به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب امیر حسین بیکی

  • امیر حسین بیکی*
    زعفران یک گیاه تریپلوئید و عقیم است که در همه کشورها به عنوان یک ادویه و گیاه دارویی مورد استفاده قرار می گیرد. کلاله مهم ترین قسمت گیاه زعفران می باشد. تاکنون هیچ روش مطمئن مولکولی برای شناسایی و پیش بینی گونه های دارای کلاله سه و چند شاخه ارائه نشده است. در این بررسی بر اساس نشانگر های مولکولی چندشکلی توالی مربوط تکثیر یافته و با استفاده از الگوریتم های بیوانفورماتیکی مختلف،روش های جدیدی برای پیش بینی کلاله زعفران ارائه شده است. پنج آلل M131400، M151200، M151100، M10850 و G6500 به عنوان مهم ترین دسته بندی کننده با دقت پیش بینی بالا بر اساس مدل های Attribute Weighting انتخاب شدند که دارای پتانسیل بالایی برای خوشه بندی و تشخیص کلاله سه شاخه ازچند شاخه هستند. دسته بندی بدون یادگیری بر اساس الگوریتم های K-Means و K-Medoids قادر به خوشه بندی صحیح کلاله زعفران هستند. نتایج نشان می دهد که برای اولین بار، روش های داده کاوی می توانند شیوه ای بسیار موثر، با دقت و صحت بالای 90 درصد برای تمایز ژنتیکی کلاله سه شاخه از چند شاخه مورد استفاده قرار گیرد. این روش ها می توانند در مکان یابی ژنی و انتخاب به کمک بیومارکرها مورد استفاده قرار گیرند.
    کلید واژگان: چندشکلی توالی مربوط تکثیر یافته, مارکر مولکولی, یادگیری ماشینی}
    Amir H. Beiki *
    Saffron is a triploid، sterile plant، used as a spice and medicinalplant in all countries. Stigma is the most important part of saffron. So far no reliable molecular methods were provided to identify and prediction of the three/multi branches species. In this study، using different bioinformatics algorithms، new tools for prediction based on Sequence-Related Amplified Polymorphismmolecular markers is presented. Five alleles M1311400، M151200، M12100 and M10850 selected as the most important classifier by Attribute Weighting models which has the potential to cluster and recognize the three from multi branches stigma. K-Means and K-Medoids unsupervised clustering algorithms were fully able to cluster each genotype to the right classes. Our results showed that for the first time، data mining techniques can be effectively used to genetic differentiation between three and multi stigma with above 90 percent the accuracy andprecision. These methods can use in gene mapping and selection by biomarker.
    Keywords: Classifier, Machine learning, Molecular marker, Sequence, Related Amplified Polymorphism}
  • امیرحسین بیکی*، ناهید عباسپور، جواد مظفری
    جنس Crocus شامل تقریبا هشتاد گونه است که عمدتا توسط گونه زراعی آن Crocus sativus شناخته می شود. تنوع ژنتیکی میان 16 نژادگان جنس فوق در ایران برای اولین بار توسط نشانگر ISSR مورد مطالعه قرار گرفت. چهارده نشانگر، در مجموع 208 قطعه قابل تشخیص و تکرار پذیر تولید کردند که تمام قطعات چند شکل بودند. قطعات ایجاد شده بر اساس وجود و عدم وجود امتیاز دهی شدند و از داده های فوق برای محاسبه ضرایب شباهت دایس، جاکارد و تطابق ساده استفاده گردید. دندروگرام مربوطه توسط نرم افزار NTSYSpc (نسخه 02/2) و بر اساس الگوریتم Complete Linkageو UPGMA ترسیم گردید. تجزیه و تحلیل خوشه ای، نژادگان را به پنج گروه اصلی تقسیم نمود. علاوه بر این، نمودارهای به دست آمده از تحلیل PCoA نیز نژادگان را به پنج گروه تفکیک می نماید. قدرت تفکیک تجمعی برابر با 134، میزان کمینه قدرت تفکیک برابر با 87/4 در آغازگر UBC872 و میزان بیشینه برابر با 5/15 در آغازگر UBC851و متوسط قدرت تفکیک برابر با 6/9 می باشد. نتایج به دست آمده سودمندی بالای نشانگر های ISSR را برای گروه بندی گونه های Crocus و تحلیل روابط زنتیکی آنها را نشان می دهد.
    کلید واژگان: انگشت نگاری, تنوع ژنتیکی, زعفران, قدرت تفکیک, ISSR}
    The Crocus genus، which comprehends approximately 80 species، is known mainly for the cultivated species Crocus sativus. Genetic variability among 16 genotype of Crocus genus originating from Iran was examined for the first time with Inter Simple Sequence Repeat (ISSR). Fourteen primers generated a total of 208 discernible and reproducible bands across the analyzed populations، that all of these showed polymorphism. The fragment scored for presence/absence and used to generate Dice، Jaccard and Simple Maching similarity coefficients and to construct a dendrogram by means of UPGMA and Complete Linkage in NTSYS-pc 2. 02 computer program. Cluster analysis revealed primarily five major groups. Furthermore، dimensional graph derived from Principal Coordinate Analysis (PCoA) of ISSR data also revealed a pattern in which the genotypes were assigned into five separate groups. Estimation of Resolving Power (RP) values exhibited a collective rate of 134. 08 and varied from 4. 87 for UBC 872 to 15. 5 for UBC 851 with a mean of 9. 6. The results showed the high effectiveness of ISSR markers in grouping of Crocus species under study، and analysis of their genetic relationships.
    Keywords: Fingerprinting, Genetic Diversity, Saffron, Resolving power, ISSR}
  • محمدرضا معفوی فرد، جعفر احمدی، امیر حسین بیکی
    زیره سبز با نام علمی Cuminum cyminum، گیاهی یکساله از خانواده چتریان است که در ایران به صورت توده های بومی کشت می شود. این گیاه یکی از قدیمی ترین گیاهان دارویی و با ارزش اقتصادی بالا می باشد. در این پژوهش از سه توده زیره سبز تهیه شده از استان های خراسان، کرمان و فارس استفاده گردید. ریز نمونه ها که شامل قطعاتی از کوتیلدون و هیپوکتیل حاصل از بذور جوانه زده بودند، در محیط کشت گامبورگ با ترکیبات هورمونی مختلف کشت شدند. آزمایش به-صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی پیاده گردید. فاکتورهای مورد استفاده شامل هورمون NAA با سه غلظت 2/0، 4/0 و 6/0 میلی گرم در لیتر، IAA با دو غلظت 2/0 و 4/0 میلی گرم در لیتر و BAP با غلظت صفر و 1/0 میلی گرم در لیتر و سه توده بومی زیره بودند. نتایج آزمایش نشان داد که هر سه توده تولید پینه های فشرده، سخت و به رنگ سفید مایل به سبز نمودند. با واکشت پینه ها به محیط تازه مراحل تولید جنین های رویشی از قبیل کروی، قلبی، نیزه ای و لپه ای شکل مشاهده شد. سپس جنین ها تولید نوساقه نمودند. نو ساقه های طویل شده به طول یک تا دو سانتی متر پس از بریده شدن از روی پینه به محیط ریشه زایی MS همراه با 2/0 میلی گرم در لیتر IAA منتقل و همه آن ها ریشه دار شدند. گیاهچه های ریشه دار شده نهایتا به گلدان های حاوی خاک شنی و خاک برگ استریل به نسبت 1:1 انتقال داده شدند. پس از 20 تا30 روز گیاهچه ها تولید گل نمودند. هیچ گونه گیاه فاقد کلروفیل مشاهده نشد و همه گیاهان از نظر ظاهری سالم بودند. در این پژوهش توده خراسان با ترکیب هورمونی 4/0 میلی گرم در لیتر IAA + 2/0 میلی گرم در لیتر NAA + 1/0 میلی گرم در لیتر BAP بیشترین پینه زایی و باززایی را نشان داد.
    کلید واژگان: زیره سبز, بهینه سازی, پینه, باززایی}
    Mafavi Fard, M. R., Ahmadi, J. Beiki, A. H
    Cumin (Cuminum cyminum) is an annual plant from Umbliferus family that is cultivated in Iran as landraces. This plant is one of the oldest plants with pharmaceutical and economical importance. In this experiment cumin seeds were collected from Khorasan، Kerman and Fars provinces of Iran. Explants were cultured in Gamborg media with hormonal components. Factorial experiment with four factor based on completely randomized design (CRD) was conducted. Factors that used in this experiment consist of three hormones، i. e. NAA with three levels 0. 2، 0. 4 and 0. 6 mg/L، IAA with two levels 0. 2 and 0. 4 mg/L and BAP with two levels zero and 0. 1 mg/L concentrations، and cultivar with three levels (three cumin landraces). The results showed that each of landraces produced hard، compact and white greenish color calli. After subculturing، embryogenesis stages consist of globular، turpido، heart and cotilidonary shapes were observed. Then thiny shoots were produced by embryos. Elongated shoots were cute from callus and transferred to rooting media with 1/2 MS salt and 0. 2 mg/L IAA. All of the shoots produced roots successfully. Fully developed plantlets with well-developed root and shoot systems were transferred to pots containing sterile sandy soil. After 20-30 days، the plantlets started to flowering. No albino or abnormal plants observed. The analysis of results showed that Khorasan landrace at hormonal component with 0. 4 mg/L IAA+ 0. 2 mg/L NAA + 0. 1 mg/L BAP had the maximum callus production and plant regeneration.
    Keywords: Cuminum cyminum, Optimization, Callus, Regeneration}
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال