امیرمرتضی ابراهیم زاده نامور
-
زمینه و هدف
در حال حاضر اشریشیا کلی به عنوان یکی از عوامل اصلی عفونت های باکتریایی مجاری ادراری در نظر گرفته
می شود. هدف از مطالعه حاضر، تعیین فراوانی ژن های Necrotizing factor type 1; CNF1 و Hemolysin; Hly در بین سویه های اشریشیا کلی جدا شده از بیماران بیمارستان روحانی شهرستان بابل می باشد.مواد و روش هادر این مطالعه توصیفی، 82 سویه اشریشیا کلی مورد بررسی قرار گرفت. در ادامه تست آنتی بیوگرام انجام و DNA باکتری استخراج و فراوانی ژن های CNF1 و Hly به کمک واکنش زنجیره ای پلیمراز مورد ارزیابی قرار گرفت. [j1]
یافته هادر بررسی مقاومت آنتی بیوتیکی، مقاومت به اریترومایسین (9/71 درصد) 59 و ایمی پنم (0 درصد) بود. هم چنین درصد سویه های مقاوم به چند دارو 7/31 درصد و فراوانی ژن های CNF1 و Hly به ترتیب 28 درصد و 9/32 درصد بود.
نتیجه گیریبا توجه به نتایج، فراوانی ژن های CNF1 و Hly در بین سویه های مورد مطالعه، مشابه با مطالعات دیگر بود.
کلید واژگان: اشریشیا کلی, عفونت ادراری, واکنش زنجیره ای پلیمرازBackground and ObjectivesCurrently, Escherichia coli is considered as one of the main causes of bacterial urinary tract infections. The aim of this study was evaluating the frequency of necrotizing factor type 1 (CNF1) and hemolysin (Hly) genes among E. coli strains isolated from hospitalized patients of Rouhani Hospital in Babol city.
Materials and MethodsIn this descriptive study, a total of 82 E. coli strains were evaluated. Thereafter, antibiogram test was performed and DNA of the bacteria was extracted and the frequency of CNF1 and Hly genes was determined by the help of polymerase chain reaction.
ResultsWith antibiotic susceptibility testing, resistance to Erythromycin and Imipenem was reported 59 (71.9%) and 0%, respectively. Also, the percentage of multi drug resistant strains was 31.7%. The frequency of CNF1 and Hly genes was reported as 28% and 32.9%, respectively.
ConclusionAccording to the results, the frequency of CNF1 and Hly genes among the studied strains was similar to some related studies
Keywords: Escherichia coli, Urinary tract infections, Polymerase chain reaction -
سابقه و هدفکلبسیلا پنومونیه به عنوان یکی از باکتری های پاتوژن فرصت طلب بیمارستانی شناخته می شود. شیوع مقاومت آنتی بیوتیکی، ظهور سویه های مقاوم به چند دارو و فاکتورهای ویرولانس متعدد سهم به سزایی در ایجاد عفونت های مختلف دارند. در این ارتباط، مطالعه حاضر با هدف تعیین فراوانی ژن های magA، fimH و rmpA در بین سویه های کلبسیلا پنومونیه جداشده از بیماران بستری در بیمارستان های شهرستان بابل انجام شد.مواد و روش هاطی مطالعه توصیفی- مقطعی حاضر، 65 سویه کلبسیلا پنومونیه جمع آوری گردید. در این پژوهش الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی به روش دیسک دیفیوژن انجام شد. پس از استخراج DNA به کمک کیت تجاری، درصد فراوانی ژن های magA، fimH و rmpA به روش PCR (Polymerase Chain Reaction) مورد ارزیابی قرار گرفت.یافته هااز بین سویه های مورد مطالعه، 42 ایزوله از بیمارستان روحانی و 23 مورد از بیمارستان شهید بهشتی جمع آوری گردیدند. در الگوی آنتی بیوگرام بیشترین مقاومت به اریترومایسین (5/61 درصد) و سفوتاکسیم (60 درصد) اختصاص داشت و کمترین مقاومت به ایمی پنم (0 درصد) و اوفلوکساسین (9/16 درصد) تعلق گرفت. علاوه براین، در روش مولکولی فراوانی ژن های fimH و rmpA به ترتیب 1/86 و 8/10 درصد گزارش گردید. شایان ذکر است که هیچ یک از سویه ها حامل ژن magA نبودند.نتیجه گیریبر مبنای نتایج می توان گفت که مقاومت آنتی بیوتیکی و سویه های دارای مقاومت چند دارویی در بین سویه های کلبسیلا پنومونیه رو به افزایش است. از سوی دیگر، وجود برخی از فاکتورهای ویرولانس می تواند نقش به سزایی را در ایجاد سویه های مقاوم ایفا کند.کلید واژگان: ژن های ویرولانس, کلبسیلا پنومونیه, مقاومت آنتی بیوتیکی, واکنش زنجیره پلیمرازBackground and ObjectiveKlebsiella pneumoniae is known as one of the opportunistic pathogens. The prevalence of antibiotic resistance, emergence of multidrug resistant strains, and multiple virulence factors contribute to the development of various infections. In this regard, the aim of this study was to evaluate the frequency of fimH, magA, and rmpA genes among Klebsiella pneumoniae isolates in hospitalized patients from Babol, Iran.Materials and MethodsIn this descriptive cross-sectional study, 65 Klebsiella pneumoniae strains were collected. In the present study, antibiotic resistance pattern was performed using disc diffusion method. After DNA extraction by a commercial kit, the frequency of magA, fimH, and rmpA genes was evaluated by polymerase chain reaction.ResultsA total of 65 strains was collected from Rouhani (n=42) and Shahid Beheshti (n=23) Hospitals. Based on the antibiogram pattern, the highest resistance rate belonged to erythromycin (61.5%) and cefotaxime (60%) and the lowest resistance rates belonged to imipenem (0%) and ofloxacin (16.9%). Furthermore, in the molecular method, the frequency of fimH and rmpA genes was reported 86.1% and 10.8%, respectively. It should be noted that none of the strains harbored the magA gene.ConclusionBased on the results of the present study, antibiotic resistance and multidrug resistance strains among Klebsiella pneumoniae strains are increasing. On the other hand, the presence of some virulence factors can play a significant role in the development of resistant strains.Keywords: Antibiotic Resistance, Klebsiella pneumoniae, Polymerase Chain Reaction, Virulence Genes
-
مجله دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی یزد، سال بیست و ششم شماره 5 (پیاپی 141، امرداد 1397)، صص 385 -392مقدمه
در دهه های اخیر شیوع سویه های کلبسیلا پنومونیه تولید کننده بتالاکتاماز در عفونت های بیمارستانی سهم به سزایی را به خود اختصاص داده است. هدف از انجام این مطالعه بررسی فراوانی برخی از تایپ های آنزیم CTX-M در بین ایزوله های بالینی کلبسیلا پنومونیه می باشد.
روش بررسیدر این مطالعه توصیفی- مقطعی سویه های کلبسیلا پنومونیه طی مدت 6 ماه از بخش آزمایشگاه بیمارستان های آموزشی شهر بابل ایزوله و جهت تائید به آزمایشگاه میکروب شناسی دانشگاه علوم پزشکی بابل ارجاع داده شدند. پس از تائید نهایی و بررسی الگوی آنتی بیوگرام درصد فراوانی سویه های دارای ژن CTX-M1 و CTX-M15 مورد ارزیابی و در نهایت نتایج توسط نرم افزار SPSS version 24 مورد آنالیز قرار گرفت.
نتایجدر طی یک مقطع شش ماهه در سال 1396، 65 سویه کلبسیلا پنومونیه به همراه اسینتوباکتر بومانی، اشرشیاکلی و سودوموناس آئروژینوزا از بخش آزمایشگاه بیمارستان های روحانی و شهید بهشتی جمع آوری گردید. در بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی به روش دیسک دیفیوژن، مقاومت به آموکسی سیلین (91%) ، سفوکسیتین (45%) و پیپراسیلین (45%) بیشترین و در مقابل آمیکاسین (24%) و ایمی پنم (0%) کمترین میزان را به خود اختصاص دادند. هم چنین درصد فراوانی ژن های CTX-M1 و CTX-M15 به ترتیب 62 درصد و 69 درصد به دست آمد.
نتیجه گیریبا توجه به شیوع بالای سویه های حاوی آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف و مقاومت آنتی بیوتیکی در بین سویه های کلبسیلا پنومونیه جدا شده از نمونه های بالینی و با توجه به این که در این مطالعه برای اولین بار درصد فراوانی ژن های مذکور در بیمارستان های آموزشی شهر بابل مورد ارزیابی قرار گرفت لذا اتخاذ رژیم های دارویی مناسب جهت کاهش مقاومت های آنتی بیوتیکی امری ضروری محسوب می گردد.
کلید واژگان: کلبسیلا پنومونیه, مقاومت آنتی بیوتیکی, ژن CTX-M, بتالاکتامازJournal of Shaeed Sdoughi University of Medical Sciences Yazd, Volume:26 Issue: 5, 2018, PP 385 -392IntroductionIn the recent decades, the prevalence of Klebsiella pneumoniae beta-lactamase producing strains has a significant role in nosocomial infections. The aim of this study was to determine the prevalence of different types of CTX-M enzymes among clinical isolates of K. pneumoniae.
MethodsIn this descriptive cross-sectional study, during six months, K. pneumoniae strains were isolated from laboratory ward of Babol educational hospitals and referred to microbiology laboratory of Babol University of Sciences for final confirmation. Thereafter, antibiogram pattern analysis and the frequency of CTX-M1 and CTX-M15 genes were evaluated. Finally, the results were analyzed by SPSS version 24 software.
ResultsDuring six months of this study in 2017, 65 K. pneumoniae and also other bacterial strains such as Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, and Acinetobacter baumannii were collected from laboratory ward of Shahid Beheshti and Ayatollah Rouhani Hospitals. By disc diffusion method, the highest resistance belonged to Amoxicillin (91%), Cefoxitin (45%), Piperacillin (45%) and the lowest belonged to Amikacin (24%) and Imipenem (0%). On the other hand, the percentage of CTX-M1 and CTX-M15 genes were also found to be 62% and 69%, respectively.
ConclusionRegarding to the high prevalence of strains containing broad-spectrum beta-lactamase enzymes and due to the antibiotic resistance among K. pneumoniae strains isolated from clinical specimens and also by considering this issue that the current study was the first research for evaluating the frequency of these genes in Babol educational hospitals therefore, it is necessary to adopt appropriate drug regimens to reduce antibiotic resistances
Keywords: Klebsiella pneumoniae, Antibiotic resistance, CTX-M gene, Beta-lactamase, PCR -
سابقه و هدفبا توجه به شیوع عفونت های بیمارستانی ناشی از باکتری کلبسیلا پنومونیه در بخش های مختلف مراکز درمانی و همچنین ظهور سویه های مقاوم به آنتی بیوتیک، بررسی فراوانی سویه های مقاوم به چند دارو و شناخت فاکتورهای بیماری زایی این باکتری، کمک شایانی به درمان عفونت های ناشی از آن خواهد نمود.مواد و روش هادر این مطالعه توصیفی- مقطعی طی 6 ماه با مراجعه به آزمایشگاه بیمارستان های روحانی و شهید بهشتی شهر بابل، سویه های کلبسیلا پنومونیه از نمونه های بالینی ایزوله گردید و به منظور تایید نهایی به آزمایشگاه میکروب شناسی دانشگاه علوم پزشکی بابل ارجاع داده شد. درادامه، تست مقاومت آنتی بیوتیکی به روش دیسک دیفیوژن برای بررسی میزان مقاومت به آنتی بیوتیک های آموکسی سیلین، اریترومایسین، سفوتاکسیم، جنتامایسین، سیپروفلوکساسین، پیپراسیلین، سفکسیم، آمیکاسین و ایمی پنم اجرا گردید. درانتها پس از استخراج DNA به کمک کیت تجاری، ژن های mrkD و kpn با استفاده از روش ملکولی PCR مورد ارزیابی قرار گرفت.یافته هادر مطالعه حاضر 60 سویه کلبسیلا پنومونیه طی مدت 6 ماه از نمونه های مختلف بالینی جداسازی گردید. در بررسی میزان مقاومت آنتی بیوتیکی به روش دیسک دیفیوژن، مقاومت به آموکسی سیلین و ایمی پنم با 4/95 و صفر درصد به ترتیب بیشترین و کمترین میزان را به خود اختصاص دادند. همچنین درصد فراوانی ژن های mrkD و kpn به ترتیب معادل 71 و 63 درصد به دست آمد.نتیجه گیریبا توجه به شیوع بالای مقاومت آنتی بیوتیکی در بین سویه های کلبسیلا پنومونیه و با توجه به این مطلب که در این مطالعه برای اولین بار درصد فراوانی ژن های ویرولانس مذکور در شهرستان بابل مورد ارزیابی قرار گرفت، استفاده از رژیم های درمانی مناسب جهت کاهش مقاومت های آنتی بیوتیکی امری ضروری محسوب می گردد.کلید واژگان: ژن های ویرولانس, کلبسیلا پنومونیه, مقاومت آنتی بیوتیکی, واکنش زنجیره پلیمرازBackground And ObjectiveAccording to the high incidence of Klebsiella pneumoniae nosocomial infections in different wards of health care units and the emergence of high levels of antibiotic resistance, evaluating the frequency of multi-drug resistant strains and recognizing the virulence factors may help treat the related infections.Materials And MethodsIn this descriptive cross-sectional study, by presenting to the laboratories of Rouhani and Shahid Beheshti hospitals of Babol (Iran) during six months, Klebsiella pneumoniae strains were isolated from clinical specimens and transferred to the microbiology laboratory of Babol University of Medical Sciences for confirmation. Afterwards, the antibiotic resistance pattern was identified by disc diffusion method for the following antibiotics: amoxicillin, erythromycin, cefotaxime, gentamicin, ciprofloxacin, piperacillin, cefixime, amikacin, and imipenem. Finally, after DNA purification by using a commercial kit, mrkD and Kpn genes were evaluated by PCR molecular test.ResultsSixty Klebsiella pneumoniae strains were isolated from different clinical specimens during six months. By using disc diffusion method, the highest (95.4%) and lowest (0%) resistance rates pertained to amoxicillin and imipenem, respectively. The frequencies of mrkD and Kpn genes were 71% and 63%, respectively.ConclusionDue to the high prevalence of antibiotic resistance among Klebsiella pneumoniae strains and considering that this is the first report of the mentioned genes in Babol, it is necessary to adopt appropriate therapeutic regimens to reduce antibiotic resistance.Keywords: Antibiotic Resistance, Klebsiella pneumoniae, Polymerase Chain Reaction, Virulence Genes
-
سابقه و هدفعفونت های ادراری ناشی از اشریشیاکلی از مهم ترین علل عفونت های بیمارستانی به شمار می روند. فاکتورهای ادهسینی از قبیل ژن های sfa و pap در اتصال باکتری به سلول های اپیتلیال و روند پاتوژنیسیته سهم بسرایی را ایفا می کنند. هدف از این مطالعه بررسی میزان شیوع ژن های مذکور در سویه های اشریشیاکلی جدا شده از بیماران بستری در بیمارستان روحانی شهر بابل می باشد.مواد و روش هادر این مطالعه مقطعی 70 سویه اشریشیاکلی از نمونه ادراری بیماران بستری در بیمارستان روحانی شهر بابل جدا و با استفاده از تست های افتراقی میکروب شناسی از قبیل کشت در محیط مک کانکی آگار، TSI، تست اکسیداز و غیره تایید گردید. در ادامه مقاومت آنتی بیوتیکی به روش دیسک دیفیوژن بررسی شد. سپس DNA باکتری استخراج و فراوانی ژن ها با روش مولکولی مورد ارزیابی قرار گرفت.یافته هادر این مطالعه مقاومت به اریترومایسین (65/7 درصد) و تریمتوپریم-سولفامتاکسازول (57 دصد) به ترتیب بیشترین درصد را به خود اختصاص داد. همچنین در صد فراوانی ژن هایsfa وpap به ترتیب 60 درصد و 27 درصد گزارش گردید.نتیجه گیرینتایج مطالعه نشان داد که ژن هایsfa و pap از فراوانی قابل توجهی برخوردار بوده و مقاومت آنتی بیوتیکی نیز نیار به توجه ویژه دارد.کلید واژگان: اشریشیاکلی, عفونت ادراری, مقاومت آنتی بیوتیکیBackground And ObjectiveEscherichia coli urinary tract infections are known as one of the most important nosocomial infections. Adhesion genes such as sfa and pap which are important in bacterial attachment and colonization in epithelial cells have a significant role in bacterial pathogenecity. The aim of this study was to investigate the frequency of mentioned genes among E. coli strains isolated from hospitalized patients of Rouhani hospital in Babol city.MethodsA total of 70 E. coli strains were isolated from urinary specimens of Rouhani hospitalized patients and then identified and confirmed with differential tests by using MacConkey agar, TSI, Oxidase test and etc. Thereafter, antimicrobial pattern were carried out by disk diffusion method. Finally the bacterial genomic DNA was extracted and the frequency of genes was determined by molecular method.
FINDINGS: In this study resistance to Erythromycin (65.7%) and Trimethoprim-sulfamethoxazole (57%) had the highest resistance ratio. On the other hand the frequency of sfa and pap genes was 60% and 27% respectively.ConclusionIn this study for the first time the frequency of both sfa and pap virulence factors of E. coli isolated strains from Rouhani hospitalized patients with urinary tract infection were evaluated.Keywords: Escherichia coli, Urinary Tract Infections, Antibiotic Resistance, PCR -
زمینه و هدفاستفاده گسترده از آنتی بیوتیک ها و ورود آنها به فاضلاب های پذیرنده منجر به افزایش باکتری های مقاوم به آنتی بیوتیک ها شده که اثرات منفی بر درمان عفونت های باکتریایی دارد. مقاومت آنتی بیوتیکی باکتری های اشریشیا کلی، کلبسیلا پنومونیه و سودوموناس آئروجینوزا در فاضلاب های شهری و بیمارستانی نسبت به آنتی بیوتیک های کلرامفنیکل، سیپروفلوکساسین، تری متوپریم سولفامتوکسازول، جنتامایسین، سفتیزوکسیم، نالیدیکسیک اسید، سفتازیدیم و سفالکسین مورد مطالعه قرار گرفت.روش بررسیطی یک مطالعه توصیفی مقطعی به دنبال جداسازی باکتری ها از فاضلاب بیمارستانی و شهری با استفاده از تکنیک های میکروبشناسی، حساسیت آنها با تکنیک استاندارد انتشار دیسک و تفسیر ناحیه انتشار با چارت کربی- بوئر، سنجیده شد. اختلاف آماری بین مقاومت آنتی بیوتیکی در فاضلاب شهری و بیمارستانی با استفاده از تست ناپارامتریک Mann-Whitney مورد بررسی قرار گرفت.یافته هادرصد مقاومت باکتری اشریشیا کولای نسبت به آنتی بیوتیک ها بین 81/1% تا 02/51% تعیین شد که نسبت به سودوموناس آئروجینوزا (بین 57/3% تا 76/61%) و کلبسیلا پنومونیه (بین 45/6% تا 831/9%) کمتر است. باکتری کلبسیلا پنومونیه بیشترین مقاومت را در مقایسه با بقیه نشان داد. باکتری های اشریشیا کلی، کلبسیلا پنومونیه و سودوموناس آئروجینوزا به ترتیب بیشترین مقاومت را نسبت به سفتازیدیم، تری متوپریم سولفامتوکسازول و سفالکسین نشان دادند. مشخص شد که میزان بروز مقاومت دارویی در فاضلاب بیمارستانی بیشتر از فاضلاب های شهری است.نتیجه گیریبا دسترسی آسان به آنتی بیوتیک ها و استفاده بی رویه آنها طیف وسیعی از آنها به فاضلاب ها راه یافته و از توانایی آنها در درمان عفونت های باکتریایی کاسته شده است. بالاتر بودن غلظت و تنوع آنتی بیوتیک ها در فاضلاب های بیمارستانی در مقایسه با شهری منجر به افزایش انتقال عوامل مقاوم بین باکتری ها شده و مقاومت چندگانه تسریع می گردد.
کلید واژگان: مقاومت آنتی بیوتیکی, فاضلاب شهری, فاضلاب بیمارستانیBackground And Objectiveswidely use of antibiotics as therapy and uncontrolled discharge of them to receiving waters increased the percentages of antibiotic resistant bacteria in various environments that may cause problems in therapy. The aim of this study was to investigate the antibiotic resistance of E. coli, K. pneumoniae and P. aeruginosa bacteria isolated from urban and hospital wastewaters. Nine antibiotics namely Chloramphenicol, Ciprofloxacin, Trimethoprim Sulfamethoxazol, Gentamycin, Ceftizoxime, Nalidixic Acid, Ceftazidime, Ceftriaxon and Cefalexin were investigated in this study.Materials And Methodsthrough a cross-sectional descriptive study the isolation of bacteria from hospital and urban wastewater samples was performed by microbiological identification techniques. The resistance to nine antibiotics was tested by application of the standard disc diffusion technique and zone-size interpretation chart of Kirby-Baeur. Non-parametric Mann-Whitney test was used to assessing two environments differences.ResultsThe resistance percentage of E. coli to studied antibiotics was significantly less (ranged from 1.81 to 51.02%) than the resistance percentage of P. aeroginosa (ranged from 3.57 to 61.76) and K. pneumoniae (ranged from 6.45 to 91.83%). the highest resistance to studied antibiotics was for K. pneumonia in comparison the others. E. coli, K. pneumonia and P. aeroginosa bacteria showed the highest resistance to CAZ, SXT and CN, respectively. The study showed the resistance rate in hospital wastewater is more than that in urban wastewater.ConclusionReady availability and uncontrolled usage of antibiotics causes to discharge them to wastewaters and consequently diminished the drugs effectiveness. High antibiotic concentration and diversity in hospital wastewater in comparison with urban wastewater causes to transfer resistant agents between bacteria and increased the multiple resistances.
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.