arsalan Barazandeh
    Objective

    g-Aminobutyric acid (GABA) is a non-protein amino acid synthesized by decarboxylation of glutamate by the enzyme glutamic acid decarboxylase. The central nervous system (CNS) contains uniquely high concentrations of GABA, and GABA serves as a major inhibitory neurotransmitter. The biological effects of the amino acid neurotransmitter GABA are mediated by ionotropic GABA-A receptors, a family of ion channels, and by the metabotropic GABA-B receptor, a receptor coupled to the inhibitory G-protein. Gene expression Status of GABAergic circuit is changed under different physiological conditions. Broodiness is one of those conditions. Investigation on high broodiness occurrence breed and breed without broodiness would be able to declare this discrepancy of different in egg lying and broodiness condition.

    Material and methods

    available dataset of hypothalamus gene expression were downloaded from NCBI (http://www.ncbi.nlm.- nih.gov/sra/SRP082125). The transcriptional profiling of hypothalamus samples from leghorn and local hen in non-broodiness and broodiness condition respectively was carried out at 2 samples for treated and 2 samples for control group. The quality control of sequencing reads was carried out by FastQC software. Filtered reads were evaluated with FastQC. String database was used for the retrieval of interacting genes and Cytoscape software was used to visualize the network. Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) pathway analysis.

    Results

    In hypothalamus of non-broodiness and broodiness hens 2943 genes was expressed. After searching gene ID and analyzing 7 genes was identified as a GABAergic pathway. two enzymes involved in converting Glutamat to GABA, including GAD1 and GAD2. Both of them had down-regulation of expression in local hen compared to Leghorn hens. Gene reduction of GABAA, G and B receptors, gene increase expression of GABAA subunit of Pi and GABAC subunit of R1 was observed in local hen compared to Leghorn hens.

    Conclusion

    with investigation on transcription of GABAergic pathway of local and Leghorn hens, both GABA synthetic enzymes and GABA receptors showed significant difference. This showed more GABA receptor and GABA synthetic enzymes gene expression in lying hen and probably with survey of GABAergic pathway during different phase of egg production, more noticeable result would be declared.

    Keywords: laying hen, Broodiness, hypothalamus, GABA, Gene expression}
  • سمیه ابوالقاسمی، جمیل بهرام پور*، یدالله بدخشان، روح الله میرمحمودی، ارسلان برازنده

    تنش گرمایی یکی از عوامل استرس زا در دام ها به شمار می رود و آنتی اکسیدان هایی مانند ویتامینC در کاهش این اثرت می توانند مفید باشند. این پژوهش باهدف بررسی اثر تزریق درون صفاقی ویتامینC در طول استرس گرمایی حاد بر مصرف خوراک و برخی متابولیت های خونی گوسفند کرمانی انجام شد. این طرح پژوهشی در تنش حرارتی فوق حاد (شاخص حرارتی-رطوبتی 91/40) در مدت 12 روز عادت پذیری و سه روز نمونه برداری با 20 راس گوسفند نر و ماده نژاد کرمانی در چهار تیمار و پنج تکرار انجام گرفت. ویتامینC به میزان (mg/kg 100 وزن زنده گوسفند) و سرم فیزیولوژی (20 سی سی) در ساعت صفر به گوسفندان تزریق گردید. مصرف خوراک تجمعی در دو و چهار ساعت پس از تزریق اندازه گیری و بلافاصله خون گیری از سیاهرگ وداج انجام شد. نمونه های سرم جهت آنالیز متابولیت های خونی به آزمایشگاه فرستاده شدند. نتایج نشان داد تزریق درون صفاقی ویتامین C مصرف خوراک تجمعی را در سطح معنی داری (01/0<p) نسبت به تیمار های دریافت کننده سرم فیزیولوژی کاهش داد و سبب کاهش متابولیت های آلبومین و کلسترول و تری گلیسیرید در سطح (01/0< P) نسبت به تیمار های دریافت کننده سرم فیزیولوژی گردید بااین حال تزریق درون صفاقی ویتامینC بر پروتیین کل، گلوکز، کراتین و اوره ی خون در سطح (05/0 <p) تاثیری نداشت. در مجموع نتایج نشان داد استفاده از ویتامینC سبب کاهش مصرف خوراک تیمار های تحت استرس گرمایی و بهبود پارامترهای خونی در مواجهه گوسفندان با استرس گرمایی گردیده است.

    کلید واژگان: ویتامین C, مصرف خوراک, متابولیت های خونی, گوسفند کرمانی, تنش گرمایی حاد}
    Somayeh Abolghasemi, Jamil Bahrampour *, Yadollah Badakhshan, Rooholah Mirmahmoodi, Arsalan Barazandeh

    Heat stress is one of the stressors in livestock. Vitamin C has antioxidant properties and can help reduce heat stress ether. This study aimed to investigate the effect of intraperitoneal injection of vitamin V during acute heat stress on feed intake and some blood metabolites of Kermani sheep. This study was performed in Shahid Beheshti Research Station of Jiroft University under super-acute heat stress for three days. Treatments included male and female sheep divided into four treatments and five replications, so the treatments differed in sex and drug intake. The drug was injected at zero hours, and feed intake was measured at two and four hours after injection. Finally, blood samples were taken from the venous vein in the fourth hour after the drug injection. Serum samples were sent to the laboratory for analysis of blood metabolites. The results showed that intraperitoneal vitamin C injection significantly reduced feed intake (P <0.01). Albumin, cholesterol, and triglyceride metabolites were reduced (P <0.01) by vitamin C injection. However, vitamin C was reduced. There was no effect on total protein, glucose, creatine, and blood urea at the level of (P <0.05). The results showed that vitamin C reduced heat stress in sheep and improved physiological status and hormonal and blood parameters.

    Keywords: vitamin C, feed intake, Blood metabolites, Kermani sheep, Acute heat stress}
  • ارسلان برازنده*
    هدف

    به دلیل اهمیت اقتصادی پشم گوسفند، تاکنون تحقیقات گسترده ای در زمینه ساختار و اساس ژنتیکی آن صورت گرفته است. شناسایی ژن های موثر بر صفات اقتصادی از اهداف مهم اصلاح نژادی در پرورش گوسفند است. از پتانسیل ژنتیکی و عملکردی ژن ها می توان در جهت دستیابی به محصولات تولیدی با بهترین کیفیت و کمیت استفاده نمود. برای تجزیه و تحلیل داده های حجیم، روش های تعیین توالی مقرون به صرفه ای وجود دارد که به درک مکانیسم ها و زمینه ژنتیکی صفات مختلف کمک کرده است. شناسایی ویژگی های متفاوت ژن های کاندید و انواع ژنوتیپ های مرتبط با صفات مهم فنوتیپی، در اصلاح نژاد حیوانات ضروری است. لذا، هدف از مطالعه حاضر شناسایی ژن های موثر بر تولید الیاف پشم در گوسفند بر پایه آنالیزهای عملکردی آن ژنها می باشد.

    مواد و روش ها

    ابتدا داده های مورد استفاده برای این تحقیق از پایگاه داده ای GEO با شماره دسترسی GSE85844 دانلود شدند. در پژوهش حاضر معیار انتخاب ژن ها تفاوت بیان در دامنه (<-0.3 0.3< LogFC) و آماره P-value در سطح کمتر از 5 درصد بود. پس از شناسایی و مشخص شدن ژن ها با تفاوت معنی دار برای آنالیز هستی شناسی ژن ها از پایگاه داده DAVID استفاده شد. به منظور بررسی برهمکنش و ارتباط بین ژن های درگیر در تولید الیاف پشم از پایگاه اطلاعاتی STRING استفاده و آنالیز شبکه توسط بسته نرم افزاری Cytoscape انجام شد.

    نتایج

    تعداد 1008 ژن با بیان متفاوت و معنی دار شناسایی شد (p<0.05). ژن ها با Log FC <- 0.3 بیان پایینی دارند و تعداد آن ها 431 عدد بود و ژن های با Log FC> 0.3 بیان بالایی دارند و تعداد آن ها 577 عدد است. نتایج هستی شناسی برای ژن های CHRD و PLOD1 BMP4 و ITGA5 نشان داد که این ژن ها در مسیرهای مرتبط با مورفوژنز و ساخت تارهای مو، بازسازی فولیکول های مو و توسعه و تراکم پوست موثر هستند.

    نتیجه گیری

    انتخاب برای بهبود کیفی در پشم تولیدی در گوسفندان با استفاده از این یافته ها، سبب تسریع پیشرفت ژنتیکی برنامه های اصلاح نژادی مرتبط خواهد گردید.

    کلید واژگان: پشم, آنالیز شبکه, بیان ژن, هستی شناسی}
    Arsalan Barazandeh *
    Objective

    The importance of wool has led to extensive research on its structure and genetic since decades ago. Identifying genes affecting economic traits is one of the most important goals of breeding in sheep. The genetic and functional potential of genes can be used to obtain animal products with the best quality and quantity. For the analysis of large data, sequencing software is cost-effective, which has greatly helped to understand the mechanisms and genetic background of various phenotypic traits in sheep. Identifying different characteristics of candidate genes and types of genotypes related to important phenotypic traits is essential in animal breeding. Therefore, the aim of the present study is to identify the genes affecting the production of wool fibers in sheep based on the functional analysis of those genes.

    Materials and methods

    In order to identify genes affecting wool fibers in sheep, the data used in this research were downloaded from the GEO database with access number GSE85844. In the current study, the criterion for selecting genes is the expression difference in the range 0.3 < LogFC <-0.3 and P-value at the 5% level. After identifying and specifying the genes with significant difference (increased and decreased expression), DAVID database was used to analyze the ontology of genes. In order to investigate the interaction and relationship between the genes, the STRING database was used and the Cytoscape software package was utilized to analyze the created network.

    Results

    1008 genes with different and significant expression were identified (p<0.05). Genes with Log FC <-0.3, have low expression and their number was 431, and genes with Log FC > 0.3 have high expression and their number is 577. The ontology results for CHRD, PLOD1, BMP4 and ITGA5 genes showed that these genes are effective in the pathways related to hair morphogenesis and construction, hair follicle regeneration and development and density of skin.

    Conclusions

    selecting to improve the quality of wool produced in sheep by using these findings will accelerate the genetic progress of related breeding programs.

    Keywords: wool, Network Analysis, Gene expression, Ontology}
  • جمیل بهرام پور *، علیرضا عربپور، مرتضی مختاری، ارسلان برازنده، فهیمه دلفاردی

    به منظور شناسایی ریسک فاکتورهای موثر بر سقط جنین در جمعیت گوسفند و بز در جنوب کرمان دو پرسشنامه تهیه شد که پرسشنامه اول مربوط به ریسک فاکتورهای انفرادی و محیطی مربوط به مادر و جنین و پرسشنامه دوم مربوط به ریسک فاکتورهای مربوط به دام ها و گله بود. تحلیل داده ها با استفاده از نرم افزار Minitab و به روش رگرسیون انجام و ضریب همبستگی و درجه معنی داری برای متغیرهای پیش بین ارائه شد. نتایج نشان داد که میانگین سن مادران سقط جنین کرده 33/4 ماه و میانگین سن جنین سقط شده برابر با 3/5 ماه بود. هم چنین واکاوی داده ها نشان داد که بیش ترین میزان جنین های سقط شده مربوط به سن 3 تا 4 ماهگی با حدود 57 درصد و کم ترین میزان سقط در جنین های کم تر از یک ماه و با حدود 6 درصد بود. 80 درصد سقط ها در داخل جایگاه، 34 درصد سقط ها دوقلو و 81 درصد سقط ها در آب و هوای گرم اتفاق افتاد. سیستم نگه داری و منطقه در میزان بروز سقط جنین تاثیر معنی داری داشت به طوری که دام های نگه داری شده در سیستم آزاد و دام های نگه داری شده در مناطق گرم به طور معنی داری میزان سقط جنین بیش تری داشتند. با افزایش سن دام ها و تعداد دام های گله میزان سقط جنین به طور معنی داری افزایش یافت. تغذیه دستی و استفاده از مواد ضدعفونی کننده باعث کاهش میزان سقط جنین به طور معنی داری شد و با کاهش نسبت آخور به دام سقط جنین به طور معنی داری افزایش پیدا کرد.

    کلید واژگان: عوامل محیطی و انفرادی, سقط جنین, جنوب کرمان, دام سبک}
    Jamil Bahrampour *, Alireza Arabpour, Morteza Mokhtari, Arsalan Barazandeh, Fahimeh Dalfardi

    In order to identify the risk factors affecting abortion in sheep and goat population in southern of Kerman, two questionnaires were prepared, the first was related to individual and environmental risk factors related to mother and fetus and the second questionnaire was related to risk factors related to livestock and herds. Data analysis was performed using Minitab software and regression method and the correlation coefficient and significance for the predictor variables were presented. The results showed that the mean age of mothers was 33.4 months and the mean age of aborted fetuses was 3.5 months. Data analysis also showed that the highest rate of aborted fetuses occurred at the age of 3 to 4 months with about 57% and the lowest rate of abortions occurred in fetuses less than one month old with about 6%.80% of abortions on the farm, 34% of abortions were twins and 81% of abortions occurred in hot weather. The results of this study showed that the maintenance system and the region had a significant effect on the incidence of abortion and in animals that kept in the open system and animals kept in warm areas had significantly higher abortion rates. With increasing the age of livestock and the number of livestock, the rate of abortion increased significantly. Manual feeding and use of disinfectants significantly reduced the rate of abortion. With decreasing ratio of manger to livestock Abortion increased significantly.

    Keywords: Abortion, Sheep, goat, Risk factors, Kerman}
  • نصیر کریمی، محمدتقی بیگی نصیری*، ارسلان برازنده

    بهره وری اقتصادی پرورش گوسفند تا حد زیادی تحت تاثیر میزان زنده مانی آن است. هدف این مطالعه بررسی پارامترهای ژنتیکی صفات زنده مانی گوسفند عربی از تولد تا یک‌سالگی بود. بدین منظور از تعداد 5452 رکورد زنده مانی بره های نژاد عربی که طی سال های1371 تا 1383 توسط سازمان جهاد کشاورزی شهرستان اهواز جمع آوری شده بود استفاده گردید. داده ها با مدل های خطی و نسبت خطر با تابع ویبال تجزیه شدند. این مدل ها شامل اثر عوامل ثابت سال و ماه تولد بره، نوع تولد، سن مادر و متغیر کمکی وزن تولد بره ها به صورت درجه دوم و اثرات تصادفی ژنتیکی افزایشی مستقیم، ژنتیکی افزایشی مادری، محیط دایمی مادری و باقی مانده بودند. وراثت پذیری مستقیم میزان زنده مانی بره ها با مدل های مختلف خطی، در بازه 025/0 تا 061/0 برآورد گردید. وراثت پذیری های مستقیم در مقیاس لگاریتمی، مقیاس اولیه و وراثت پذیری موثر نسبت خطر به دست آمده از مدل پدری دارای تابع ویبال دامنه 13/0 تا 75/0 را نشان داد. نتایج بیانگر وراثت پذیری کم برای مدل های خطی و متوسط تا بالا برای تابع ویبال بود. تخمین های متوسط تا بالای وراثت پذیری صفات بقا، با استفاده از مدل های نسبت خطر با تابع ویبال، می تواند ایده بهبود بقای بره از طریق انتخاب درون نژادی و گنجاندن آن در شاخص انتخاب نژاد گوسفند عربی را مورد توجه قرار دهد.

    کلید واژگان: زنده مانی, گوسفند عربی, وراثت پذیری}
    Nasir Karimi, MohammadTaghi Beigi Nassiri *, Arsalan Barazande
    Introduction

     Arabi sheep population includes almost 55% of the local sheep population in Khuzestan province. Lamb mortality is a universal problem in sheep breeding that may be reached to 20-40% of total lambs born and could impact the genetic improvement, animal welfare and economic viability of sheep breeding, adversely. Research on improving survival of lambs is likely to have a higher pay-off than research on improving the number of lambs conceived. Lamb survival is a compound trait affected by many various factors related to climate, management, lamb and ewe behavior and genetic effects. Lamb survivability is controlled by genetics of the animal, contributed by direct genetic and maternal effects and also by environmental effects. There are disagreements among researchers about using a suitable model to analyze the survival traits, and each researcher has suggested the use of specific models. In general, the use of linear and threshold models has been suggested for survival trait analysis. Although survival has great economic importance, in the studies conducted on Iranian livestock, less attention has been paid to it. The aim of this study was to analyze the genetic parameters for the survival of Arabi lambs from birth to one year of age using linear and Weibull models.

    Materials and Methods

     in this study, 5452 lamb survival records collected by the Jahad Agricultural Organization of Ahvaz from 1993 to 2005 were used. Traits included were cumulative survival from birth to the end of one year and on a monthly basis. In order to estimate genetic parameters using linear models, the Restricted Maximum Likelihood (REML) method was used in Wombat software based on a univariate analysis. The Weibull model and Matvec software were also used for estimating variance component and genetic parameters of Survival rate.

    Results and Discussion

     Different models compared using the likelihood ratio test. For survival traits until 1, 4, 5, and 10 months, the model 4 was suitable, which include the direct additive genetic effect, maternal additive genetic effect and their covariance. In the case of until 2 months, the best model was the model 3, which include the direct and maternal additive genetic effects. For until 3, 8, 9, and 12 months, model 1 including direct additive genetic effect was selected. And for other traits Model 5 (direct additive genetic, maternal additive genetic, and maternal permanent environmental effects) was chosen as the best model. The direct heritability of survival rate estimated from different linear models was in the range of 0.025 to 0.061. In general, despite the high economic importance of survival in the breeds until one year of age, due to low estimates of the inheritance of these traits using linear models, it cannot be expected that genetic selection alone can make significant genetic progress. The genetic variance component among sires, heritability on the logarithmic scale, heritability on the original scale, and effective heritability obtained from Weibull sire model were increased to a peak point at 4 months. After that, a decline occurred until 5 months, and then a fluctuation was observed until 9 months. A limited increase was found in the 11 and 12 months. The heritability of sire model, in the logarithmic scale, had a low to medium range (0.13-0.25), and in the original scale had a medium to high range (0.39-0.75). The effective heritability was estimated in the medium range. Estimated values of the survival heritability using the Weibull model was greater than the value obtained from the linear animal model. Although heritability estimations for survival and mortality is low, it is possible that genetic progress may be enhanced by selecting lambs with higher breeding value for survival.

    Conclusion

     Estimation of the genetic parameters for survival lambs from birth to one year of age using linear and Weibull models were low vs medium to high, respectively. Therefore, based on the results of linear models, response to  direct selection to improve the survival of lambs in this breed will be very slow, and more attention should be paid to improving non-genetic factors and indirect selection and outbreeding, but based on The results of Weibull models, it seems that the rate of response to genetic selection to improve survival trait is faster using these models compared to the linear models, suggest that lamb survival could be improved  through direct selection and could be included in the Arabi sheep selection  index.

    Keywords: Arabi sheep, Heritability, Survival}
  • زهرا رودباری*، عبدالوهاب ابراهیم پور گرجی، ارسلان برازنده
    هدف

    استفاده از تکنیک های زیست شناسی مولکولی برای تولید واکسن های جدید علیه سویه های مختلف ویروس بیماری نیوکاسل (NDV)  موضوع گزارش های تحقیقاتی اخیر بوده است. توسعه تکنیک های بهبودیافته برای تعیین توالی ژنوم منجر به شناسایی مکانیسم های محافظتی و شناسایی آنتی ژن های احتمالی کاندید شده است؛ تحقیق حاضر با هدف طراحی یک اپی توپ نوترکیب در برابر عوامل اتصال در ویروس نیوکاسل در پرندگان انجام شده است.

    مواد و روش ها

    در این تحقیق برای ساختن واکسن نوترکیب از روش های بیوانفورماتیکی استفاده شده است تا با استفاده از آنتی ژن های ضد این ویروس، آنتی ژن های HN و F این بیماری را کنترل و از بین ببریم. برای اتصال این اپی توپ ها، از لینکرهای انعطاف پذیرمانند AAY  و  KK به عنوان پیونددهنده های ساختار انتخاب شدند. این ساختار حاوی 309 اسیدآمینه است. فاکتورهای مهم بیولوژیکی این واکسن نوترکیب مانند خصوصیات فیزیکی-شیمیایی، ساختارهای مختلف، پایداری، اختلال پروتئین ذاتی، حلالیت و حساسیت زایی این ساختار واکسن با استفاده از تجزیه وتحلیل سیستم ایمنی بدن ارزیابی شد.

    نتایج

    تجزیه و تحلیل های مختلف پایداری این ساختار را تایید کرد و اپی توپ های پیش بینی شده در واکسن نوترکیب پتانسیل بالایی را برای القای پاسخ ایمنی سلول Bهای و T نشان داد؛ بنابراین، تجزیه وتحلیل سیستم ایمنی نشان داد که واکسن چند اپی توپی می تواند به درستی پاسخ های ایمنی سلول T و B را تحریک کند و به طور بالقوه می تواند برای برنامه های پیشگیری یا کنترل استفاده شود. از نتایج این مطالعه می توان برای کنترل و از بین بردن بیماری نیوکاسل در آینده پس از تایید اثربخشی آن با استفاده از روش های ایمونولوژیک تجربی استفاده کرد.

    کلید واژگان: طراحی واکسن, چند-اپی توپ, نیوکاسل, HN. F}
    Zahra Rodbari *, Abdolvahab Ebrahimpour Gorji, Arsalan Brazandeh
    Objective 

    Application of molecular biology techniques to the production of new vaccines against different strains of the Newcastle disease virus (NDV) has been the subject of recent research reports. Development of improved techniques for genome sequencing has led to the recognition of protective mechanisms and the identification of possible candidate antigens. The present research aimed to design a recombinant chimeric immunogen against binding agents in Newcastle virus in birds.  

    Materials and methods

    Therefore, we conducted this investigation to make a recombinant vaccine in silico in order to control and eliminate this disease using anti-leptospirosis epitopes, F, and HN antigens. To bind these epitopes, KK, as AAY linkers, were selected to bind the structure. This structure contained 309 amino acids. The important biological factors of this recombinant vaccine, such as physicochemical properties, different structures, stability, intrinsic protein disorder, solubility, and allergenicity of this vaccine structure were evaluated using immune system analysis.  

    Results

    Various analyses confirmed the stability of this structure, and the epitopes predicted in the chimeric vaccine showed a high potential for inducing the immune response of B cell and T cell. Thus, immune system analysis revealed that the modeled multi-epitope vaccine could properly stimulate T and B cell immune responses and could potentially be utilized for prophylactic or control applications.  

    Conclusion 

    The results of this study could be employed to control and eliminate leptospirosis in the future after confirming its effectiveness by experimental immunological assays

    Keywords: Newcastle, Vaccine design, F, HN, Multi- epitope}
  • ارسلان برازنده، مرتضی مختاری، الهام بهدانی، زهرا رودباری*

    فولیکول مو قسمتی از پوست است که مو را تولید و چرخه رشد مو را کنترل می کند. فولیکول مو مرکزی برای رشد الیاف مهم از نظر اقتصادی در صنعت دامپروری است. مطالعات نشان داده اند که تغییرات در سطح بیان ژن ها در رشد و نمو فولیکول مو تاثیر دارد. با وجود پیشرفت های اخیر در شناسایی شبکه های هم بیانی ژن ها و سیگنال های مولکولی که بر توسعه پوست و رشد فولیکول مو حاکم است، مکانیسم های تنظیم کننده ساخت الیاف بز کرکی، هنوز شناسایی نشده است. از این رو، پژوهش کنونی برای بررسی مهمترین مولکول های کنترل کننده رشد و نمو فولیکول های الیاف در بز کرکی و رمزگشایی ژن های درگیر در رشد و نمو فولیکول های الیاف انجام شد. به این منظور، از داده های مربوط به توالی یابی رونوشت های پوست جنین بزهای کرکی شانبی در سه مرحله رشد استفاده شد. آنالیز بیان افتراقی رونوشت ها نشان داد که در تمام طول روند رشد فولیکول بیان 145 ژن افزایش و بیان 650 ژن کاهش داشته است. از بین ژن هایی با بیان افتراقی، ژن های تنظیمی هم بیان بر اساس نتایج واکاوی پارامترهای آماری شبکه و مستند سازی کارکردی شناسایی شدند که شامل: SHH، KLF4، MMP9،MSX1، KRT17 ، COL2A1و VEGFA بودند. بر اساس نتایج حاصل از پژوهش کنونی ژن هایی با اثرات عمده شناسایی شدند که تنظیم کننده شبکه های بیانی ژن ها و سیگنال های مولکولی مرتبط با ساخت الیاف بز کرکی هستند. این ژن ها با توجه به مستند سازی عملکردی می توانند نقش قابل توجهی در بهبود اصلاح نژاد بز کرکی ایفا کنند.

    کلید واژگان: آنالیز رونوشت, الیاف بز کرکی, بیان افتراقی, شبکه تنظیمی بیان}
    Arsalan Barazandeh, Morteza Mokhtari, Elham Behdani, Zahra Roudbari*
    Introduction

    In most mammals, each hair follicle is a mammalian skin organ that produces hair and controls the hair growth cycle. The hair follicle is central to most economically important fiber growth in livestock. Previous studies have shown that changes in the level of genes expression play a role in the development and growth of hair follicles. With the advent of high throughput, next-generation sequencing technology measuring the level of expression of thousands of genes was possible simultaneously. As a result, many regulatory conflicts between genes can be extracted from these data. Expression profiles are generated by combining expression levels resulting from experiments in various conditions or times. Similarities and differences between expression profiles reveal many of these regulatory relationships. Despite recent advances in the identification of the molecular signaling/co-expression networks that govern the development of the skin and hair follicle, the mechanisms controlling of fiber production in Cashmere goat still remains unclear. Therefore, the present study was conducted to investigate the most important molecules controlling the growth and development of hair follicles in cashmere goats in order to decode the genes involved in the growth and development of hair follicles in cashmere goats.

    Materials and Methods

     Publicly available preprocessed transcript data (accession no. SRP059481) was downloaded from the NCBI database in the SRA section. In this investigation, nine goats were selected at the same stage of gestation. Three fetuses were obtained at 55-65 days’ gestation (60-days old) and three fetuses were obtained at 105-125 days’ gestation (120 –day- old) through cesarean operation and three fetuses were also sacrificed within two hours of birth (newborn). For analysis of RNA-seq data, a random sampling from the right mid-side of the fetal skin and each time point had three replicates. The 60 days (E60) of gestation represented the initiation stage of growth, and the 120 d (E120) represented the development stage, as well as the newborn samples, represented the primary hair follicle maturation stage. The FastQC software (Version 11.7) was used to check the quality of the readings. This software check the quality of the reads, in case of low-quality sequencing, the data were edited by Trimmomatic software (Version 0.39), and filtered reads were evaluated with FastQC software, After removing low-quality reads mapping was performed on the goat reference genome (GCA_001704415.1) downloaded from the ensemble site using the Hisat2 software(Version 2.1.0). The HTSeq2 (Version 10.0) was used to create the count matrix, changes in the expression of genes between the groups (E60, E120, and newborns) was identified using the software Deseq2 (Version 1.24). In this stage, the genes between the two groups were compared to give an expression difference 1- Genes that are expressed throughout the growth process of the follicle 2. Co-Expression networks of up and down genes were created using the STRING database (Version 11) at https://string-db.org. The PPI network was constructed by Cytoscape software (Version 3.6.0). Cytoscape is commonly used for analysis and visualization of biological networks. Gene ontology analysis of effective gene related to development stage of hair follicle in Cashmere goat from fetal to birth was done using DAVID database.

    Results and Discussion

    After determining the level of expression of each gene at different stages of sampling, genes that increased expression in all comparisons were considered as up-regulated genes that, by increasing their expression, control the growth and development of hair follicle. On the other hand, those genes that have been shown to reduce expression in all of the follicle growth stages comparisons were considered as genes which by decreasing their expression, causes the growth and development of the hair follicle. The interaction relations were investigated between the increased and reduced genes expressed separately by STRING database. Among the up-regulated genes, the relationships between 145 genes with 203 edge were confirmed. Also, the interaction network between the down-regulated genes confirmed between 650 genes with 1302 edge. Among the genes with differential expression, the co-expression genes (genes with the most interacting) were identified based on the results of the analysis of the statistical parameters of the network using computational algorithms in Cytoscape software. These results led to the identification of seven unique genes that were SHH, KLF4, MMP9, MSX1, KRT17, COL2A1 and VEGFA, ontology analysis of these genes showed that involved the hair cycle process, hair follicle development, skin epidermis development, epidermis morphogenesis and epidermal cell differentiation that these pathways are activated in the cashmere production process. Therefore, these genes have been used as regulators of cashmere growth and development to better understand the cashmere production process and improve its quality.

    Conclusion

    The results have been able to introduce genes with major effects that regulate the expression of genes and molecular signals associated with the production of fiber that including KLF4, MMP9, MSX1, KRT17, COL2A1 and VEGFA in Cashmere goats. Based on functional analysis, these genes can play a significant role in the improvement of cashmere goats breeding. We hope that the obtained results would be beneficial toward finding the smart strategies for Cashmere production improvement.

    Keywords: Cashmere goat, Differential expression, Regulatory network, Transcriptome analysis}
  • مرتضی ستائی مختاری*، ارسلان برازنده، مسلم مقبلی دامنه، زهرا رودباری

    در پژوهش کنونی از اطلاعات جمع آوری شده طی سال های 1372 تا 1389 در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد بز کرکی رایینی برای ارزیابی صفات تولیدمثلی 1312 راس بز ماده نژاد کرکی رایینی و استنباط روابط علی بین آن ها استفاده شد. صفات تولیدمثلی بررسی شده شامل تعداد بزغاله های متولد شده از هر بز مولد، تعداد بزغاله های شیرگیری شده از هر بز مولد، مجموع وزن تولد بزغاله ها از هر بز مولد و مجموع وزن شیرگیری بزغاله ها از هر بز مولد بودند. سه مدل ارزیابی ژنتیکی شامل مدل های چندصفتی استاندارد، چندصفتی یک طرفه براساس دانش پیشین و چندصفتی براساس الگوریتم جستجوی IC با استفاده از رویکرد بیزین بر داده ها برازش داده شدند. مقایسه مدل های مذکور با معیار انحراف اطلاعات (DIC)، میانگین مربعات خطا (MSE) و همبستگی پیرسون بین مقادیر مشاهده شده و پیش بینی شده  نشان داد مدل چندصفتی براساس الگوریتم جستجوی IC نسبت به دو مدل دیگر DIC کمتر و برای کلیه صفات MSE کمتر و  بیشتری دارد که بر مطلوبیت آن در ارزیابی ژنتیکی صفات مورد بررسی دلالت دارد. همچنین، تغییر رتبه حیوانات براساس ارزش اصلاحی آن ها تحت مدل های چندصفتی استاندارد و چندصفتی براساس الگوریتم IC نیز لزوم توجه به روابط علی میان صفات برای دستیابی به رتبه بندی صحیح دام های مولد را نشان داد.

    کلید واژگان: روابط علی, صفات تولیدمثلی, قابلیت پیش بینی, معادلات ساختاری}
    Morteza Sattaei Mokhtari *, Arsalan Barazandeh, Moslem Moghbeli Damaneh, Zahra Roudbari

    In the present study, data collected from 1993 to 2011 in Raeini Cashmere goat breeding station were used for genetic evaluation and inferring causal relationships among reproductive traits applying structural equation models. The studied lifetime reproductive traits were included the overall number of kids born (OLSB), the overall number of kids weaned (OLSW), the overall litter weight at birth (OLWB) and the overall litter weight at weaning (OLWW). Three models including standard (SMM), recursive based on prior knowledge (PRM) and recursive based on inductive causation algorithm (ICM) multivariate models were used for genetic evaluation of animals under the Bayesian approach. The comparisons of the investigated models via deviance information criterion (DIC), mean square error (MSE) and Pearson's correlations between observed and predicted records () revealed that ICM had lower DIC and MSE and higher () for all the studied lifetime reproductive traits; implying the more plausibility of ICM over SMM and PRM. Furthermore, re-raking of the animals under SMM and ICM confirmed the importance of considering the causal relationship among the traits for ensuring accurate ranking of animals according to their breeding values.

    Keywords: causal relationships, predictive ability, Reproductive traits, structural equation models}
  • محبوبه کرد، محمدرضا محمدآبادی*، علی اسماعیلی زاده کشکوئیه، ارسلان برازنده

    در این مطالعه از رکورد های طول عمر 772 راس میش داشتی ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند کرمانی واقع در شهرستان شهربابک استان کرمان که طی سال های 1368 تا 1387 جمع آوری شده بودند، استفاده شد. توزیع فراوانی علل حذف و تابع توزیع زنده مانی میش ها با استفاده از نرم افزار R پیش بینی شد. همچنین، از مدل ویبال و نرم افزار Matvec برای پیش بینی اجزای واریانس و فراسنجه های ژنتیکی صفت طول عمر به عنوان بقاء، استفاده شد. متوسط طول عمر تولیدی میش ها در این مطالعه 72/4 سال به دست آمد که به طور متوسط 4/3 بره در طول عمر خود داشته اند. بیماری بالاترین علت حذف میش ها (53 درصد) را به خود اختصاص داد. پس از بیماری به ترتیب پیری، مشکلات باروری، تولید پایین شیر، مشکلات پستانی، کشتار آزمایشی، حادثه فیزیکی و در آخر تیپ نامناسب (5/0 درصد) بیشترین درصد حذف میش ها را شامل شدند. با افزایش سن احتمال شرطی تلفات روند افزایشی را نشان داد، ولی برعکس آن میزان زنده مانی تجمعی روند کاهشی نشان داد. نسبت خطر مرگ تا سن چهار سالگی به طور جزیی، ولی بعد از آن به شدت افزایش نشان داد. وراثت پذیری ها در مقیاس لگاریتمی، مقیاس اولیه و وراثت پذیری موثر نسبت خطر حاصل شده از مدل پدری و دارای تابع ویبال در حد کم به بالا (002/0 تا 145/0) پیش بینی شدند. نتایج حاصله بیانگر آن است که جهت افزایش طول عمر و زنده مانی میش ها باید علاوه بر بهبود شرایط محیطی و بهداشتی و تصمیمات مدیریتی و کاربردی به اصلاح ژنتیکی نیز اهتمام ورزید.

    کلید واژگان: طول عمر اقتصادی, علل حذف, میش کرمانی}
    Mahboobeh Kord, Mohammadreza Mohammadabadi*, Ali Esmailizadeh Koshkooieh, Arsalan Barazandeh
    Introduction

    The Kermani sheep breed is one of the most important native breeds in Iran. It is well adapted to the harsh and undesirable environmental conditions of the southeastern part of the country. Therefore, consideration to the breeding of Kermani sheep and the improvement of the environmental and genetic conditions of this breed can contributed greatly to providing a part of the livelihood needs of the people. The longevity in the ewe is a high economic trait, because increasing the longevity will lead to a reduction in the culling rate as well as replacement costs in the herd and increasing of number of lambs. Considering that the investigation and identification of the important factors influence culling of ewes from the herd, which leads to a decrease in the yield and longevity of the animal, can be used to provide and develop a suitable strategy to promote the survival and longevity of the ewes. In addition, due to the absence of genetic parameters of production life length in Kermani sheep, the aim of this study was to study changes, prediction of components of variance and genetic parameters of survival distribution function in Kermani ewes.

    Materials and Methods

    In this research, longevity records of 772 heads of Kermani ewes (collected from 1989 to 2008) at the Kermani sheep station (Shahr Babak, Kerman province) were studied. The overall production life length was equal to the time between births to ewe culling. Frequency distribution for causes of culling and survival distribution function for ewes were estimated using R software. The Weibull model and Matvec software were also used for estimating variance component and genetic parameters of longevity traits as survival.

    Results and Discussion

    The results showed that the mean of ewe’s longevity was 4.72 years with average lambing of 3.4 in life time. The most important cause of culling was disease (53%), especially in the first three parity of the ewe. After disease, oldness, reproductive problems, low production, physical phenomenon, experimental slaughter, selling additional ewes and bad type (0.5%) are the accounted causes for remaining ewe culling, respectively. Considering that culling due to disease accounts for more than half of the deaths, prevention and treatment of diseases are important in this breed. Therefore, the type and timing of the prevalence should be investigated and preventive and therapeutic proceeding should be taken for diseases. The total amount of non-optional culling (illness, physical incidence, and aging) was about 83% of total casualties. It can be concluded that the deletion due to the low production was very small. At the age of two and three, the mortality rate was low, reaching its peak at the age of four, has declined since this age, with partial fluctuations between the ages of 5 and 6, and at the age of 7 and 8 years decline have happened. Therefore, most ewes were culled from the herd before reaching the age of 8. Most culling has occurred in pre-maturity ages, so it should be taken into consideration because it indicates that the ewes were eliminated before they reach the peak of production.The conditional culling probability increases with age, while cumulative survival rate decreased with age of ewe. The hazard ratio of death increased with age up to 6 years of old steadily and then increased strongly, and reached two at 7 to 8 years of old. The high hazard ratio indicated an early death or short longevity. Normally, inverse of this ratio expresses useful information. The reversal of this ratio at a certain time interval, provided that the hazard level remains constant at this interval, will indicate the time it takes to occur (death). For example, at a time interval of 3 to 4 years, the ewe's longevity will be equal to a reversal of 0.5298, equivalent to two years. But, for 7 to 8 years old, the reciprocal of two will be 0.5 years that indicating if the dangers remain constant at this interval, the ewe's life will be only 6 months, and ewes remaining in this group will be lost after 6 months. Trend of survival and hazard ratio at different ages of ewes can be provided as a model to breeders of this breed. Heritability on the logarithmic scale, the original scale and effective heritability of the risk ratio obtained from the sire model with the Weibull function was predicted at low to high (0.002-0.145). Although heritability estimates for longevity are low, but genetic improvement may be increased by selecting animals with higher inbreeding values.

    Conclusion

    The results of this study showed that the most effective factor in shortening the longevity and decreasing survival in Kermani ewes is culling due to disease, especially in pre-maturity. Therefore, in order to improve the longevity, necessary studies and necessary preventive should be taken regarding the type and timing of the disease. Genetically, if possible, it would seek to create genetic resistance to diseases and environmental conditions. On the other hand, the results of models with the Weibull function indicate that in order to improve the survival rate and longevity, in addition to improving the non-genetic factors, the selection should be considered within the breed. Also, high heritability traits with high genetic correlation with longevity traits are identified and indirect selection be done based on them.

    Keywords: Cause of culling, Economic life length, Kermani ewe}
  • زهرا رودباری، مرتضی ستایی مختاری، ارسلان برازنده، حمیدرضا سیدآبادی*
    توجه به وجود باقی مانده هورمون های محرک رشد در لاشه حیوانات کشتار شده در کشتارگاه به عنوان یک خطر بالقوه برای سلامت افراد جامعه ضروری می باشد. پژوهش حاضر با هدف شناسایی بیومارکرهایی جهت تشخیص استفاده غیرقانونی از محرک های رشد استروئیدی در کشتارگاها انجام شد. برای این منظور در ابتدا آنالیز بیان افتراقی ژن ها در یک پروفایل بیان ژنی موجود در پایگاه داده Arrayexpress با شماره دسترسی E-GEOD-12179، شامل مقایسه ی بافت ماهیچه گاو گوشتی که هورمون محرک رشد دریافت کرده با گاو گوشتی که هیچ محرک رشدی دریافت نکرده است انجام شد. از بین ژن هایی با بیان متفاوت، ژن های هدف با استفاده از تجزیه و تحلیل پارامترهای آماری شبکه شناسایی شدند. ژن های شناسایی شده شامل: MAPK1 ،EDN1 ،TGFB1 ،BMP4 و PPARA بودند. سپس آنالیز مسیرهای ژنی، ساخت و آنالیز شبکه بیانی ژن ها بر اساس ژن های هدف، با استفاده از نرم افزارهای Pathvisio، Cytoscape و Pathwaystudio انجام شد. تجزیه و تحلیل مسیرهای ژنی نشان داد، مسیرهای فاکتور رشد بتا، گیرنده فاکتور رشد و آزادسازی هورمون گنادوتروپین معنی دار می باشند. همچنین نتایج این تجزیه و تحلیل نشان داد که این ژن ها در تنظیم فعالیت های پایه ای سلول تکثیر، تمایز و نمو و فرایند هایپرتروفی ماهیچه نقش دارند. بنابراین این ژن ها پتانسیل معرفی به عنوان بیومارکر بیان ژنی در رابطه با تشخیص استفاده از محرک های رشد استروئیدی را دارند و نشانگرهای جدیدی را برای تشخیص مصرف غیر قانونی محرک های رشد استروئیدی در کشتارگاه ها فراهم می کنند.
    کلید واژگان: بیومارکر کاندیدا, تشخیص تقلبات, مسیر بیولوژی, واکاوی بیان ژن}
    Zahra Roudbari, Morteza Sattaei Mokhtari, Arsalan Barazandeh, Hamid Seyedabadi *
    Consideration of the residual growth hormones in the carcass of slaughtered animals in the slaughterhouse is necessary as a potential risk to the health of the community. The present study aimed at identifying biomarkers to detect the illegal use of growth stimulating hormones in slaughter houses. For this purpose, the differential expression analysis of the genes in a gene expression profile in the Arrayexpress database with the accession number E-GEOD-12179 was initially comprised of a comparison of the muscle tissue of the beef cattle receiving the growth stimulating hormone with beef cattle muscle, which did not receive any growth stimulating hormones. Among genes with different expression, target genes were identified by analyzing the statistical parameters of the network. The identified genes were MAPK1, EDN1, TGFB1, BMP4, and PPARA. Then the pathway analysis of the gene, generating and analyzing the expression network of genes based on target genes were performed using Pathvisio, Cytoscape and Pathway studio software. Analysis of pathways showed that beta-cell growth factor, growth factor receptor, and gonadotropin hormone release were significant. Also, the results of this analysis showed that these genes play a role in the regulation of cellular cell proliferation, differentiation, development, and process of muscle hypertrophy. Therefore, these genes have the potential for introduction as biomarkers of gene expression in relation to the detection of the use of growth promoters and provide new markers for detecting illegal use of growth stimulating hormones in slaughterhouses.
    Keywords: Candidate biomarker, Fraud detection, Biology pathway, gene expression analysis}
  • سکینه دهقان، امیر موسایی *، امیدعلی اسماعیلی پور، ارسلان برازنده
    به منظور بررسی اثر تغذیه مکمل روی - متیونین بر عملکرد رشد، قابلیت هضم مواد مغذی خوراک، فراسنجه های تخمیری شکمبه و برخی متابولیت های خون، آزمایشی روی 15 راس بره نر کرمانی با میانگین وزن اولیه 88/0±1/32 کیلوگرم در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تیمار و پنج تکرار به مدت هشت هفته انجام شد. تیمارهای آزمایشیشامل جیره پایه فاقد مکمل روی (شاهد) ، جیره پایه حاوی 50 میلی گرم روی در کیلوگرم جیره از مکمل روی-متیونین و جیره پایه حاوی 100 میلی گرم روی در کیلوگرم جیره از مکمل روی - متیونین بود. نتایج آزمایش نشان داد که بره های تغذیه شده با جیره حاوی 100 میلی گرم مکمل روی، مصرف خوراک روزانه کمتری از تیمارهای دیگر داشتند (01/0>P). بره هایی که در جیره خود 50 میلی گرم روی دریافت کردند، افزایش وزن روزانه بالاتری در مقایسه با گروه شاهد داشتند (05/0>P). بره هایی که در جیره خود مکمل روی - متیونین دریافت کردند (50 یا 100 میلی گرم در کیلوگرم) ضریب تبدیل بهتری داشتند (05/0>P). قابلیت هضم ظاهری ماده خشک، ماده آلی و الیاف نامحلول در شوینده خنثی (NDF) در بره های تغذیه شده با جیره حاوی 50 میلی گرم مکمل روی بیشتر از بره های گروه شاهد بود (05/0>P). با وجود این، تفاوتی در قابلیت هضم چربی و الیاف نامحلول در شوینده اسیدی (ADF) بین تیمارهای آزمایشی مشاهده نشد. تغذیه مکمل روی - متیونین تاثیری بر pH و مقدار نیتروژن آمونیاکی مایع شکمبه و غلظت سرمی گلوکز، پروتئین تام، تری گلیسرید و اوره بره ها نداشت. براساس نتایج این پژوهش، استفاده از 50 میلی گرم مکمل روی در هر کیلوگرم جیره، قابلیت هضم مواد مغذی خوراک را افزایش داده و در مقایسه با 100 میلی گرم از این مکمل، تاثیر بهتری بر عملکرد رشد بره های پرواری دارد.
    کلید واژگان: افزایش وزن, بره پرواری, روی آلی, فراسنجه های بیوشیمیایی, قابلیت هضم}
    Sakineh Dehghan, Amir Mousaie*, OmidAli Esmaeilipour, Arsalan Barazandeh
    In order to investigate the effect of feeding zinc-methionine (Zn-Met) supplementation on growth performance, nutrients digestibility, ruminal fermentation parameters and some blood metabolites, an experiment was conducted on fifteen Kermani male lambs with average initial body weight of 32.1 ± 0.88 kg as a completely randomized design with 3 treatments and 5 replicates for 8 weeks. The experimental treatments were basal diet without supplemental Zn (Control), basal diet plus 50 mg Zn/kg diet of Zn-Met, and basal diet supplemented with 100 mg Zn/kg diet of Zn-Met. The results showed that lambs fed with 100 mg/kg diet of Zn supplementation had lower feed intake than the other treatments (P<0.01). Lambs received 50 mg Zn /kg of diet had higher average daily gain than those on control diet (P<0.05). Lambs fed with Zn supplementation (50 or 100 mg/kg) had better feed conversion ratio than the control group (P<0.05). The apparent digestibility of dry matter, organic matter and neutral detergent fiber (NDF) was higher in lambs fed 50 mg/kg of Zn supplementation than those of the control (P<0.05). However, no difference in fat and acid detergent fiber (ADF) digestibility was observed between treatments. Additionally, feeding Zn-Met supplementation diet had no significant effect on pH and ammonia nitrogen of ruminal fluidas well as serum glucose, total protein, triglyceride and urea concentrations of lambs. According to these results, feeding 50 mg/kg diet of Zn supplemented increases feed nutrients digestibility and compared with 100 mg of the supplement, has better effects on growth performance of fattening lambs.
    Keywords: biochemical parameters, Digestibility, Fattening lamb, Organic zinc, Weight gain}
  • فاطمه محمدی نژاد، محمدرضا محمد آبادی*، ارسلان برازنده، مسعود اسدی فوزی
    سابقه و هدف
    علیرغم تغییرات زیاد در کشاورزی به دلیل پیشرفت های صنعتی، جهانی شدن و پیشرفت های تکنولوژیکی، جمعیت بز در جهان افزایش یافته است. پرورش بز یکی از عناصر کلیدی دخیل در اقتصاد کشاورزانی دارد که در نواحی خشک و نیمه خشک دربرگیرنده بیشتر مساحت ایران زندگی می کنند. حدود 30 میلیون راس بز کرکی در سراسر جهان وجود دارد که 5/4 تا 5 میلیون راس از آن ها در ایران پرورش داده می شوند. بز کرکی راینی مهمترین نژاد کرکی کشور بوده و در جنوب شرقی ایران گسترده است و برای تولید گوشت و کرک نگهداری می شود. تقریبا سه میلیون راس از این نژاد در استان کرمان وجود دارد. در سال های اخیر برنامه ملی اصلاح نژاد به منظور مطالعه و حفاظت از تنوع ژنتیکی این نژاد اجرا شده، ولی منجر به پیشرفت زیادی در سوددهی اقتصادی آن نشده است که یکی از دلایل آن می تواند فقدان یک شاخص انتخاب اقتصادی برای صفات پایه در برنامه اصلاح نژاد باشد. زنده مانی یکی از صفات مهم اقتصادی و از عوامل تاثیرگذار بر درآمدزایی گله ها است زیرا هر گونه مرگ و میر یا حذف زودهنگام دام درآمد دامدار را کاهش می دهد. بنابراین، ورود این صفت در برنامه های اصلاحی می تواند منجر به بهبود آن و در نتیجه بازدهی اقتصادی بیشتر شود. با توجه به اهمیت زنده مانی و اینکه تا کنون زنده مانی بزهای کرکی راینی مطالعه نشده است، هدف از این مطالعه بررسی تابع توزیع زنده مانی بزغاله های کرکی راینی از زمان تولد تا یکسالگی بود.
    مواد و روش ها
    در این پژوهش از رکورد های زنده مانی تعداد 3055 راس بزغاله (حاصل از 201 راس بز نر و 1309 راس بز ماده)، مربوط به گله ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد بز کرکی راینی واقع در شهرستان بافت که طی سال های 1386-1372 جمع آوری شده بودند، استفاده شد. توزیع فراوانی علل حذف و تابع توزیع زنده مانی بزغاله ها تا سن یکسالگی با استفاده از نرم افزار R برآورد شد.
    یافته ها
    میزان حذف بزغاله ها از تولد تا سن یکسالگی برابر با 09/22 درصد می باشد که مقدار آن در سه ماه اول، دوم، سوم و چهارم به ترتیب 2/11، 08/5، 17/2 و64/3 درصد می باشد. مهمترین دلایل حذف به ترتیب اولویت مازاد پرواری و مرگ در اثر بیماری بوده است. میزان زنده مانی تجمعی بزغاله ها از تولد تا سن یکسالگی 91/77 درصد بود. ضریب تابعیت میزان زنده مانی از سن نشان داد که روزانه 048/0 درصد از زنده مانی بزغاله ها کاهش می یابد.
    نتیجه گیری
    با توجه به بالاتر بودن میزان تلفات در سه ماهه اول زندگی بزغاله ها پیشنهاد میگردد در نحوه مدیریت و سیستم پرورش بزغاله ها تجدید نظر گردیده و در کنار آن بهبود ظرفیت ژنتیکی و لحاظ نمودن صفت زنده مانی در برنامه های اصلاح نژادی مدنظر قرار گیرد.
    کلید واژگان: بز کرکی راینی, زنده مانی, صفات اقتصادی, مرگ و میر}
    Fatemeh Mohammadinejad, Arsalan Barazandeh, Masoud Asadi Fozi, Mohammadreza Mohammad Abadi *
    Background And Objectives
    The goat population has increased globally despite major changes in agriculture due to industrial mergers, globalization, and technological advances in the developed countries. Goat farming is one of the key elements contributing to the economy of farmers living in the arid and semi-arid regions including most areas of Iran. There are 30 million heads of cashmere goats around the world and 4.5-5 million heads of cashmere goats are bred in Iran. Raini goat is one of the most important Iranian native goats that spread in the southeast of Iran where these animals are kept for both meat and cashmere production. There are almost 3 million heads of this trait in Kerman province. Although many breeding programs were performed, but have not led to much progress in its economic profitability. One of these reasons can be lack of an economic selection index for basic traits. Survival is one of the most important economic traits and effects on income of farmers, because death or early culling of animals decreases income of breeders. Hence, considering this trait in breeding programs can improve it and increase economic performance of animals. Considering the importance of survival, and the fact that survival of Raini goats has never been studied, the aim of this study was to estimate survival distribution function in Raini kids from birth to yearling.
    Materials And Methods
    Data set used in this study were 3055 records of kids (from 201 male goats and 1309 female) related to the breeding station of Raini goat located in the Baft city of Kerman province, collected during the years 1992 to 2007. The frequency distribution for causes of culling and survival distribution function of kids to yearling age was estimated by R software.
    Results
    The overall kids’ culling up to yearling age was 21.09 percent, which in the first, second, third and fourth triplet months was 11.2%, 5.08%, 2.17%, and 3.64%, respectively. The most causes of removing kids from the flock were extra-fattening kids and mortality due to illness, respectively. The accumulative survival from birth to yearling age of kids was 77.91 percent. The regression coefficient of survival showed that the survival rate decreased by 0.048 percent per day.
    Conclusion
    Considering the higher mortality rate in the first 3 months of life, it can be recommended to reconsider in the way of management and breeding system, improve genetic capacity and involve survival trait in breeding programs.
    Keywords: Survival, Economic traits, Mortality, Raini Cashmere Goat}
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال